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Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas Aprameya IV – J Acad Clin Microbiol

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EDITORIAL

Year : 2013 | Volume : 15 | Issue : 2 | Page : 59-61

Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka, India

Date of Web Publication 7-Jan-2014

Correspondence Address:
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka
India
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DOI: 10.4103/0972-1282.124588

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Aprameya IV. Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013;15:59-61

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Aprameya IV. Bacilos gramnegativos no fermentantes (NFGNB) distintos de las pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013; 15: 59-61. Disponible en: https://www.jacmjournal.org/text.asp?2013/15/2/59/124588

Introducción Top

Los no fermentadores son un grupo heterogéneo de bacilos gramnegativos que son aeróbicos, sin esporas, no utilizan carbohidratos como fuente de energía o los degradan a través de vías metabólicas distintas de la fermentación. Al ser omnipresentes en la naturaleza, se descartaron como contaminantes probables cuando se aislaron en el laboratorio. Sin embargo, ahora se han convertido en patógenos asociados a la atención médica importantes, ya que han hecho su nicho en el entorno hospitalario. Los desafíos emergentes de la resistencia a múltiples medicamentos, tanto intrínseca como adquirida entre ellos, son motivo de grave preocupación para el médico tratante. Los no fermentadores representan el 15% de todos los aislados bacterianos de un laboratorio de microbiología clínica. Los estudios publicados de varios centros citan tasas de aislamiento variadas de no fermentadores que oscilan entre el 2,18% y el 45,9%. Predomina la confusión taxonómica, ya que hay una revisión continua y muchas de las cepas identificadas no tienen asignadas especies designadas. Esto se ve agravado por los factores que contribuyen a las dificultades para identificarlos en el laboratorio de microbiología clínica de rutina. La mayoría de las especies se encuentran con poca frecuencia y, por lo tanto, el personal del laboratorio puede no estar familiarizado con muchos de los no fermentadores. Muchos de los medios de cultivo convencionales no son adecuados para la identificación y el control de calidad de los medios puede ser difícil. Muchas especies son de crecimiento lento y bioquímicamente débiles o inertes y requieren una experiencia considerable para interpretar resultados equívocos. Los sistemas de kits comerciales que están disponibles para su uso no solo son caros, sino que a menudo también tienen poca precisión para la identificación de ciertas cepas. La mayoría de los laboratorios de microbiología clínica se basan principalmente en los métodos fenotípicos de identificación. Estos pueden incluir sistemas de identificación manuales o comerciales / automatizados, como API 20NE, Remel N / F, Vitek 2, Microscan Walkaway, el sistema Sensititre AP80 y el sistema Phoenix. Sin embargo, los estudios que investigan el funcionamiento del sistema de identificación comercial han arrojado resultados contradictorios. La identificación por métodos fenotípicos convencionales puede ser difícil y llevar mucho tiempo. Las técnicas de identificación molecular están surgiendo como alternativas para los métodos de identificación fenotípica. Entre ellas se encuentran la secuenciación del gen 16s rRNA y la técnica de matriz de ADN (matriz de oligonucleótidos) que se han descrito como un método confiable y rápido para la identificación de bacilos gram negativos No fermentantes clínicamente significativos (NFGNB). La lista de NFGNB es interminable y está más allá del alcance de este artículo. Pocos fermentadores clínicamente importantes que se encuentran con frecuencia, aparte de las Pseudomonas, son de alta iluminación en este artículo.

