La microscopie à fluorescence à balayage laser confocal (ou « confocal » pour faire court) permet d’examiner différentes sections d’un échantillon épais sans réellement découper l’échantillon. Ceci est particulièrement utile pour examiner les processus biologiques dans les tissus vivants, car il peut continuer à fonctionner tout au long de l’expérience au microscope. Le mouvement des mitochondries autour des cellules, la mitose et le changement de longueur des cils primaires sont tous des processus bien adaptés pour être vus sur le confocal.

Confocal est également utile pour identifier des composants spécifiques (tels que des organites ou des protéines) dans la cellule ou le tissu étudié. Les composants sont étiquetés avec des étiquettes fluorescentes, puis la lumière laser est diffusée sur l’échantillon. Les molécules fluorescentes brillent (et tout le reste reste sombre), elles sont donc faciles à voir.

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