Die Klassifizierung lebender Organismen wird als Taxonomie bezeichnet und zielt darauf ab, lebende Organismen zu klassifizieren, indem sie unterschieden und Beziehungen zwischen Organismengruppen hergestellt werden.Das Königreich der lebenden Organismen wurde 1978 von Carl R. Woese als Domäne bezeichnet.Organismen werden in drei Domänensysteme gruppiert, nämlich Eukarya, Archaea und Bakterien, hauptsächlich auf der Grundlage des Zelltyps. Anders als der Zelltyp, Unterschiede in der rRNA, unterscheiden sich die drei Domänen in der Membran-Lipid-Struktur, Transfer-RNA-Moleküle und Empfindlichkeit gegenüber Antibiotika auch für die Klassifizierung von Organismen.

• Die Domäne Bakterien umfasst alle pathogenen und nicht pathogenen Prokaryotensie haben eine Zellwand aus Peptidoglycan und Muraminsäure. Sie haben auch Membranlipide mit estergebundenen, geradkettigen Fettsäuren, die eukaryotischen Membranlipiden ähneln. Bakterien haben auch Plasmide, bei denen es sich um kleine doppelsträngige Dnamoleküle handelt, die extrachromosomal sind.
• Domänenarchäen umfassen drei Hauptgruppen, nämlich Methanogene, extreme Halophile und Hyperthermophile. Ihnen fehlt Muraminsäure in den Zellwänden.
• Eukarya umfasst die eukaryotischen Organismenals Tiere, Pflanzen, Pilze und Protistenund haben einen definierten Kern und membrangebundene Organellen

Das taxonomische Klassifizierungsschema für Prokaryoten ist in Bergeys Handbuch der systematischen Bakteriologie ausgearbeitet, das die Klassifizierung von Prokaryoten in zwei Domänen beschreibt: Bakterien und Archaea.

Weitere Klassifizierung der Domäne ist wie folgt-

• Domäne
• Königreich
• Phyla
• Klasse
• Reihenfolge
• Familie
• Gattung
• Spezies

Die binomische (wissenschaftliche) Nomenklatur weist jeder Mikrobe 2 Namen zu – Gattungsnomen, immer großgeschrieben und Artenadjektiv, kleinbuchstaben. Beide sind kursiv oder unterstrichen geschrieben. Ex. Staphylococcus aureus (S. aureus), Escherichia coli (E. coli)

Die grundlegende taxonomische Gruppe in der mikrobiellen Taxonomie ist die Spezies. Taxonomen, die mit höheren Organismen arbeiten, definieren ihre Spezies anders als Mikrobiologen. Prokaryotische Arten zeichnen sich durch Unterschiede in ihrem Phänotyp undgenotyp. Phänotyp ist die Sammlung von sichtbaren Eigenschaften und das Verhalten eines Mikroorganismus. Genotyp ist die genetische Zusammensetzung eines Mikroorganismus

Bergeys Handbuch bietet ein Klassifizierungsschema für Bakterien sowie eine Referenz zur Identifizierung verschiedener Bakterien im Labor. Nach Bergeys Handbuch der determinativen Bakteriologie werden die Bakterien auf der Grundlage von morphologischen Merkmalen identifiziert Färbung, biochemische Tests, Serologie, G-C-Gehalt, DNA-Probenund verschiedene molekulare Tests. Neben den in Bergeys aufgeführten Eigenschaften ist bei der Identifizierung von Mikroorganismen auch die Quelle und der Lebensraum von Mikroorganismen zu berücksichtigen.

Punkte zu erinnern:

1. Taxonomie ist die Wissenschaft, die sich mit Klassifizierungvon lebenden Organismen auf der Grundlage von Eigenschaften, die ähnlich und verschieden von anderen Organismen sindund die Herstellung von Beziehungen zwischen Gruppen von Organismen.
2. Alle lebenden Organismen sind in drei Domänensysteme gruppiert, nämlich Eukarya, Archaea und Bakterien, hauptsächlich auf der Grundlage des Zelltyps.
3. Das taxonomische Klassifikationsschema für Prokaryoten wird in Bergeys Handbuch der systematischen Bakteriologie ausgearbeitet, wonach die Prokaryoten in zwei Domänen unterteilt sind: Bakterien und Archaeen