Die tatsächlichen Häufigkeitsberechnungen hängen von der Ploidie der Spezies für autosomale Gene ab.

MonoploidsEdit

Die Häufigkeit (p) eines Allels A ist der Bruchteil der Anzahl der Kopien (i) des A-Allels und der Population oder Stichprobengröße (N), also

p = i / N. {\displaystyle p=ich/N.}

DiploidsEdit

Wenn f ( A A ) {\displaystyle f(\mathbf {AA} )}

, f (AB ) {\displaystyle f(\mathbf {AB} )}

und f (B B ) {\displaystyle f(\mathbf {BB} )}

die Häufigkeiten der drei Genotypen an einem Locus mit zwei Allelen sind, so erhält man durch Zählen der Allele die Häufigkeit p des A-Allels und die Häufigkeit q des B-Allels in der Population. p = f ( A A ) + 1 2 f ( A B ) = Häufigkeit von A {\displaystyle p=f(\mathbf {AA} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{Häufigkeit von A}}}

q = f ( BB ) + 1 2 f ( AB ) = Häufigkeit von B {\displaystyle q=f(\mathbf {BB} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{Häufigkeit von B}}}

Da p und q die Frequenzen der einzigen zwei Allele sind, die an diesem Ort vorhanden sind, müssen sie sich zu 1 summieren. Um dies zu überprüfen:

p + q = f ( A A ) + f ( B B ) + f (A B ) = 1 {\displaystyle p+q=f(\mathbf {AA} )+f(\mathbf {BB} )+f(\mathbf {AB} )=1}

q = 1 − p {\displaystyle q=1-p}

und p = 1 − q {\displaystyle p=1-q}

Wenn es mehr als zwei verschiedene Allelformen gibt, ist die Häufigkeit für jedes Allel einfach die Häufigkeit seiner Homozygoten plus die Hälfte der Summe der Häufigkeiten für alle Heterozygoten, in denen es auftritt.

(Für 3 Allele siehe Allel § Allel– und Genotyphäufigkeiten)

Die Allelhäufigkeit kann immer aus der Genotyphäufigkeit berechnet werden, während umgekehrt die Hardy-Weinberg-Bedingungen der zufälligen Paarung gelten müssen.

ExampleEdit

Betrachten Sie einen Locus, der zwei Allele trägt, A und B. In einer diploiden Population gibt es drei mögliche Genotypen, zwei homozygote Genotypen (AA und BB) und einen heterozygoten Genotyp (AB). Wenn wir 10 Individuen aus der Population auswählen und die Genotyphäufigkeiten beobachten

1. freq (AA) = 6
2. freq (AB) = 3
3. freq (BB) = 1

dann gibt es 6 × 2 + 3 = 15 {\displaystyle 6\times 2+3=15}

beobachtete Kopien des A-Allels und 1 × 2 + 3 = 5 {\displaystyle 1\times 2+3=5}

des B-Allels von insgesamt 20 Chromosomenkopien. Die Frequenz p des A-Allels beträgt p = 15/20 = 0,75 und die Frequenz q des B-Allels beträgt q = 5/20 = 0,25.