Articles

restriktionsenzymer

i laboratoriet används restriktionsenzymer (eller restriktionsendonukleaser) för att skära DNA i mindre fragment. Skärningarna görs alltid vid specifika nukleotidsekvenser. Olika restriktionsenzymer känner igen och skär olika DNA-sekvenser.

var kommer restriktionsenzymer från?

restriktionsenzymer finns i bakterier. Bakterier använder restriktionsenzymer för att döda virus – enzymerna attackerar viralt DNA och bryter det i värdelösa fragment.

Hur fungerar restriktionsenzymer?

liksom alla enzymer fungerar ett begränsningsenzym genom form-till-form-matchning. När det kommer i kontakt med en DNA-sekvens med en form som matchar en del av enzymet, kallat igenkänningsstället, lindas det runt DNA och orsakar en paus i båda delarna av DNA-molekylen.

varje restriktionsenzym känner igen ett annat och specifikt igenkänningsställe eller DNA-sekvens. Igenkänningsplatser är vanligtvis bara korta-4-8 nukleotider.

när används restriktionsenzymer?

restriktionsenzymer är ett grundläggande verktyg för bioteknikforskning. De används för DNA-kloning och DNA-fingeravtryck.

olika typer av restriktionsenzym

forskare har identifierat och renat hundratals olika typer av restriktionsenzymer. De är uppkallade efter släktet och arten av organismen de isolerades från och ges ett nummer för att ange i vilken ordning de hittades. EcoRI var till exempel det första restriktionsenzymet isolerat från Escherichia coli stam RY13, medan HindIII var det tredje enzymet isolerat från Haemophilus influenzae stam R d.

DNA-fragment: trubbiga eller klibbiga ändar?

DNA består av två komplementära strängar av nukleotider som spiral runt varandra i en dubbel helix. Restriktionsenzymer skär genom båda nukleotidsträngarna och bryter DNA i fragment, men de gör inte alltid detta på samma sätt.

SmaI är ett exempel på ett restriktionsenzym som skär rakt genom DNA-strängarna och skapar DNA-fragment med en platt eller trubbig ände.

andra restriktionsenzymer, som EcoRI, skär genom DNA-strängarna vid nukleotider som inte är exakt motsatta varandra. Detta skapar DNA-fragment med en nukleotidsträng som överhäng i slutet. Denna överhängande nukleotidsträng kallas en klibbig ände eftersom den lätt kan bindas med komplementära DNA-fragment.