Articles

Allelfrekvens

de faktiske frekvensberegningene avhenger av ploidien til arten for autosomale gener.

MonoploidsEdit

frekvensen (p) av et allel a er brøkdelen av antall kopier (i) Av a-allelet og populasjonen eller prøvestørrelsen (N), så

p = i / N . {\displaystyle p = i / N.}

{\displaystyle p=i / N.}

DiploidsEdit

Hvis f ( A A ) {\displaystyle F(\mathbf {AA} )}

f(\mathbf{AA})

, F ( A B ) {\displaystyle f(\mathbf {AB} )}

f(\Mathbf{ab})

og f ( b b ) {\displaystyle f(\mathbf {bb} )}

f(\mathbf{bb})

frekvensen q av b-allelet i befolkningen oppnås Ved Å Telle Alleler. p = f ( A A ) + 1 2 f ( A B ) = frekvens av a {\displaystyle p=f(\mathbf {AA} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{frekvens Av a}}}

p=f(\mathbf{AA})+ \frac{1}{2}f(\mathbf{AB})= \mbox{frekvens av a}

q = f ( b b ) + 1 2 f ( a b ) = FREKVENS av b {\displaystyle q=f(\mathbf {bb} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {ab} )={\mbox{frekvens av b}}}

q=f(\mathbf{bb})+ \frac{1}{2}F(\mathbf{Ab})= \mbox{frekvens av b}

fordi p og q er frekvensene til de eneste to allelene som er tilstede ved det locus, må de summere til 1. For å sjekke dette:

p + q = f ( A A ) + f ( B B ) + f ( A B ) = 1 {\displaystyle p+q=f(\mathbf {AA} )+f(\mathbf {BB} )+f(\mathbf {AB} )=1}

p+q=f(\mathbf{AA})+f(\mathbf{BB})+f(\mathbf{BB}) + f (\mathbf {BB}) + f (\mathbf {BB}) mathbf {ab})=1

q = 1 − p {\Displaystyle q=1-p {\Displaystyle q=1-p}

q = 1 − p

og p=1-q {\displaystyle p=1-q}

p = 1-q

vis det er mer enn to forskjellige allelformer, Er Frekvensen For hver allel ganske enkelt frekvensen av dens homozygot pluss halvparten av frekvensene for alle heterozygotene der den vises.

(for 3 alleler se Alleler § allel og genotype frekvenser)

allel frekvens kan alltid beregnes ut fra genotype frekvens, mens omvendt krever At Hardy-Weinberg betingelser for tilfeldig parring gjelder.

Eksempelrediger

Tenk på et locus som bærer to alleler, A og B. i en diploid populasjon er det tre mulige genotyper, to homozygote genotyper (AA og BB), og en heterozygot genotype (AB). Hvis vi prøver 10 individer fra befolkningen, og vi observerer genotypefrekvensene

  1. freq (AA) = 6
  2. freq (AB) = 3
  3. freq (BB) = 1

så er det 6 × 2 + 3 = 15 {\displaystyle 6\ganger 2+3=15}

6\times2 + 3 = 15

observerte kopier av a-allelet og 1 × 2 + 3 = 5 {\displaystyle 1\ganger 2+3=5}

1\times2 + 3 = 5

av b-allelet, ut av 20 totale kromosomkopier. Frekvensen p Av a-allelet er p = 15/20 = 0,75, og frekvensen q Av b-allelet er q = 5/20 = 0,25.