Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas Aprameya IV – J Acad Clin Microbiol
EDITORIAL
Year : 2013 | Volume : 15 | Issue : 2 | Page : 59-61
Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka, India
| Date of Web Publication | 7-Jan-2014 |
Correspondence Address:
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka
India
Source of Support: None, Conflict of Interest: None
DOI: 10.4103/0972-1282.124588
How to cite this article:
Aprameya IV. Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013;15:59-61
How to cite this URL:
Aprameya IV. Ikke-fermenterende Gram-negative baciller (NFGNB) annet Enn Pseudomonas. J Acad Clin Mikrobiol 2013 ;15:59-61. Tilgjengelig fra: https://www.jacmjournal.org/text.asp?2013/15/2/59/124588
| Introduksjon |  |
ikke-fermentorer er en heterogen gruppe gram-negative baciller som er aerobe, ikke-sporende, enten bruker ikke karbohydrater som energikilde eller nedbryter dem gjennom andre metabolske veier enn gjæring. Å være allestedsnærværende i naturen, ble de ignorert som sannsynlige forurensninger, når de ble isolert i laboratoriet. Imidlertid har de nå oppstått som viktige helsepersonellrelaterte patogener som de har gjort sin nisje i sykehusmiljøet. Nye utfordringer av multi-drug resistance, både iboende og ervervet blant dem er av alvorlig bekymring for behandlende lege. Ikke-fermentorer står for 15% av alle bakterielle isolater fra et klinisk mikrobiologisk laboratorium. Publiserte studier fra ulike sentre siterer varierte isolasjonsrater av ikke-fermentorer som spenner fra 2,18% til 45,9%. Taksonomisk forvirring råder da det er en kontinuerlig revisjon, og mange av de identifiserte stammene har ingen utpekte arter tildelt. Dette forsterkes av faktorene som bidrar til vanskeligheter med å identifisere dem i det rutinemessige kliniske mikrobiologilaboratoriet. De fleste arter er sjelden oppstått, og derfor kan laboratoriepersonalet ikke være kjent med mange av de ikke-fermentorer. Mange av de konvensjonelle kulturmediene er ikke egnet for identifisering og kvalitetskontroll av media kan være vanskelig. Mange arter er langsomt voksende og biokjemisk svake eller inerte og krever betydelig erfaring for å tolke tvetydige resultater. Kommersielle kit systemer som er tilgjengelige for bruk er ikke bare dyrt, men også ofte har lav nøyaktighet for identifisering av visse stammer. De fleste kliniske mikrobiologi laboratorier stole hovedsakelig på fenotypiske metoder for identifikasjon. Disse kan omfatte manuelle eller kommersielle sett / automatiserte identifikasjonssystemer, FOR EKSEMPEL API 20NE, Remel N / F, Vitek 2, Microscan Walkaway, Sensititre AP80-systemet, Phoenix-systemet.
studier som undersøker ytelsen til det kommersielle identifikasjonssystemet har imidlertid vist motstridende resultater. Identifisering ved konvensjonelle fenotypiske metoder kan være vanskelig og tidkrevende. Molekylære identifikasjonsteknikker fremstår som alternativ for fenotypiske identifikasjonsmetoder. Blant disse er 16s rrna gensekvensering og DNA array (oligonukleotid array) teknikk som har blitt beskrevet som pålitelig og rask metode for identifisering av klinisk signifikante Ikke-fermenterende Gram negative baciller (NFGNB). LISTEN OVER NFGNB er uendelig og utenfor omfanget av denne artikkelen. Få vanlige klinisk viktige ikke-fermentorer enn Pseudomonas er høyt opplyst i denne artikkelen.
