細菌（真正細菌および古細菌）

微生物学は、主に細菌の研究によって生まれました。 1800年代後半のフランスのルイ-パスツール、ドイツのロバート-コッホなどの実験は、人間にとって微生物の重要性を確立しました。 歴史的背景のセクションに記載されているように、これらの科学者の研究は、病気の胚芽理論と発酵の胚芽理論の証拠を提供しました。 標本の顕微鏡検査、実験室での微生物の培養（成長）、混合培養集団からの純粋な培養物の単離、および他の多くの実験室操作のための技術が考案されたのは彼らの実験室であった。 もともと細菌を研究するために使用されていたこれらの技術は、すべての微生物の研究のために変更されており、細菌学から微生物学への移行で

微生物の世界を構成する生物は、原核生物または真核生物のいずれかとして特徴付けられます。

微生物の世界を構成する生物は、原核生物; すべての細菌は原核生物であり、すなわち、膜結合核を有さない単細胞生物である。 それらのDNA（細胞の遺伝物質）は、核に含まれるのではなく、細胞内の特定の位置を持たない長い折り畳まれた糸として存在する。1970年代後半まで、すべての細菌は進化的発達において密接に関連していることが一般的に認められていました。

この概念は1977年にCarl Rによって挑戦されました。 イリノイ大学のWoeseとcoinvestigatorsは、幅広い生物からのリボソームRNAの研究により、2つのグループの細菌が共通の古代の祖先の形態とは別の経路によって進化したことを確立した。 この発見により、真正細菌（伝統的または”真の”細菌）、古細菌（進化の初期段階で他の細菌から分岐し、真正細菌とは異なる細菌）、および真核生物（真核生物）の主要な異なるグループを同定するための新しい用語が確立された。 今日、真正細菌は単に真の細菌（または細菌）として知られており、ドメイン細菌を形成しています。 しかし、これら三つのグループの様々なメンバー間の進化的関係は、様々な微生物のDNA配列間の比較が多くの不可解な類似点を明らかにしたため、不確実にな その結果、今日の微生物の正確な祖先を解決することは非常に困難です。 異なる分類群の特徴であると考えられている形質でさえ、他の微生物では予期せず観察されている。 例えば、嫌気性アンモニア酸化剤—グローバル窒素サイクルの”ミッシングリンク”-は、1999年に初めて単離されました。 この細菌（Planctomycetales目の異常なメンバー）は、真核生物に似た内部構造、古細菌の形質を持つ細胞壁、酵母細胞と同様の生殖（出芽）の形態を有することが分かった。細菌は、球、棒、および螺旋を含む様々な形状を有する。

細菌は、球、棒、および螺旋を含む様々な形状を有する。

個々の細胞は、一般的に0.5から5マイクロメートル（μ m;メートルの百万分の一）の幅の範囲である。 単細胞であるが、細菌はしばしば対、鎖、四面体（4つのグループ）、またはクラスターに現れる。 いくつかは、鞭毛、液体媒体を介して生物を推進する外部むち打ち症の構造を持っています;いくつかは、カプセル、細胞の外部コーティングを持っています;いくつかは、種子が植物の間で行うように多くの機能胞子—生殖体を生産します。 細菌の主要な特徴の一つは、グラム染色に対するそれらの反応である。 細胞壁の化学的および構造的組成に応じて、いくつかの細菌はグラム陽性であり、染色の紫色を帯び、他の細菌はグラム陰性である。