Mat kommer inn i kroppen gjennom munnen . Innvendig begynner mekanisk sammenbrudd umiddelbart som det tygges og blandes med spytt. Dette sammenbrudd fortsetter som maten reiser ned spiserøret til magen. Før maten når magen, passerer den esophageal sphincter, en sirkulær enveisventil som lukkes og åpnes etter behov.den øvre delen av magen, fundus, fungerer som den første kontakten for mat når den møter mageforingen. Der aktiveres pepsin — et proteinfordøyende enzym-og begynner å fordøye maten sammen med saltsyre, en kraftig fordøyelsessyre som dreper bakterier og skaper et pH-nivå som gjør at pepsin og andre enzymer kan fungere.

Mens maten brytes ned, beskytter et slimlag utskilt av magesekken seg selv.den nedre, smalere delen av magen, pylorus, bruker muskulær virkning (betegnet peristaltikk) for å blande enzymer, mat og væske før den tømmer disse inn i tolvfingertarmen, eller den første delen av tynntarmen. Pylorus letter hastigheten som maten tømmer inn i tynntarmen.

kroppen i magen består av tre lag med muskel.

det innerste laget av magesmuskelen, det indre skrålaget, hjelper til med fordøyelsen ved å male maten sammen med fordøyelsessaftene. Produktet er et stoff kjent som chyme, en blanding av delvis fordøyd mat, syrer, enzymer og væske. Det tar alt fra 40 minutter til noen timer for magen å snu mat til chyme. Proteiner, som kjøtt og fett, tar lengst tid å fordøye. Karbohydrater fordøyer det raskeste.

det indre skrålaget har også små bølgelignende rygger kalt rugae, eller magefeller. Disse ryggene tillater magen å ekspandere når den fylles. De tillater også magen å gripe maten som den spyr, og bryter den videre ned.

den ytre muskelen, kalt det ytre langsgående laget, løper langsgående som navnet antyder. Mellomlaget, kalt det midterste sirkulære laget, er tykt med sirkulær muskel.

Fordøyelseshormoner spiller også en viktig rolle i fordøyelsen. De viktigste hormonene som påvirker magen er:

• Ghrelin: Produsert i magen, stimulerer dette appetitten.
• Peptid YY: dette hormonet hemmer appetitten som respons på mat.
• Gastrin: Dette signalerer produksjon av syrer i magen.Secretin: dette hormonet signalerer bukspyttkjertelen for å produsere fordøyelsessaft som nøytraliserer magesyre når den kommer inn i tynntarmen. Det signaliserer også magen for å produsere pepsin.