| Slekten Acinetobacter | |
som det fremgår av våre data i den spesielle artikkelen i dette nummeret, og de fleste andre studier, er den vanligste ikke-pseudomonas ikke-Fermenter Gjenvunnet fra Kliniske prøver acinetobacter. Klassifisert under Familien Moraxella More Detailsceae, denne slekten inkluderer Gram-negative coccobacilli som er ikke-motile, oksidase negative og resistente mot penicillin. Mer enn 25 genomoarter har blitt anerkjent AV DNA-DNA hybridisering innenfor slekten og syv har fått formelt artsnavn. Blant disse er arter Acinetobacter calcoaceticus, a. baumannii, Acinetobacter genomic species 3 Og Acinetobacter genomic species 13TU som har et ekstremt nært forhold og er vanskelig å skille fra hverandre ved fenotypiske tester alene. De har blitt gruppert Som Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex.
a. baumannii er sakkarolytisk, syrer de fleste karbohydrater og demonstrerer rask produksjon av syre fra 1% og 10% laktose. Disse funksjonene kan brukes til deres presumptive identifikasjon i rutinemessig diagnostisk laboratorium. A. baumannii-komplekset står for 80% av kliniske infeksjoner forårsaket Av Acinetobacter-arter, og inkluderer lungebetennelse, bakteriemi, meningitt, urinveisinfeksjon (UTI) og sårinfeksjoner, hvorav de fleste er sykehusoppkjøpte. Acinetobacters har dukket opp som de mest vellykkede patogener av deres evne til å overleve og vedvare i sykehusmiljøet i lengre tidsperioder både på tørre og fuktige overflater. Dette er assistert av deres evne til å vokse ved en rekke forskjellige temperaturer og pH, og dermed bidra til utvikling og utholdenhet av utbrudd. Compounding dette problemet er deres evne til å produsere biofilmer på overflaten av medisinsk utstyr.
Flere resistensmekanismer finnes i denne organismen som har bidratt til fremveksten av multidrug og pan stoffresistens, forårsaker en alvorlig bekymring for behandlende lege. Interessant, I en studie av en epidemisk multiresistent Acinetobacter-stamme I Frankrike, er det rapportert en stor genomresistent øy som inneholder 45 resistente gener som er oppnådd fra Andre Gram-negative baciller. Antibiotisk følsomhetstesting for Acinetobacter-arter er problemutsatt, og resultater oppnådd ved bruk av standardisert mikrobuljongfortynning stemmer ikke overens med det som oppnås ved standard diskdiffusjonsmetode, spesielt for beta-laktam – og beta-laktamhemmerkombinasjon. Clinical and laboratory standards institute (CLSI) definerer ikke retningslinjene for diskdiffusjonstesting og tolkning for nyere antibiotika som Tigecyklin og Kolistin.
| Slekt Burkholderia | |
burkholderia cepacia (b. cepacia)
et fytopatogen, B. cepacia Har Dukket Opp som en årsak til opportunistisk infeksjon, spesielt hos pasienter med kronisk granulomatøs sykdom og cystisk fibrose. Taksonomiske studier har vist At b. cepacia faktisk er en klynge av minst ni nært beslektede genomovarer. De er oftest assosiert med epidemier Av ‘Cepacia syndrom’ manifestert av alvorlig progressiv respirasjonssvikt og bakteriemi. B. cepacia complex har blitt isolert fra mange vannkilder og våte overflater, inkludert vaskemiddelløsninger og IV-væsker. Sykehusutbrudd på grunn av vanlig kildekontaminering av medisinsk utstyr som nebulisatorer, desinfeksjonsmidler og blodgassanalysatorer er rapportert. Identifikasjon Av b. cepacia i det kliniske laboratoriet kan være problematisk fordi det ikke er en enkelt fenotype. Kommersielle identifikasjonssystemer fungerer dårlig.
Primærkultur fra kliniske prøver kan utføres på selektive medier som b. cepacia selektiv agar eller oksidasjonsfermentering polymyxin bacitricin laktose agar (OFPBL agar) inkubert ved 35°C i 48 timer. Kolonier blir gule på grunn av laktoseutnyttelse. Isolatet er svakt oksidasepositivt, hydrolyserer lysin og er resistent Mot Polymyxin b og aminoglykosider, men følsomt for co-trimoxazol.
