østrogen spiller en vigtig rolle i vækst og modning af knogler såvel som i reguleringen af knogleomsætning i Voksen knogle. Under knoglevækst er østrogen nødvendig for korrekt lukning af epifysiske vækstplader både hos kvinder og hos mænd. Også i ung skelet østrogenmangel fører til øget osteoklastdannelse og forbedret knogleresorption. I overgangsalderen inducerer østrogenmangel cancelløs såvel som kortikalt knogletab. Stærkt forøget knogleresorption i cancelløs knogle fører til generelt knogletab og ødelæggelse af lokal arkitektur på grund af penetrerende resorption og mikrofrakturer. I kortikal knogle er det første respons af østrogenudtagning forbedret endokortisk resorption. Senere øges også intrakortisk porøsitet. Disse fører til nedsat knoglemasse, forstyrret arkitektur og reduceret knoglestyrke. På celleniveau i knogle østrogen hæmmer differentiering af osteoklaster dermed reducere deres antal og reducere mængden af aktive remodeling enheder. Denne effekt medieres sandsynligvis gennem nogle cytokiner, hvor IL-1 og IL-6 er stærkeste kandidater. Østrogen regulerer ekspressionen af IL – 6 i knoglemarvsceller ved en hidtil ukendt mekanisme. Det er stadig usikkert, om virkningerne af østrogen på osteoblaster er direkte eller skyldes koblingsfænomen mellem knogledannelse til resorption.