skąd biorą się enzymy restrykcyjne?

enzymy restrykcyjne znajdują się w bakteriach. Bakterie wykorzystują enzymy restrykcyjne do zabijania wirusów – enzymy atakują wirusowe DNA i rozbijają je na bezużyteczne fragmenty.

jak działają enzymy restrykcyjne?

podobnie jak wszystkie enzymy, enzym restrykcyjny działa poprzez dopasowanie kształtu do kształtu. Kiedy wchodzi w kontakt z sekwencją DNA o kształcie dopasowanym do części enzymu, zwanej miejscem rozpoznawania, owija się wokół DNA i powoduje pęknięcie w obu nici cząsteczki DNA.

każdy enzym restrykcyjny rozpoznaje inne i specyficzne miejsce rozpoznania, czyli sekwencję DNA. Miejsca rozpoznania są zwykle tylko krótkie – 4-8 nukleotydów.

kiedy stosuje się enzymy restrykcyjne?

enzymy restrykcyjne są podstawowym narzędziem badań biotechnologicznych. Są one wykorzystywane do klonowania DNA i dna fingerprinting.

różne rodzaje enzymów restrykcyjnych

naukowcy zidentyfikowali i oczyścili setki różnych rodzajów enzymów restrykcyjnych. Są one nazwane od rodzaju i gatunku organizmu, z którego zostały wyizolowane i otrzymują numer wskazujący kolejność, w jakiej zostały znalezione. Na przykład EcoRI był pierwszym enzymem restrykcyjnym wyizolowanym ze szczepu Escherichia coli RY13, podczas gdy HindIII był trzecim enzymem wyizolowanym ze szczepu Haemophilus influenzae Rd.

fragmenty DNA: tępe czy lepkie końce?

DNA składa się z dwóch komplementarnych nici nukleotydów, które spiralują wokół siebie w podwójną helisę. Enzymy restrykcyjne przecinają obie nici nukleotydów, rozbijając DNA na fragmenty, ale nie zawsze robią to w ten sam sposób.

SmaI jest przykładem enzymu restrykcyjnego, który przecina proste nici DNA, tworząc fragmenty DNA o płaskim lub tępym końcu.

inne enzymy restrykcyjne, takie jak EcoRI, przecinają nici DNA w nukleotydach, które nie są dokładnie naprzeciwko siebie. Tworzy to fragmenty DNA z jedną nicią nukleotydową, która zwisa na końcu. Ta zwisająca nić nukleotydowa nazywana jest lepkim końcem, ponieważ może łatwo wiązać się z komplementarnymi fragmentami DNA.