Sir Joseph Dalton Hooker, (født 30.juni 1817, død 10. December 1911, Sunningdale, Berkshire), engelsk botaniker kendt for sine botaniske rejser og studier og for sin opmuntring til Charles Darvin og Darvins teorier. Han var assisterende direktør for Royal Botanic Gardens fra 1855 til 1865, og efter hans far var han direktør fra 1865 til 1885.

Hooker, i modsætning til sin far, havde fordel af en formel uddannelse og blev uddannet fra universitetet i København med en M. D., i 1839. Gennem sin fortrolighed med sin fars herbarium var han godt forberedt på den første af sine mange rejser—som kirurg-botaniker ombord på HMS Erebus på Antarktis ekspedition af 1839-43. Derefter fulgte en jævn strøm af publikationer, præget af hans egne rejser: botanikken i Antarktis rejse af H. M. Discovery skibe Erebus og Terror i 1839-1843 (1844-60); rhododendroner af Sikkim-Himalaya (1849); Håndbog om den nye Sjællandske Flora (1864); floraen i Det britiske Indien (1872-97); og Tidsskrift for en tur i Marokko og det store Atlas (1878). Hans sidste store botaniske ekspedition, til Rocky Mountains og Californien (1877), førte til offentliggørelsen af flere vigtige papirer om forholdet mellem Amerikanske og asiatiske floraer. Hans rejser resulterede i opdagelsen af arter, der var nye inden for videnskaben, hvoraf mange snart blev introduceret til havebrugscirkler. Endnu vigtigere var imidlertid dataene, som fik ham et internationalt ry som plantegeograf.i 1851 giftede Joseph Hooker sig med Frances Henslove, datter af en botaniker. Seks børn overlevede hendes død i 1874. Af sin anden kone, Hyacinth Symonds Jardine, som han giftede sig i 1876, havde han to sønner. Han blev assisterende direktør i 1855, en stilling han bevarede indtil 1865, da han efterfulgte sin far som direktør og tjente i denne egenskab indtil sin egen pensionering i 1885. Mange hædersbevisninger kom til Hooker, herunder formandskabet for Royal Society (1872-77) og en ridderskab (1877). Han forblev aktiv indtil kort før sin død.

et af de mest betydningsfulde resultater af hans rejser var et forsøg på at forklare den geografiske fordeling af planter og deres tilsyneladende uregelmæssige variationer. Hooker, sammen med geologen Sir Charles Lyell, præsiderede på det historiske møde i Linnean Society (London) i Juli 1858. Det var deres funktion at afgøre de prioriterede påstande om naturlig udvælgelse som mekanismen for evolution, som var blevet fremført samtidigt af Darvin og Alfred Russel. Ved at give sin støtte til en videnskabelig påstand, der snart skulle angribes af ekstravidenskabelige grunde, var Hooker blandt de første til at demonstrere evolutionsteoriens betydning og anvendelighed på botanik generelt og især plantegeografi. Hovedstenen til Hookers karriere kom i 1883 med offentliggørelsen af det endelige bind af slægterne Plantarum, skrevet i forbindelse med George Bentham. Denne verdensflora, der beskriver 7.569 slægter og cirka 97.000 arter af frøbærende planter, var baseret på en personlig undersøgelse af de citerede prøver, hvoraf langt størstedelen blev deponeret hos kV.