polyatomiske ioner er ioner, der består af mere end et atom. For eksempel indeholder nitration, NO3-, et nitrogenatom og tre iltatomer. Atomerne i en polyatomisk ion er normalt kovalent bundet til hinanden og forbliver derfor sammen som en enkelt, ladet enhed.
artikel 1 . Kationen er skrevet først i navnet; anionen er skrevet andet i navnet.
artikel 2 . Når formelenheden indeholder to eller flere af den samme polyatomiske ion, skrives denne ion i parentes med abonnementet skrevet uden for parenteserne.

Bemærk: parenteser og et abonnement anvendes ikke, medmindre mere end en af en polyatomisk ion er til stede i formelenheden (f.eks. er formelenheden for calciumsulfat “CaSO4” ikke “Ca(SO4)”).

regel 3. Hvis kationen er en metalion med en fast ladning, er navnet på kationen det samme som det (neutrale) element, hvorfra det er afledt (f.eks. Na+ = “natrium”). Hvis kationen er en metalion med en variabel ladning, angives ladningen på kationen ved hjælp af et romertal i parentes umiddelbart efter navnet på kationen (f.eks. Fe3+ = “jern(III)”).
artikel 4 . Hvis anionen er en monatomisk ion, navngives anionen ved at tilføje suffikset-ide til roden af elementnavnet (f.eks. I- = “iodid”).Bemærk: græske præfikser bruges ikke til at angive antallet af atomer eller polyatomiske ioner i formelenheden for forbindelsen (f.eks. Ca(NO3)2 hedder “calciumnitrat” ikke “calciuimdinitrat”).