Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas Aprameya IV – J Acad Clin Microbiol
EDITORIAL
Year : 2013 | Volume : 15 | Issue : 2 | Page : 59-61
Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka, India
| Date of Web Publication | 7-Jan-2014 |
Correspondence Address:
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka
India
Source of Support: None, Conflict of Interest: None
DOI: 10.4103/0972-1282.124588
How to cite this article:
Aprameya IV. Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013;15:59-61
How to cite this URL:
Aprameya IV. シュードモナス以外の非発酵グラム陰性桿菌（NFGNB）。 J Acad Clin Microbiol2013;15:59-61. /Td>
非発酵槽は、臨床微生物学研究所からのすべての細菌分離株の15％を占めています。 様々なセンターからの発表された研究では、2.18％から45.9％の範囲の非発酵槽の様々な分離率を引用しています。
継続的な改訂があり、同定された株の多くは指定された種が割り当てられていないため、分類学的混乱が優先されます。 これは、日常的な臨床微生物学実験室でそれらを識別することの困難さに寄与する要因によって悪化する。 ほとんどの種はまれに遭遇するため、実験室の担当者は非発酵槽の多くに精通していない可能性があります。 従来の培養培地の多くは、培地の同定や品質管理には適しておらず、困難である可能性がある。 多くの種は成長が遅く、生化学的に弱いか不活性であり、あいまいな結果を解釈するためにはかなりの経験が必要です。 使用可能な市販のキットシステムは、高価であるだけでなく、特定の株の同定の精度が低いことがよくあります。
ほとんどの臨床微生物学研究所は、識別の表現型の方法に主に依存しています。 これらは、ＡＰＩ２ ０ＮＥ、Ｒｅｍｅｌ Ｎ／Ｆ、Ｖｉｔｅｋ２、Ｍｉｃｒｏｓｃａｎ Ｗａｌｋａｗａｙ、Ｓｅｎｓｉｔｉｔｒｅ ＡＰ８ ０システム、Ｐｈｅｎｉｘシステムなどの手動または市販のキット／自動識別システムを含むことができる。
しかし、市販の識別システムの性能を調査する研究は矛盾した結果を示しています。 従来の表現型の方法による同定は困難で時間がかかることがあります。 分子同定技術は、表現型同定方法の代替として浮上している。 これらの中には、臨床的に有意な非発酵グラム陰性桿菌（NFGNB）の同定のための信頼性と迅速な方法として記載されている16s rRNA遺伝子配列およびDNAアレイ（オリゴヌクレオチドアレイ）技術があります。
NFGNBのリストは無限であり、この記事の範囲を超えています。 この記事では、シュードモナス以外の臨床的に重要な非発酵槽が一般的に遭遇することはほとんどありません。
| 属Acinetobacter |  |
特別なデータで証明されているようにこの問題の記事、および他のほとんどの研究では、臨床標本から回収された最も一般的な非シュードモナス非発酵槽はacinetobacterです。 家族Moraxellaの下で分類されるより詳細この属には、非運動性であり、オキシダーゼ陰性であり、ペニシリンに耐性のあるグラム陰性coccobacilliが含まれる。 25以上のゲノム種は、属内のDNA-DNAハイブリダイゼーションによって認識されており、七つの正式な種名が与えられている。 これらの中には、Acinetobacter calcoaceticus、A.baumannii、Acinetobacter genomic species3、Acinetobacter genomic species13TUがあり、非常に密接な関係を持ち、表現型試験だけでは区別することが困難である。 これらはＡｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒｃａｌｃｏａｃｅｔｉｃｕｓ-Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒｂａｕｍａｎｎｉｉ複合体として分類されている。
a.baumanniiは糖分解性であり、ほとんどの炭水化物を酸性化し、1％および10％の乳糖から酸を迅速に産生することを示しています。 これらの特徴は定期的な診断実験室で推定同一証明に使用することができる。 A.baumannii複合体は、Acinetobacter種によって引き起こされる臨床感染の80％を占め、肺炎、菌血症、髄膜炎、尿路感染症（UTI）および創傷感染を含み、そのほとんどは病院で取得され ,
アシネトバクターは、乾燥した表面と湿った表面の両方で長期間にわたって病院環境で生き残り、持続する能力によって、最も成功した病原体として浮上している。 これは、異なる温度およびpHの範囲で成長する能力によって支援され、それによって発生の発生および持続性に寄与する。 この問題を複合化することは、医療機器の表面上にバイオフィルムを生成する能力である。
複数の抵抗メカニズムは、治療医師のための深刻な懸念を引き起こし、多剤およびpan薬剤耐性の出現に貢献しているこの生物で発見されています。 ,
興味深いことに、フランスの流行性多剤耐性アシネトバクター株の研究では、他のグラム陰性桿菌から取得されている45耐性遺伝子を含む大規模なゲノムレジスタンスアイランドが報告されています。 アシネトバクター種に対する抗生物質感受性試験は問題を起こしやすく，標準化されたマイクロブロス希釈を用いて得られた結果は，特にベータラクタムおよびベータラクタム阻害剤の組み合わせに対する標準ディスク拡散法によって得られた結果と一致しない。 臨床および実験室の標準の協会(CLSI)はTigecyclineおよびColistinのようなより新しい抗生物質のためのディスク拡散のテストそして解釈のための指針を定義しない。
| 属Burkholderia | |
