La faringe se compone de tres divisiones principales. La porción anterior es la faringe nasal, la sección posterior de la cavidad nasal. La faringe nasal se conecta a la segunda región, la faringe oral, por medio de un pasaje llamado istmo. La faringe oral comienza en la parte posterior de la cavidad bucal y continúa por la garganta hasta la epiglotis, un colgajo de tejido que cubre el paso de aire hacia los pulmones y que canaliza los alimentos hacia el esófago. Los huecos de forma triangular en las paredes de esta región albergan las amígdalas palatinas, dos masas de tejido linfático propensas a la infección. El istmo que conecta las regiones oral y nasal es extremadamente beneficioso en los seres humanos. Les permite respirar por la nariz o la boca y, cuando es médicamente necesario, permite que los alimentos pasen al esófago por los tubos nasales. La tercera región es la faringe laríngea, que comienza en la epiglotis y conduce hasta el esófago. Su función es regular el paso del aire a los pulmones y de los alimentos al esófago.

Dos tubos pequeños (tubos de eustaquio) conectan el oído medio con la faringe y permiten igualar la presión del aire en el tímpano. Los resfriados en la cabeza a veces inflaman los tubos, causando dolores de oído y dificultades auditivas. Otras afecciones médicas asociadas con la faringe incluyen amigdalitis, cáncer y varios tipos de parálisis de garganta causadas por polio, difteria, rabia o lesiones del sistema nervioso.

El término faringe también se puede usar para describir una porción diferenciada del canal alimentario invertebrado. En algunas especies de invertebrados, la estructura es gruesa y musculosa. Ocasionalmente es eversible (girado o girado hacia afuera) y puede tener múltiples funciones, por ejemplo, ser de naturaleza suctorial y peristáltica.