Az endoszkópos ellenőrzés illetve kezelés a gyomor-bélrendszeri betegség, fontos, hogy a betegek elfogadja az ismételt vizsgálat. Kevésbé valószínű, hogy ezt teszik, ha az eljárást szorongónak vagy kényelmetlennek tartják, mint valószínű, ha csak helyi érzéstelenítéssel végzik. A tudatos szedáció célja egy enyhén altatott beteg, aki ébren van, igény szerint együttműködik, amnéziás, és mentes a szorongástól és a félelemtől. Különböző gyógyszerek alacsony dózisokban alkalmazhatók ezeknek a kritériumoknak a teljesítésére. Ezek közé tartoznak a fenotiazinok, butirofenonok, barbiturát és nem barbiturát hipnotikumok, benzodiazepinek, valamint a Hypno-fájdalomcsillapító, ketamin. Mivel a benzodiazepinek mind nyugtató, mind mély amnéziás, mind anxiolitikus hatásokat kínálnak, ezeket a gyógyszereket világszerte tudatos szedációra használják. A diazepám a szedáció “arany standardja” volt, de a modernebb benzodiazepineket, különösen a midazolámot ma már gyakrabban használják. Általában a benzodiazepinek széles terápiás tartományt mutatnak. A dózisnak megfelelően azonban a szedatív gyógyszerek mellékhatásokat, például álmosságot, vérnyomáscsökkenést és légzésdepressziót okozhatnak. Ezen kívül egyesek szélesebb körű mellékhatásokat válthatnak ki, például hisztamin felszabadulást és anafilaxiás reakciókat, thrombophlebitiset és injekciós fájdalmat. Helyi érzéstelenítőkkel, hipnotikumokkal és opioidokkal kombinálva súlyos Gyógyszerkölcsönhatások léphetnek fel. Idősebb betegeknél alacsonyabb dózisok szükségesek a szedációhoz. A hemodinamikai és légzőszervi mellékhatások elkerülése érdekében a szedatív gyógyszereket lassan kell beadni.