Burkholderia cepacia(b.cepacia)
植物病原体であるb.cepaciaは、特に慢性肉芽腫性疾患および嚢胞性線維症の患者における日和見感染の原因として浮上している。
分類学的研究により、B.cepaciaは実際には少なくとも9つの密接に関連するゲノモバのクラスターであることが実証されています。 それらは、重度の進行性呼吸不全および菌血症によって明らかにされる”ケパシア症候群”の流行と最も頻繁に関連している。 B.cepaciaの複合体は洗浄力がある解決およびIV液体を含む多数の水源そしてぬれた表面から隔離されました。 ネブライザー、消毒剤、血液ガス分析計などの医療機器の一般的なソース汚染による病院のアウトブレイクが報告されています。
臨床検査室でのb.cepaciaの同定は、単一の表現型ではないため問題がある可能性があります。 商業識別システムは不十分です。
臨床標本からの初代培養は、B.cepacia選択的寒天または酸化発酵ポリミキシンbacitricinラクトース寒天（OFPBL寒天）のような選択的培地上で35℃で48時間インキュベート コロニーは乳糖の利用のために黄色に見えます。 単離物は弱いオキシダーゼ陽性であり、リジンを加水分解し、ポリミキシンBおよびアミノグリコシドに耐性があるが、コトリモキサゾールに敏感である。
選択の治療はコトリモキサゾールである。 ＣＬＳＩは，セフタジジム，メロペネム，ミノサイクリン（テトラサイクリン）およびコトリモキサゾールのｉｎｖｉｔｒｏ試験を示唆している。
Burkholderia pseudomallei(B.pseudomallei)
メリオイドーシスの原因物質であるb.pseudomalleiはハザードグループ3病原体であり、この生物を扱う際には実験室労働者の安全性が最も懸念されています。
B.pseudomalleiは、東南アジアまたはオーストラリア北部への旅行歴のある肺炎、敗血症または膿瘍の患者に考慮する必要があります。 生物は、日常的な培地で単離することは困難ではない。 しかし、コロニーの形態の変化が見られることがあります。 それは臨床標本からの42°C.Gram汚された塗抹標本で示す両極汚損パターンで育つことができます。 非滅菌部位から生物を単離するには、48時間後に粗いしわのある紫色または紫色のコロニーを示す選択的培地であるAshdown培地の使用が必要です。 ポリミキシンおよびゲンタマイシンへの構成的な抵抗を示すが、Co-amoxyclavulanic酸、TetracyclineおよびChloramphenicolに敏感な独特のantibiogramによって識別することができるオキシダーゼの肯定的な運動性のグラムの否定的な桿菌。 市販のキットは、API20NEが最高の検証されたものであるのうち、よく識別します。
Stenotrophomonas maltophilia
これは、臨床診療における第三の最も一般的に遭遇する非発酵槽です。 本質的に遍在しているため、入院患者の気道に定着し、CRBSI（カテーテル関連血流感染症）などの院内感染、特に血液学的悪性腫瘍患者の肺炎を引き起こす可能性がある。
血中寒天に淡黄色からラベンダーグリーンのコロニーを産生する。 イミペネム（カルバペネム）に対して特徴的に抵抗力があるが、コリスチン、Polymyxin、Cotrimoxazole、MinocyclineおよびLevofloxacinに敏感ののはオキシダーゼの否定的な、運動性のバチルスです。 それはリジンおよびDNAaseの肯定的である強いマルトースの酸化剤です。 ほとんどの市販のキットは、この生物を識別することができます。
しかし、抗生物質感受性試験を読み、解釈しながら、注意を払う必要があります。 寒天希釈およびブロス希釈試験ではトレーリングエンドポイントが観察されており、ゲンタマイシンおよびシプロフロキサシンについては、ディスク拡散アッセイによる誤った感度の測定が行われている。 同様に、Eテストを使用して調査は逃されたら誤って敏感な結果をもたらすことができる阻止の区域内の半透明な成長の小さいマイクロコロニーか霞の存在を指摘しました。
CLSIはStenotrophomonas maltophiliaのためにテストされるべき次の抗生物質を提案する。 Cotrimoxazole（選択の薬剤）、Ceftazidime、Levofloxacin、Minocycline、ChloramphenicolおよびTicarcillin。 ディスク拡散法は信頼できないので、ブロス希釈によるMICは、セフタジジム、クロラムフェニコールおよびチカルシリンを試験するために推奨される。
Chryseobacterium meningosepticum(Elizabethkingia meningosepticum)
まれですが、この生物は保育園単位で発生する可能性があり、高い死亡率（50％）に関連しているため、この生物を特定することが重要です。 土壌腐生菌では、新生児髄膜炎または敗血症を引き起こす患者ケア用品を汚染する可能性があります。
この生物は、血液寒天上に淡黄色の色素コロニーを生成し、成長するのに24時間以上かかることがあります。 それは非運動性、グラム陰性の棒、すなわち、オキシダーゼの肯定的な、インドールの肯定的な、加水分解のaesculinおよびゼラチンで、肯定的なONPGテストを示します。 分離株はペニシリン、バンコマイシン、コトリモキサゾールおよびフルオロキノロンに感受性である。 ,
この生物は、β-ラクタマーゼの二つのタイプを持っています:拡張スペクトラムベータラカタマーゼ(ESBL)とメタロベータラクタマーゼ(MBLs)セファロスポリンとカルバペネム 従ってグラム陰性の伝染の処置で使用される抗生物質はChryseobacteriumの伝染を扱うために使用することができません。 臨床的に有意な分離株上のバンコマイシンのためのMICsを実行する必要があります。 ディスク拡散テストは信頼できません。
| 結論 | |
すべての臨床微生物学の実験室は正確に非分離物の発酵槽および臨床的意義は、ケースバイケースで決定されなければならない。 正確な同定は、最適な患者管理、予後および適切な感染制御介入のために重要である。 実験室で使用される識別システムのタイプは、臨床微生物学者の裁量に委ねられるべきである。 しかし、システムの品質と性能が定期的に検証されることを確実にすることが不可欠です。
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