Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas Aprameya IV – J Acad Clin Microbiol
EDITORIAL
Year : 2013 | Volume : 15 | Issue : 2 | Page : 59-61
Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka, India
| Date of Web Publication | 7-Jan-2014 |
Correspondence Address:
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka
India
Source of Support: None, Conflict of Interest: None
DOI: 10.4103/0972-1282.124588
How to cite this article:
Aprameya IV. Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013;15:59-61
How to cite this URL:
Aprameya IV. Ikke-fermenterende gramnegative baciller (Nfgnb) bortset fra Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013; 15: 59-61. Tilgængelig fra: https://www.jacmjournal.org/text.asp?2013/15/2/59/124588
| introduktion |  |
ikke-fermentorer er en heterogen gruppe af gramnegative baciller, der er aerobe, ikke-sporende, enten bruger ikke kulhydrater som energikilde eller nedbryder dem gennem andre metaboliske veje end gæring. Da de var allestedsnærværende i naturen, blev de ignoreret som sandsynlige forurenende stoffer, når de blev isoleret i laboratoriet. Imidlertid er de nu opstået som vigtige sundhedsrelaterede patogener, da de har lavet deres niche i hospitalsmiljøet. Nye udfordringer med multi-lægemiddelresistens, både iboende og erhvervet blandt dem, er af alvorlig bekymring for den behandlende læge.
ikke-fermentorer tegner sig for 15% af alle bakterieisolater fra et klinisk mikrobiologisk laboratorium. Offentliggjorte undersøgelser fra forskellige centre citerer forskellige isoleringshastigheder for ikke-fermentorer, der spænder fra 2,18% til 45,9%. taksonomisk forvirring hersker, da der er en kontinuerlig revision, og mange af de identificerede stammer har ingen udpegede arter tildelt. Dette forstærkes af de faktorer, der bidrager til vanskelighederne med at identificere dem i det rutinemæssige kliniske mikrobiologilaboratorium. De fleste arter findes sjældent, og derfor er laboratoriepersonalet muligvis ikke bekendt med mange af de ikke-fermentorer. Mange af de konventionelle kulturmedier er ikke egnede til identifikation, og kvalitetskontrol af medier kan være vanskelig. Mange arter vokser langsomt og biokemisk svage eller inerte og kræver betydelig erfaring for at fortolke tvetydige resultater. Kommercielle kit-systemer, der er tilgængelige til brug, er ikke kun dyre, men har ofte også lav nøjagtighed til identifikation af visse stammer.
de fleste kliniske mikrobiologilaboratorier er hovedsageligt afhængige af de fænotypiske metoder til identifikation. Disse kan omfatte manuelle eller kommercielle sæt / automatiserede identifikationssystemer, såsom API 20ne, Remel N/f, Vitek 2, Microscan gangbro, Sensititre AP80-systemet, Føniks-systemet. undersøgelser, der undersøger effektiviteten af det kommercielle identifikationssystem, har imidlertid vist modstridende resultater. Identifikation ved konventionelle fænotypiske metoder kan være vanskelig og tidskrævende. Molekylære identifikationsteknikker dukker op som alternativ til fænotypiske identifikationsmetoder. Blandt disse er 16S rRNA-gensekventering og DNA-array (oligonukleotid array) teknik, der er blevet beskrevet som pålidelig og hurtig metode til identifikation af klinisk signifikant ikke-fermenterende gramnegative baciller (NFGNB).
listen over NFGNB er uendelig og uden for rammerne af denne artikel. Få almindeligt forekommende klinisk vigtige ikke-fermentorer bortset fra Pseudomonas er højt oplyste i denne artikel.
