Les ions polyatomiques sont des ions constitués de plus d’un atome. Par exemple, l’ion nitrate, NO3-, contient un atome d’azote et trois atomes d’oxygène. Les atomes d’un ion polyatomique sont généralement liés de manière covalente les uns aux autres et restent donc ensemble en une seule unité chargée.
Règle 1. Le cation est écrit en premier dans le nom; l’anion est écrit en second dans le nom.
Règle 2. Lorsque l’unité de formule contient deux ou plusieurs du même ion polyatomique, cet ion est écrit entre parenthèses avec l’indice écrit en dehors des parenthèses.

Remarque: les parenthèses et un indice ne sont pas utilisés à moins que plus d’un ion polyatomique soit présent dans l’unité de formule (par exemple, l’unité de formule pour le sulfate de calcium est « CaSO4 » et non « Ca(SO4) »).

Règle 3. Si le cation est un ion métallique avec une charge fixe, le nom du cation est le même que l’élément (neutre) dont il est dérivé (par exemple, Na + = « sodium »). Si le cation est un ion métallique avec une charge variable, la charge sur le cation est indiquée à l’aide d’un chiffre romain, entre parenthèses, immédiatement après le nom du cation (par exemple, Fe3+ = « fer (III) »).
Règle 4. Si l’anion est un ion monatomique, l’anion est nommé en ajoutant le suffixe -id à la racine du nom de l’élément (par exemple, I- = « iodure »).
Remarque: Les préfixes grecs ne sont pas utilisés pour indiquer le nombre d’atomes, ou d’ions polyatomiques, dans l’unité de formule du composé (par exemple, Ca(NO3)2 est nommé « nitrate de calcium » et non « dinitrate de calciuim »).