Genus Acinetobacter Top

Como lo demuestran nuestros datos en el artículo especial de este número, y la mayoría de los otros estudios, el no fermentador no Pseudomonas más común recuperado de muestras clínicas es Acinetobacter. Clasificado bajo la familia Moraxella More Detailsceae, este género incluye cocobacilos gramnegativos que son no móviles, oxidasas negativas y resistentes a la penicilina. Más de 25 genomospecies han sido reconocidas por hibridación ADN-ADN dentro del género y siete han recibido el nombre formal de especie. Entre estas se encuentran las especies Acinetobacter calcoaceticus, A. baumannii, Acinetobacter genomic species 3 y Acinetobacter genomic species 13TU que tienen una relación extremadamente estrecha y son difíciles de distinguir entre sí por pruebas fenotípicas solas. Se han agrupado como complejo Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii.
A. baumannii es sacarolítico, acidifica la mayoría de los carbohidratos y demuestra la rápida producción de ácido a partir de 1% y 10% de lactosa. Estas características se pueden utilizar para su presunta identificación en el laboratorio de diagnóstico de rutina. El complejo A. baumannii representa el 80% de las infecciones clínicas causadas por especies de Acinetobacter, e incluye neumonía, bacteriemia, meningitis, infección del tracto urinario e infecciones de heridas, la mayoría de las cuales son adquiridas en hospitales. ,
Las acinetobacterias se han convertido en los patógenos más exitosos por su capacidad de sobrevivir y persistir en el entorno hospitalario durante largos períodos de tiempo, tanto en superficies secas como húmedas. Esto se ve favorecido por su capacidad de crecer a diferentes temperaturas y pH, contribuyendo así al desarrollo y la persistencia de brotes. A este problema se suma su capacidad de producir biopelículas en la superficie de los dispositivos médicos. En este organismo se encuentran múltiples mecanismos de resistencia que han contribuido a la aparición de la resistencia a múltiples medicamentos y pan, causando una seria preocupación para el médico tratante. Curiosamente, en un estudio de una cepa epidémica de Acinetobacter multirresistente en Francia, se ha informado de una gran isla de resistencia genómica que contiene 45 genes resistentes que se han adquirido de otros bacilos gramnegativos. Las pruebas de sensibilidad a los antibióticos para especies de acinetobacter son propensas a problemas y los resultados obtenidos mediante la dilución de microbrotos estandarizada no concuerdan con los obtenidos mediante el método estándar de difusión en disco, en particular para la combinación de betalactámicos e inhibidores de betalactámicos. El instituto de normas clínicas y de laboratorio (CLSI, por sus siglas en inglés) no define las pautas para las pruebas de difusión en disco y la interpretación de antibióticos más nuevos como la tigeciclina y la colistina.

Genus Burkholderia Top

Burkholderia cepacia (B. cepacia) Un fitopatógeno, B. cepacia, ha surgido como causa de infección oportunista, particularmente en pacientes con enfermedad granulomatosa crónica y fibrosis quística.
Los estudios taxonómicos han demostrado que B. cepacia es en realidad un grupo de al menos nueve genómovares estrechamente relacionados. Se asocian con mayor frecuencia a epidemias de «síndrome de Cepacia» que se manifiestan por insuficiencia respiratoria progresiva grave y bacteriemia. El complejo B. cepacia se ha aislado de numerosas fuentes de agua y superficies húmedas, incluidas soluciones detergentes y fluidos intravenosos. Se ha informado de una ruptura de salida del hospital debido a la contaminación de fuentes comunes de dispositivos médicos, como nebulizadores, desinfectantes y analizadores de gases sanguíneos. la identificación de B. cepacia en el laboratorio clínico puede ser problemática porque no es un único fenotipo. Los sistemas de identificación comercial funcionan mal. El cultivo primario a partir de muestras clínicas puede realizarse en medios selectivos como el agar selectivo de B. cepacia o el agar de lactosa de bacitricina de polimixina de fermentación por oxidación (agar OFPBL) incubado a 35°C durante 48 horas. Las colonias aparecen amarillas debido a la utilización de lactosa. El aislado es débilmente oxidasa positiva, hidroliza lisina y es resistente a la polimixina B y aminoglucósidos, pero sensible al cotrimoxazol. el tratamiento de elección es cotrimoxazol. CLSI sugiere pruebas in vitro para Ceftazidima, Meropenem, minociclina (tetraciclina) y cotrimoxazol. Burkholderia pseudomallei (B.pseudomallei), un agente causal de la Melioidosis, B. pseudomallei es un patógeno del Grupo de peligro 3 y la seguridad del trabajador del laboratorio es de primordial importancia durante la manipulación de este organismo. B. pseudomallei debe considerarse en pacientes con neumonía, sepsis o absceso con antecedentes de viaje al Sudeste Asiático o al norte de Australia. El organismo no es difícil de aislar en medios de rutina. Sin embargo, se pueden observar variaciones en la morfología de las colonias. Puede crecer a 42 ° C. Las frotis teñidas con gram de muestras clínicas muestran un patrón de tinción bipolar. El aislamiento del organismo de sitios no estériles requiere el uso de un medio selectivo, el medio de Ashdown, que muestra colonias rugosas y arrugadas de color violeta o púrpura después de 48 horas. Un bacilo Gram negativo móvil positivo a oxidasa que, puede identificarse por su antibiograma característico que muestra resistencia constitutiva a la Polimixina y Gentamicina, pero sensible al ácido Co-amoxiclavulánico, tetraciclina y Cloranfenicol. Los kits comerciales se identifican bien, de los cuales API 20NE es el mejor validado. Stenotrophomonas maltophilia Es el tercer no fermentador más frecuente en la práctica clínica. Al ser de naturaleza ubicua, puede colonizar el tracto respiratorio en pacientes hospitalizados y causar infecciones nosocomiales como ICSRC (infecciones del torrente sanguíneo asociadas a catéter) y neumonía, especialmente en pacientes con neoplasias hematológicas malignas.Produce colonias de color amarillo pálido a verde lavanda en agar sangre. Es un bacilo móvil oxidasa negativo que es característicamente resistente al Imipenem (Carbapenem), pero sensible a la Colistina, Polimixina, Cotrimoxazol, Minociclina y Levofloxacina. Es un fuerte oxidante de maltosa que es positivo en lisina y DNAasa. La mayoría de los kits comerciales son capaces de identificar este organismo. Sin embargo, se debe tener precaución al leer e interpretar las pruebas de sensibilidad a los antibióticos. Se han observado puntos finales finales en las pruebas de dilución en agar y dilución en caldo, y se han producido lecturas falsamente sensibles con ensayo de difusión en disco para Gentamicina y ciprofloxacino. De manera similar, los estudios que utilizan la prueba E han observado la presencia de micro colonias diminutas o una neblina de crecimiento translúcido dentro del área de inhibición, que si se omite podría conducir a un resultado falsamente sensible.

