Bajo el sistema de administración fiduciaria de las Naciones Unidas establecido después de la Segunda Guerra Mundial, los franceses tenían la obligación de mover a Togo hacia el autogobierno. Una bandera local fue adoptada en 1956, poco antes de que el país se convirtiera en una república autónoma dentro de la Unión Francesa. El fondo verde de la bandera representaba la agricultura, la esperanza y la juventud; el Tricolor francés en la esquina superior del polipasto era un recordatorio del señorío francés. Dos estrellas amarillas de cinco puntas, dispuestas en una línea diagonal imaginaria que va desde el polipasto inferior hasta la mosca superior, se referían a las llanuras costeras del sur y a las sabanas del norte, «unidas por amor al orden y al trabajo.

El 27 de abril de 1960, Togo se independizó bajo una bandera completamente nueva; redujo las dos estrellas a una para enfatizar la unidad nacional. Las cinco franjas verdes y amarillas de la bandera corresponden a las regiones administrativas del país, mientras que esos colores recuerdan que la abrumadora mayoría de la población depende de la tierra para su sustento (verde) y de su propio trabajo para el desarrollo (amarillo). Se dice que el cantón rojo representa el amor, la fidelidad y la caridad, mientras que la estrella blanca se asocia con la pureza. Los mismos colores panafricanos rojo, amarillo y verde fueron seleccionados por varios otros países que obtuvieron la independencia poco antes o después de Togo.