解剖学的、生理学的、および薬理学的な違いに基づいて、自律神経系は二つの部門に分かれています：交感神経と副 次の表は、主な違いをまとめたものです。

NOTE: 神経節前と神経節後の軸索の長さ比は交感神経対副交感神経の違いであると言われることがあるが、迷走神経を除いて、長さ比は地域的に可変であり、一貫して異なるわけではない。

交感神経部門は日常的な機能（血圧の維持など）を持っていますが、その最も顕著な役割は、脳が”生命を脅かす”状況を認識したときに応答して神経支配標的の世界的な活性化を伴います。 対照的に、副交感神経部門は、日常的な内臓機能を回復させるために、より局所的に動作する。 交感神経節後ニューロンは一般にアドレナリン作動性であるが、そのうちのいくつかはコリン作動性である可能性がある（汗腺&筋血管の拡張）。 内臓器官の神経支配の詳細なリストを表示するには：ここをクリックしてください。
神経節前ニューロンのCNS起源と神経節後ニューロンを含む神経節の位置は、副交感神経（右）と交感神経（左）の部門について模式的に以下に示されています。 副交感神経節前経路は、脳幹の4つの脳神経核または仙骨脊髄から（両側に）発生することに注意してください。 交感神経節前経路は胸腰脊髄セグメントのみから（両側に）発生するのに対し、交感神経神経支配は体全体に広がっているにもかかわらず。p>