| Genus Acinetobacter | |
som det fremgår af vores data i den særlige artikel i dette nummer og de fleste andre undersøgelser, er den mest almindelige ikke-Pseudomonas ikke-fermenter, der er genvundet fra kliniske prøver, Acinetobacter. Denne slægt omfatter gramnegative coccobacilli, der er ikke-bevægelige, oksidase negative og resistente over for penicillin. Mere end 25 genomospecier er blevet genkendt ved DNA-DNA-hybridisering inden for slægten, og syv har fået formelt artsnavn. Blandt disse er arter Acinetobacter calcoaceticus, A. baumannii, Acinetobacter genomic arter 3 og Acinetobacter genomic arter 13tu, der har et ekstremt tæt forhold og er vanskelige at skelne fra hinanden ved fænotypiske tests alene. De er blevet grupperet som Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii kompleks.
A. baumannii er saccharolytisk, syrner de fleste kulhydrater og demonstrerer den hurtige produktion af syre fra 1% og 10% lactose. Disse funktioner kan bruges til deres formodede identifikation i det rutinemæssige diagnostiske laboratorium. A. baumannii-komplekset tegner sig for 80% af de kliniske infektioner forårsaget af Acinetobacter-arter og inkluderer lungebetændelse, bakteriæmi, meningitis, urinvejsinfektion (UTI) og sårinfektioner, hvoraf de fleste er erhvervet på hospitalet. ,
Acinetobacters har vist sig som de mest succesrige patogener ved deres evne til at overleve og fortsætte i hospitalsmiljøet i længere perioder både på tørre og fugtige overflader. Dette understøttes af deres evne til at vokse ved en række forskellige temperaturer og pH, hvilket bidrager til udviklingen og vedvarende udbrud. Sammensætningen af dette problem er deres evne til at producere biofilm på overfladen af medicinsk udstyr.
flere resistensmekanismer findes i denne organisme, der har bidraget til fremkomsten af multidrug og pan-lægemiddelresistens, hvilket forårsager en alvorlig bekymring for den behandlende læge. ,
interessant nok er der i en undersøgelse af en epidemisk multidrugresistent Acinetobacter-stamme i Frankrig rapporteret om en stor genomisk resistent ø indeholdende 45 resistente gener, der er erhvervet fra andre gramnegative baciller. Antibiotisk følsomhedstest for Acinetobacter-arter er problematisk, og resultater opnået ved anvendelse af standardiseret mikrobrotfortynding stemmer ikke overens med resultaterne opnået ved standarddiffusionsmetode, især for beta lactam-og beta lactam-hæmmerkombination. Clinical and laboratory standards institute (CLSI) definerer ikke retningslinjerne for diskdiffusionstest og fortolkning for nyere antibiotika som tigecyclin og Colistin.
| Genus Burkholderia | |
Burkholderia cepacia (B. cepacia)
et fytopatogen, B. cepacia er opstået som en årsag til opportunistisk infektion, især hos patienter med kronisk granulomatøs sygdom og cystisk fibrose. taksonomiske undersøgelser har vist, at B. cepacia faktisk er en klynge af mindst ni nært beslægtede genomovarer. De er oftest forbundet med epidemier af ‘Cepacia syndrom’ manifesteret af svær progressiv respirationssvigt og bakteriæmi. B. cepacia-komplekset er blevet isoleret fra adskillige vandkilder og våde overflader, herunder vaskemiddelopløsninger og IV-væsker. Hospital out break på grund af almindelig kildeforurening af medicinsk udstyr såsom forstøvningsmidler, desinfektionsmidler og blodgasanalysatorer er rapporteret. identifikation af B. cepacia i det kliniske laboratorium kan være problematisk, fordi det ikke er en enkelt fænotype. Kommercielle identifikationssystemer fungerer dårligt.
primær kultur fra kliniske prøver kan udføres på selektive medier såsom B. cepacia selektiv agar eller fermenteringsfermentering polymyksin bacitricin lactoseagar (OFPBL-agar) inkuberet ved 35 cl i 48 timer. Kolonier forekommer gule på grund af laktoseudnyttelse. Isolatet er svagt oksidasepositivt, hydrolyserer lysin og er resistent over for Polymyksin B og aminoglycosider, men følsomt over for Co-trimoksol.
behandling af valg er Co-trimoksol. CLSI foreslår in vitro-test for Ceftasidim, Meropenem, minocyclin (tetracyclin) og ceftasol.
