La classificazione degli organismi viventi è indicata come tassonomia e mira a classificare gli organismi viventi differenziandoli e stabilendo relazioni tra gruppi di organismi.

Il regno degli organismi viventi è stato definito come dominio da Carl R. Woese nel 1978.Gli organismi sono raggruppati in tre sistemi di dominio e cioè eukarya, archaea e batteri, principalmente sulla base del tipo cellulare. Oltre al tipo di cellula, le differenze di rRNA, i tre domini differiscono nella struttura lipidica della membrana, nelle molecole di RNA di trasferimento e nella sensibilità agli antibiotici rappresentano anche la classificazione degli organismi.

• Il Dominio batteri comprende tutti i procarioti patogeni e non patogenicihanno una parete cellulare composta da peptidoglicano e acido muramico. Hanno anche lipidi di membrana con acidi grassi legati all’estere e incatenati direttamente che assomigliano ai lipidi di membrana eucariotica. I batteri hanno anche plasmidi, che sono piccole dnamolecole a doppio filamento che sono extracromosomiali.
• Il dominio archaea comprende tre gruppi principali: metanogeni, alofili estremi e ipertermofili. Mancano di acido muramico nelle pareti cellulari.
• Eucarioti include eucariotica organismsas animali, piante, funghi, e protistsand hanno definito il nucleo e la membrana associati a organelli

La classificazione tassonomica schema per i procarioti è elaborato in Bergey Manuale Sistematico di Batteriologia che descrive la classificazione dei procarioti in due domini: Batteri e Archaea.

Ulteriore classificazione del dominio è come indicato di seguito-

• Dominio
• Regno
• Phyla
• Classe
• Ordine
• Famiglia
• Genere
• Specie

Il binomio scientifico) nomenclatura assegna ad ogni microbo 2 nomi – Genere – sostantivo, sempre in maiuscolo e in specie di aggettivo–, minuscolo. Entrambi sono scritti in corsivo o sottolineati. Ex. Staphylococcus aureus (S. aureus), Escherichia coli (E. coli)

Il gruppo tassonomico di base nella tassonomia microbica è la specie. I tassonomisti che lavorano con organismi superiori definiscono le loro specie in modo diverso rispetto ai microbiologi. Le specie procariotiche sono caratterizzate da differenze nel loro fenotipo egenotipo. Il fenotipo è la raccolta di caratteristiche visibili e il comportamento di un microrganismo. Il genotipo è il corredo genetico di un microrganismo

Bergey Manuale fornisce uno schema di classificazione per i batteri, nonché un riferimento per l’identificazione di diversi batteri in laboratorio. Secondo il manuale di batteriologia determinativa di Bergey, i batteri sono identificati sulla base di caratteristiche morfologiche colorazione, test biochimici, sierologia, contenuto G-C, prove di DNA e diversi test molecolari. Oltre alle proprietà elencate in Bergey’s, la fonte e l’habitat dei microrganismi sono anche importanti da considerare quando si identificano i microrganismi.

Punti da ricordare:

1. La tassonomia è la scienza che si occupa della classificazione degli organismi viventi sulla base di caratteristiche simili e diverse da altri organismie che stabiliscono relazioni tra gruppi di organismi.
2. Tutti gli organismi viventi sono raggruppati in tre sistemi di dominio, vale a dire eukarya, archaea e batteri, principalmente sulla base del tipo cellulare.
3. Lo schema di classificazione tassonomica dei procarioti è elaborato nel Manual of Systematic Bacteriology di Bergey secondo cui i procarioti sono divisi in due domini: Batteri e Archaea