Los cálculos de frecuencia reales dependen de la ploidía de la especie para los genes autosómicos.

Monoploideseditar

La frecuencia (p) de un alelo A es la fracción del número de copias (i) del alelo A y el tamaño de la población o muestra (N), por lo que

p = i / N . {\displaystyle p = i / N.}

DiploidsEdit

Si f ( a) (a) {\displaystyle f(\mathbf {AA} )}

, f ( a, B ) {\displaystyle f(\mathbf {AB} )}

, y f ( B, B ) {\displaystyle f(\mathbf {BB} )}

son las frecuencias de los tres genotipos en un locus con dos alelos, a continuación, la frecuencia de p de los alelos a y la frecuencia q de la B-alelo en la población son obtenidos por recuento de los alelos. p = f ( a ) + 1 2 f ( a B ) = frecuencia de Un {\displaystyle p=f(\mathbf {AA} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{frecuencia de Un}}}

q = f ( B, B ) + 1 2 f ( a B ) = frecuencia de B {\displaystyle q=f(\mathbf {BB} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{frecuencia de B}}}

Debido a que p y q son las frecuencias de los dos alelos presentes en ese locus, deben sumar 1. Para comprobar esto:

p + q = f ( a ) + f ( B, B ) + f ( a B ) = 1 {\displaystyle p+q=f(\mathbf {AA} )+f(\mathbf {BB} )+f(\mathbf {AB} )=1}

q = 1 − p {\displaystyle q=1-p}

y p = 1 − q {\displaystyle p=1-q}

Si hay más de dos alelos formas, la frecuencia de cada alelo es simplemente la frecuencia de su homocigoto más de la mitad de la suma de las frecuencias para todos los heterocigotos en el que aparece.

(Para 3 alelos ver Alelo § Frecuencias de alelos y genotipos)

La frecuencia de alelos siempre se puede calcular a partir de la frecuencia de genotipos, mientras que lo contrario requiere que se apliquen las condiciones de Hardy–Weinberg de apareamiento aleatorio.

Ejemploeditar

Considere un locus que lleva dos alelos, A y B. En una población diploide hay tres genotipos posibles, dos genotipos homocigotos (AA y BB) y un genotipo heterocigoto (AB). Si nos muestra de 10 individuos de la población, y podemos observar las frecuencias de los genotipos

1. freq (AA) = 6
2. freq (AB) = 3
3. freq (BB) = 1

luego hay 6 × 2 + 3 = 15 {\displaystyle 6\times 2+3=15}

observó copias del alelo a y 1 × 2 + 3 = 5 {\displaystyle 1\times 2+3=5}

del alelo B, de 20 total cromosoma copias. La frecuencia p del alelo A es p = 15/20 = 0,75, y la frecuencia q del alelo B es q = 5/20 = 0,25.