Burkholderia pseudomallei (B.pseudomallei)
et årsagsmiddel til Melioidose, B. pseudomallei er et faregruppe 3-patogen, og laboratoriearbejderens sikkerhed er af største bekymring under håndtering af denne organisme.
B. pseudomallei bør overvejes hos patienter med lungebetændelse, sepsis eller abscess med en rejsehistorie til Sydøstasien eller det nordlige Australien. Organismen er ikke vanskelig at isolere i rutinemæssige medier. Imidlertid kan variation i kolonimorfologi ses. Det kan vokse ved 42 kg C. Gram-farvede udstrygninger fra kliniske prøver viser et bipolært farvningsmønster. Isolering af organismen fra ikke-sterile steder kræver anvendelse af et selektivt medium, askens medium, der viser ru rynkede violette eller lilla kolonier efter 48 timer. Positive motile gramnegative baciller, der kan identificeres ved dets karakteristiske antibiogram, der viser konstitutiv resistens over for Polymyksin og Gentamicin, men følsomme over for Co-Amoksiklavulansyre, tetracyclin og Chloramphenicol. Kommercielle kits identificerer godt, hvoraf API 20ne er den bedst validerede.
Stenotrophomonas maltophilia
Det er den tredje mest almindeligt forekommende ikke-fermenter i klinisk praksis. Da det er allestedsnærværende, kan det kolonisere luftvejene hos indlagte patienter og forårsage nosokomiale infektioner såsom CRBSI (kateterassocierede blodstrøminfektioner) og lungebetændelse, især hos patienter med hæmatologisk malignitet.
det producerer lysegule til lavendelgrønne kolonier på blodagar. Det er en af de mest almindelige årsager til, at en person er i stand til at bestemme, om han eller hun er i stand til at bestemme, om han eller hun er i stand til at bestemme, om han eller hun er i stand til at bestemme, om han eller hun er i stand til at bestemme, om han eller hun er i stand til at bestemme, om han eller hun er i stand til at bestemme, om han eller hun er i stand til at bestemme, om han eller hun vil være i stand til at gøre det. Det er en stærk maltoseoknidisator, der er lysin-og Dnaasepositiv. De fleste kommercielle kits er i stand til at identificere denne organisme.
man skal dog være forsigtig, mens man læser og fortolker antibiotikasensitivitetstestene. Efterfølgende endepunkter er blevet observeret i agarfortyndings-og bouillonfortyndingstest, og der er forekommet falsk følsomme aflæsninger med diskdiffusionstest for Gentamicin og Ciprofloksacin. Tilsvarende har undersøgelser, der bruger E-test, bemærket tilstedeværelsen af små mikrokolonier eller en tåge af gennemskinnelig vækst inden for inhiberingsområdet, hvilket, hvis det savnes, kan føre til falsk følsomt resultat.
CLSI foreslår følgende antibiotika, der skal testes for Stenotrophomonas maltophilia. Det er en af de mest almindelige typer medicin, der anvendes til behandling af sygdomme. Mic ved bouillonfortynding anbefales til test af Ceftasidim, Chloramphenicol og Ticarcillin, da diskdiffusionsmetoden er upålidelig.