CLSI sugiere los siguientes antibióticos para ser probado por Stenotrophomonas maltophilia. Cotrimoxazol (medicamento de elección), Ceftazidima, Levofloxacina, Minociclina, Cloranfenicol y Ticarcilina. La CIM por dilución de caldo se recomienda para probar Ceftazidima, Cloranfenicol y ticarcilina, ya que el método de difusión en disco no es confiable. Chryseobacterium meningosepticum (Elizabethkingia meningosepticum) Aunque es raro, es importante identificar este organismo, ya que puede causar brotes en unidades de vivero y está asociado con altas tasas de mortalidad (50%). Un saprófito del suelo, puede contaminar los artículos de atención al paciente, lo que resulta en meningitis neonatal o sepsis.El organismo produce colonias pigmentadas de color amarillo pálido en agar sanguíneo, que pueden tardar más de 24 horas en crecer. Es una varilla gramnegativa no móvil, es decir, oxidasa positiva, indol positivo, hidroliza aesculina y gelatina y demuestra una prueba de ONPG positiva. El aislado es susceptible a Penicilina, Vancomicina, Cotrimoxazol y Fluoroquinolonas. ,
Este organismo tiene dos tipos de beta-lactamasas: beta-lacatamasas de espectro extendido (BLEE) y metal-beta-lactamasas (MBL) que confieren resistencia a Cefalosporinas y Carbapenems. Por lo tanto, los antibióticos utilizados en el tratamiento de infecciones gramnegativas no pueden utilizarse para tratar infecciones por criseobacterias. Se deben realizar MICs de vancomicina en aislados clínicamente significativos. Las pruebas de difusión de disco no son fiables.

Conclusión Top

Todos los laboratorios de microbiología clínica debe estar orientado a identificar con precisión el no fermentadores y la significación clínica de un aislado debe ser determinada sobre una base de caso por caso. La identificación precisa es importante para el manejo óptimo del paciente, el pronóstico y la intervención adecuada para el control de infecciones. El tipo de sistema de identificación utilizado por el laboratorio debe dejarse a discreción del microbiólogo clínico. Sin embargo, es esencial garantizar que la calidad y el rendimiento de los sistemas se validen periódicamente.

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This article has been cited by
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Abdelazeem M. Algammal,Mahmoud Mabrok,Elayaraja Sivaramasamy,Fatma M. Youssef,Mona H. Atwa,Ali W. El-kholy,Helal F. Hetta,Wael N. Hozzein
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Sabah Jamal,Ahmad Al Atrouni,Rayane Rafei,Fouad Dabboussi,Monzer Hamze,Marwan Osman
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