Articles

Allelfrekvens

by admin

de faktiske frekvensberegninger afhænger af artens ploidi for autosomale gener.

MonoploidsEdit

frekvensen (p) af en allel A er fraktionen af antallet af kopier (i) Af a-allelen og populationen eller prøvestørrelsen (N), så

p = i / n . {\displaystyle p=i / N.}

{\displaystyle p=i / N.}

DiploidsEdit

Hvis f ( A a ) {\displaystyle f(\mathbf {AA} )}

f(\mathbf{AA})

, f ( a B ) {\displaystyle f(\mathbf {AB} )}

f(\mathbf{AB})

, og f ( b b ) {\displaystyle F(\mathbf {BB} )}

f(\mathbf{bb})

er frekvenserne for de tre genotyper på et sted med to alleler, derefter frekvensen P for a-genotyperne, der er placeret på et-allel og frekvensen k for B-allelen i befolkningen opnås ved at tælle alleler. p = f ( A A ) + 1 2 f ( A B ) = frekvens af a {\displaystyle p=f(\mathbf {AA} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mboks{frekvens af a}}}

p=f(\mathbf{AA})+ \frac{1}{2}f(\mathbf{AB})= \(B B ) + 1 2 f ( A B) = frekvens af b {\displaystyle k = f(\mathbf {bb}) +{\frac {1} {2}} F(\mathbf{AB})={\mboks {frekvens af B}}}k=f(\mathbf{BB})+ \frac{1} {2} f(\mathbf{AB})=\mboks{frekvens af B}

fordi p og K er frekvenserne for de eneste to alleler, der er til stede på det sted, skal de summe til 1. For at kontrollere dette:

p + K = f ( A A ) + f ( B B ) + f ( A B ) = 1 {\displaystyle p+k=f(\mathbf {AA} )+f(\mathbf {BB} )+f(\mathbf {AB} )=1}

p+k=f(\mathbf{AA})+f(\mathbf{BB})+f(\mathbf{BB}) + f (\mathbf {BB}) \mathbf {ab})=1

K = 1 − p {\displaystyle k=1-p}

K=1-K

og p = 1 − k {\displaystyle P=1-K}

P=1-K

Hvis der er mere end to forskellige allelformer, er frekvensen for hver allel simpelthen frekvensen af dens homosygot plus halvdelen af summen af frekvenserne for alle de heterosygoter, hvori den vises.

(for 3 alleler se allel–LARP-allel-og genotypefrekvenser)

Allelfrekvens kan altid beregnes ud fra genotypefrekvens, mens det omvendte kræver, at de hårdføre betingelser for tilfældig parring gælder.

Eksempelrediger

overvej et locus, der bærer to alleler, A og B. I en diploid population er der tre mulige genotyper, to homosygøse genotyper (AA og BB) og en heterosygøs genotype (AB). Hvis vi prøver 10 individer fra befolkningen, og vi observerer genotypefrekvenserne

  1. frekvens (AA) = 6
  2. frekvens (AB) = 3
  3. frekvens (BB) = 1

så er der 6 liter 2 + 3 = 15 {\displaystyle 6\gange 2+3=15}

6\times2 + 3 = 15

observerede kopier af A-allelen og 1 liter 2 + 3 = 5 {\displaystyle 1\gange 2+3=5}

1\times2 + 3 = 5

af B-allelen ud af 20 samlede kromosomkopier. Frekvensen p for a-allelen er p = 15/20 = 0,75, og frekvensen k for B-allelen er k = 5/20 = 0,25.