Chryseobacterium meningosepticum (elisabethkingia meningosepticum)
selvom det er sjældent, er det vigtigt at identificere denne organisme, da det kan forårsage udbrud i børnehaveenheder og er forbundet med høj dødelighed (50%). En jordsaprofyt, det kan forurene patientplejeartikler, der resulterer i neonatal meningitis eller sepsis.
organismen producerer lysegule pigmenterede kolonier på blodagar, hvilket kan tage mere end 24 timer at vokse. Det er en ikke-bevægelig, Gram-negativ stang, det vil sige oksidasepositiv, indolpositiv, hydrolyserer aesculin og gelatine og demonstrerer en positiv ONPG-test. Det er en af de mest almindelige årsager til denne sygdom. ,
denne organisme har to typer beta-lactamaser: udvidede spektrum beta lacatamaser (ESBL) og metallo beta lactamaser (MBLs), der giver resistens over for cephalosporiner og carbapenemer. Derfor kan antibiotika, der anvendes til behandling af gramnegativ infektion, ikke anvendes til behandling af Chryseobacteriuminfektioner. Mics for Vancomycin på klinisk signifikante isolater skal udføres. Diskdiffusionstest er upålidelige.
| konklusion | |
alle kliniske mikrobiologiske laboratorier skal være gearet til nøjagtigt at identificere de ikke-fermentorer, og et isolats kliniske betydning skal bestemmes fra sag til sag. Præcis identifikation er vigtig for optimal patienthåndtering, prognose og passende infektionskontrolintervention. Den type identifikationssystem, der anvendes af laboratoriet, bør overlades til den kliniske mikrobiologs skøn. Det er dog vigtigt at sikre, at systemernes kvalitet og ydeevne valideres med jævne mellemrum.
|
Samanta p, Gautam v, Thapar r, Ray P. Emerging modstand af ikke-fermenterende gramnegative baciller i et tertiært plejecenter. Indisk J Pathol Microbiol 2011; 54:666-7.   |
|
| Deepak J, Rajat P, Shamanth AS, Munesh S, Vikrant N, Neelam S. prævalens af ikke-fermenterende gramnegative baciller og deres In vitro-Følsomhedsmønster på et tertiært plejehospital i Uttarakhand: en undersøgelse fra foot hills i Himalaya. SJHS 2013; 2:108-12.
|
|
| Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Issued by the Standards Unit, Microbiology Services Division, HPA Bacteriology. Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Identification/ID17/Issue 2.1/Oct 2011:1-20.
|
|
| Koneman EW. The non fermentative gram negative bacilli. In: Farveatlas og lærebog om diagnostisk Mikrobiologi. Lippincott og Thomas. 6. udgave; 2006. s. 303-76.
|
|
| Su SC, Vanceechoutte M, Dijkshoom L, Vi YF, Leichen Y, Chang TC. Identifikation af ikke-fermenterende gramnegative bakterier af klinisk betydning ved hjælp af et olignonukleotidarray. J Med Microbiol 2009; 58: 596-605.
|
|
| Manchand V, Sanchaita S, Suk NP. Multidrug resistant acinetobacter. J Glob Infect Dis 2010;2:291-304.
|
|
| Lee HW, Koh YM, Kim J, Lee JC, Lee JC, Seol SY, et al. Capacity of multidrug resistant clinical isolates of Acinetobacter baumannii to form biofilm and adhere to epithelial cell surfaces. Clin Microbiol Infect 2008;14:49-54. |
|
| Singh NT, Singh M, Sharma M. Emergence of tigecycline and colistin resistant Acinetobacter baumanii in patients with complicated urinary tract infections in north India. Indian J Med Res 2011;133:681-4. |
|
| Maragakis LL, Perl TM. Acinetobacter baumannii: Epidemiology, antimicrobial resistance, and treatment options. Clin Infect Dis 2008;46:1254-63. |
|
| CLSI. Præstationsstandarder for antimikrobiel følsomhedstest; treogtyvende Informationstilskud. Clin Lab Stand Inst 2013; 33: 66-8.
|
|
| Hung PP, Lin YH, Lin CF, Liu MF, Shi. Chryseobacterium meningosepticum infektion: antibiotisk modtagelighed og risikofaktorer for dødelighed. J Microbiol Immunol Inficere 2008; 41:137-44. |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
Leave a Reply