Allelfrekvens
de faktiske frekvensberegningene avhenger av ploidien til arten for autosomale gener.
MonoploidsEdit
frekvensen (p) av et allel a er brøkdelen av antall kopier (i) Av a-allelet og populasjonen eller prøvestørrelsen (N), så
p = i / N . {\displaystyle p = i / N.}
DiploidsEdit
Hvis f ( A A ) {\displaystyle F(\mathbf {AA} )}
, F ( A B ) {\displaystyle f(\mathbf {AB} )}
og f ( b b ) {\displaystyle f(\mathbf {bb} )}
frekvensen q av b-allelet i befolkningen oppnås Ved Å Telle Alleler. p = f ( A A ) + 1 2 f ( A B ) = frekvens av a {\displaystyle p=f(\mathbf {AA} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{frekvens Av a}}}
q = f ( b b ) + 1 2 f ( a b ) = FREKVENS av b {\displaystyle q=f(\mathbf {bb} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {ab} )={\mbox{frekvens av b}}}
fordi p og q er frekvensene til de eneste to allelene som er tilstede ved det locus, må de summere til 1. For å sjekke dette:
p + q = f ( A A ) + f ( B B ) + f ( A B ) = 1 {\displaystyle p+q=f(\mathbf {AA} )+f(\mathbf {BB} )+f(\mathbf {AB} )=1}
q = 1 − p {\Displaystyle q=1-p {\Displaystyle q=1-p}
og p=1-q {\displaystyle p=1-q}
vis det er mer enn to forskjellige allelformer, Er Frekvensen For hver allel ganske enkelt frekvensen av dens homozygot pluss halvparten av frekvensene for alle heterozygotene der den vises.
(for 3 alleler se Alleler § allel og genotype frekvenser)
allel frekvens kan alltid beregnes ut fra genotype frekvens, mens omvendt krever At Hardy-Weinberg betingelser for tilfeldig parring gjelder.
Eksempelrediger
Tenk på et locus som bærer to alleler, A og B. i en diploid populasjon er det tre mulige genotyper, to homozygote genotyper (AA og BB), og en heterozygot genotype (AB). Hvis vi prøver 10 individer fra befolkningen, og vi observerer genotypefrekvensene
- freq (AA) = 6
- freq (AB) = 3
- freq (BB) = 1
så er det 6 × 2 + 3 = 15 {\displaystyle 6\ganger 2+3=15}
observerte kopier av a-allelet og 1 × 2 + 3 = 5 {\displaystyle 1\ganger 2+3=5}
av b-allelet, ut av 20 totale kromosomkopier. Frekvensen p Av a-allelet er p = 15/20 = 0,75, og frekvensen q Av b-allelet er q = 5/20 = 0,25.
Leave a Reply