L’île, connue sous le nom d’Organa (Μργανα) pour les Grecs anciens et sous le nom de Jarun à l’époque islamique, a acquis le nom de « Ormuz » de l’importante ville portuaire d’Ormuz (Ormus) sur le continent à 60 km de là, qui avait été le centre d’une principauté mineure des deux côtés du détroit. La principauté rendait hommage à l’Ilkhanat dirigé par les Mongols et constituait une source importante de revenus du commerce maritime. Le souverain de la ville décida de déplacer sa résidence sur l’île vers 1300, afin d’échapper aux attaques de groupes mongols et turcs de l’intérieur. Le souverain a ensuite fait la paix avec les Ilkhans.

Une nouvelle ville a été construite sur la pointe nord de l’île de Jarun qui a été appelée New Ormuz pendant un certain nombre d’années pour la distinguer de la vieille ville sur le continent jusqu’à ce que celle-ci tombe en ruines. Peu à peu, le nom de la nouvelle ville fut également utilisé pour l’île.

L’île est aride et pendant les mois d’été, la température peut atteindre plus de 43 ° C (109 ° F). En tant que telle, ce n’était pas un emplacement idéal pour la capitale d’une principauté car toutes les provisions, y compris l’eau, devaient être apportées du continent. Son emplacement, cependant, a donné à l’île un degré de sécurité qui lui a permis de devenir un port de commerce majeur pendant plusieurs siècles. Comme ses concurrents souffraient de destructions intermittentes, Ormuz restait un port fiable et relativement sûr.

Ormuz a été visitée par Marco Polo, vers 1290, alors qu’il voyageait par voie terrestre, comme décrit dans son carnet de voyage.

Ibn Battuta a également visité l’île et la Nouvelle-Ormuz.

Présence portugaise dans le golfe Persique et la mer Rouge. Vert – Possessions portugaises. Vert foncé – Allié ou sous influence.

En 1505, le roi Manuel Ier de Portugal conduit le Portugal à établir une politique d’expansion en Afrique et en Asie occidentale. Lors des tentatives d’expansion de l’influence portugaise dans l’Océan Indien, le duc portugais Afonso de Albuquerque s’empare de l’île en 1507 et elle est incorporée au grand Empire portugais. Les Portugais ont construit une forteresse sur l’île pour dissuader les envahisseurs potentiels, la nommant le fort de Notre-Dame de la Conception. L’île est devenue un point d’escale d’urgence pour les navires portugais se rendant à Goa, au Gujarat et à proximité de Kishm. Les Ottomans assiégèrent l’île sous l’amiral et cartographe Piri Reis en 1552. En 1622, l’île fut capturée aux Portugais par une force combinée anglo-perse à la demande de la Compagnie anglaise des Indes orientales.

Shah Abbas I se méfiait de la population locale et n’était pas intéressé par le maintien de l’île en tant que centre commercial ou poste militaire; au lieu de cela, il développa le port continental voisin de Bander Abbas. Ormuz est entré en déclin. Beaucoup de ses habitants se sont installés de façon saisonnière dans leurs champs et vergers autour de la vieille Ormuz sur le continent, seuls les pêcheurs étant en résidence permanente. L’île a continué à exporter de petites quantités de sel gemme et de morceaux d’oxyde de fer qui ont été utilisés comme pierres de ballast pour les voiliers.

Après une période d’administration omanaise au 19ème siècle, elle est restée une île de pêcheurs peu habitée avant de connaître un certain développement dans les dernières années du 20ème siècle.