Behandling av valget Er Co-trimoxazol. CLSI foreslår in vitro testing For Ceftazidim, Meropenem, minocyklin (tetracyklin) og co-trimoxazol.
Burkholderia pseudomallei (B.pseudomallei)
en utløsende agent For Melioidose, b. pseudomallei er En Faregruppe 3 patogen og sikkerheten til laboratoriet arbeidstaker er av største bekymring under håndtering av denne organismen.
b. pseudomallei bør vurderes hos pasienter med pneumoni, sepsis eller abscess med en reisehistorie til Sørøst-Asia eller nord-Australia. Organismen er ikke vanskelig å isolere i rutinemessige medier. Imidlertid kan variasjon i kolonimorfologi ses. Den kan vokse ved 42°C. Gram-farget smører fra kliniske prøver viser et bipolar fargemønster. Isolering av organismen fra ikke-sterile steder krever bruk av et selektivt medium, Ashdowns medium, som viser grove rynket fiolette eller lilla kolonier etter 48 timer. En oksidase positive motile Gram negative baciller som kan identifiseres ved sin karakteristiske antibiogram viser konstitutiv motstand Mot Polymyxin Og Gentamicin, men følsom For Co-amoxyclavulansyre, Tetracyklin og Kloramfenikol. Kommersielle sett identifiserer godt, HVORAV API 20NE er den beste validerte.
Stenotrophomonas maltophilia
det er den tredje mest forekommende ikke-fermenter i klinisk praksis. Siden den er allestedsnærværende i naturen, kan den kolonisere luftveiene hos pasienter på sykehus og forårsake nosokomiale infeksjoner som CRBSI (kateterassosiert blodstrømsinfeksjon) og lungebetennelse, spesielt hos pasienter med hematologisk malignitet.
den produserer blek gul til lavendel grønne kolonier på blod agar. Det er en oksidase negativ, motil bacillus som er karakteristisk resistent Mot Imipenem (Karbapenem), men følsom for Kolistin, Polymyxin, Cotrimoxazol, Minocyklin og Levofloxacin. Det er en sterk maltoseoksidant som er lysin og DNAase positiv. De fleste kommersielle sett er i stand til å identifisere denne organismen.
men man bør utvise forsiktighet mens du leser og tolker antibiotika sensitivitetstester. Etterfølgende endepunkter er observert i agarfortynnings-og buljongfortynningstester, og det har forekommet falske sensitive målinger med diskdiffusjonsanalyse for Gentamicin og Ciprofloksacin. På samme måte har studier som bruker e-test registrert tilstedeværelsen av små mikrokolonier eller en tåke av gjennomsiktig vekst innenfor inhiberingsområdet, som hvis det blir savnet, kan føre til falskt følsomt resultat.
CLSI foreslår følgende antibiotika som skal testes For Stenotrophomonas maltophilia. Cotrimoxazol (legemiddel av valg), Ceftazidim, Levofloxacin, Minocyklin, Kloramfenikol Og Ticarcillin. MIC ved buljongfortynning anbefales for testing Av Ceftazidim, Kloramfenikol Og Ticarcillin, da diskdiffusjonsmetoden er upålitelig. Chryseobacterium meningosepticum (Elizabethkingia meningosepticum)
Selv om det er sjeldent, er det viktig å identifisere denne organismen da det kan forårsake utbrudd i barnehager og er forbundet med høy dødelighet (50%). En jordsaprofyt, det kan forurense pasientpleieartikler som resulterer i neonatal meningitt eller sepsis.
