utforska genomet av flodblindhetsparasiten
en överblick
- forskare avkodade genomet av parasiten som orsakar hud-och ögoninfektion som kallas flodblindhet.fynden belyser parasitens framväxande läkemedelsresistens och kan i slutändan leda till förbättrade sätt att behandla och förebygga flodblindhet.
flodblindhet är en ögon-och hudinfektion orsakad av en liten parasitisk mask som kallas Onchocerca volvulus. Människor förvärvar sjukdomen genom bett av svarta flugor som lever och föder upp på stranden av snabbströmmande floder och strömmar, mestadels i Afrika söder om Sahara. En gång inuti människokroppen reproducerar maskarna. Deras avkommor migrerar till huden, där de orsakar intensiv klåda och utslag, och till ögat, där de i slutändan kan orsaka blindhet.
för att bättre förstå parasiten undersökte 2 forskargrupper maskens genom. Forskningen beskrivs i ett par artiklar som publicerades online den 21 November 2016 i Nature Microbiology. Teamen inkluderade forskare anställda eller stöds delvis av NIHS National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID) och National Human Genome Research Institute (NHGRI).
en grupp, ledd av Dr. Sara Lustigman vid New York Blood Center samlade O. volvulus parasiter tillsammans med prover av Wolbachia, de symbiotiska bakterierna som lever i maskarna. Forskarna sekvenserade och undersökte dessa genom. De identifierade gener som kodar för vanliga proteiner och molekylära reaktioner som är nödvändiga för infektion. Baserat på sekvensdata kan 16 av de nyupptäckta proteinerna vara lovande mål för befintliga FDA-godkända läkemedel som nu används för att behandla andra sjukdomar. Mer forskning behövs för att avgöra om störning av något av dessa proteiner skulle vara en användbar strategi för behandling av flodblindhet.
flodblindhet behandlas för närvarande med ett läkemedel som heter ivermektin. Men vissa parasiter har börjat visa motstånd mot denna medicinering. För att lära sig hur detta motstånd utvecklades undersökte ett forskargrupp ledt av Dr Makedonka Mitreva vid Washington University School of Medicine i St.Louis hur maskens genom såg ut före storskaliga läkemedelsbehandlingsinsatser.
forskarna sekvenserade 27 DNA-prover från parasiter som hade lagrats sedan början av 1990-talet. De jämförde genomerna av maskar som samlats in från Ecuador, Uganda och både skogs-och savannpopulationer från Västafrika. Dessa jämförelser hjälpte laget att identifiera genetiska markörer som kan användas för att spåra utvecklingen av olika parasitstammar runt om i världen.
”vi vill förstå ursprunget till detta motstånd”, förklarar Mitreva. ”Utvecklas dessa parasiter för att överleva behandlingen, eller är de överlevande maskarna faktiskt nya stammar som har införts på grund av migrering av de svarta flugorna eller parasiten själv?”
i en tredje relaterad studie analyserade ett team ledt av Dr.Thomas Nutman vid NIAID alla gener som uttrycktes (transkriptomen) och proteinerna som producerades (proteomen) av O. volvulus och Wolbachia. Som detaljerat den 23 November 2016, i mBio, identifierade laget hundratals olika proteiner uttryckta på olika punkter i parasitens livsstil.tillsammans avslöjar dessa studier kritisk information om den genomiska mångfalden av onchocerca volvulus parasit. Denna nya information kan vara användbar för att förstå läkemedelsresistens och hitta nya sätt att behandla flodblindhet.
Leave a Reply