organismen produserer blekgule pigmenterte kolonier på blodagar, som kan ta mer enn 24 timer å vokse. Det er en Ikke-motil, Gram-negativ stang, det vil si oksidase positiv, indol positiv, hydrolyserer aesculin og gelatin og demonstrerer en positiv ONPG-test. Isolatet er utsatt For Penicillin, Vancomycin, Cotrimoxazol Og Fluorokinoloner. ,
denne organismen har to typer beta-laktamaser: utvidet spektrum beta lacatamaser (ESBL) og metallo beta laktamaser (MBLs) som gir resistens mot Cefalosporiner og Karbapenemer. Derfor kan antibiotika som brukes til Behandling Av Gram-negativ infeksjon ikke brukes til behandling Av Chryseobacterium-infeksjoner. MICs For Vancomycin på klinisk signifikante isolater må utføres. Diskdiffusjonstester er upålitelige.
| Konklusjon | |
alle kliniske mikrobiologilaboratorier må være innrettet til nøyaktig å identifisere ikke-fermentorer og klinisk betydning av et isolat må bestemmes i hvert enkelt tilfelle. Nøyaktig identifikasjon er viktig for optimal pasientbehandling, prognose og passende infeksjonskontrollintervensjon. Den type identifikasjonssystem som brukes av laboratoriet, bør overlates til den kliniske mikrobiologens skjønn. Det er imidlertid viktig å sikre at kvaliteten og ytelsen til systemene blir validert med jevne mellomrom.
|
samanta p, gautam v, thapar r, ray p. Fremvoksende motstand av ikke-fermenterende gram negative baciller i et tertiært omsorgssenter. Indisk J Pathol Mikrobiol 2011; 54: 666-7.   |
Deepak J, Rajat P, Shamanth AS, Munesh S, Vikrant N, Neelam utbredelse av ikke-fermenterende gram-negative baciller og deres in vitro-følsomhetsmønster I et tertiært omsorgssykehus i uttarakhand: en studie fra foot hills of himalaya. SJHS 2013;2: 108-12.
|
| Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Issued by the Standards Unit, Microbiology Services Division, HPA Bacteriology. Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Identification/ID17/Issue 2.1/Oct 2011:1-20.
|
|
| Koneman EW. The non fermentative gram negative bacilli. In: Color Atlas Og Lærebok For Diagnostisk Mikrobiologi. Lippincott Wilkins Og Williams. 6. utg., 2006. s. 303-76.
|
Su SC, Vanceechoutte M, Dijkshoom L, Wei YF, Leichen Y, Chang TC. Identifikasjon av ikke-fermenterende gram – negative bakterier av klinisk betydning ved et olignonukleotid-array. J Med Microbiol 2009; 58: 596-605.
|
| Manchand V, Sanchaita S, Sukk NP. Multidrug resistant acinetobacter. J Glob Infect Dis 2010;2:291-304.
|
|
| Lee HW, Koh YM, Kim J, Lee JC, Lee JC, Seol SY, et al. Capacity of multidrug resistant clinical isolates of Acinetobacter baumannii to form biofilm and adhere to epithelial cell surfaces. Clin Microbiol Infect 2008;14:49-54. |
|
| Singh NT, Singh M, Sharma M. Emergence of tigecycline and colistin resistant Acinetobacter baumanii in patients with complicated urinary tract infections in north India. Indian J Med Res 2011;133:681-4. |
|
| Maragakis LL, Perl TM. Acinetobacter baumannii: Epidemiology, antimicrobial resistance, and treatment options. Clin Infect Dis 2008;46:1254-63. |
|
| CLSI. Ytelsesstandarder For Antimikrobiell følsomhetstesting; Tjuefire Informasjonstilskudd. Clin Lab Stand Inst 2013;33:66-8.
|
HANG PP, Lin YH, Lin CF, Liu MF, Shi ZY. Chryseobacterium meningosepticum infeksjon: antibiotisk følsomhet og risikofaktorer for dødelighet. J Mikrobiol Immunol Infisere 2008; 41:137-44. |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
Leave a Reply