Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas Aprameya IV – J Acad Clin Microbiol
EDITORIAL
Year : 2013 | Volume : 15 | Issue : 2 | Page : 59-61
Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka, India
| Date of Web Publication | 7-Jan-2014 |
Correspondence Address:
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka
India
Source of Support: None, Conflict of Interest: None
DOI: 10.4103/0972-1282.124588
How to cite this article:
Aprameya IV. Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013;15:59-61
How to cite this URL:
Aprameya IV. Icke-fermenterande gramnegativa baciller (NFGNB) andra än Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013 ;15: 59-61. Tillgänglig från: https://www.jacmjournal.org/text.asp?2013/15/2/59/124588
| introduktion |  |
icke-fermenterare är en heterogen grupp gramnegativa baciller som är aeroba, icke-sporande, antingen använder inte kolhydrater som energikälla eller bryter ner dem genom andra metaboliska vägar än jäsning. Eftersom de var allestädes närvarande i naturen ignorerades de som sannolika föroreningar när de isolerades i laboratoriet. Men de har nu framstått som viktiga sjukvårdsrelaterade patogener eftersom de har gjort sin nisch i sjukhusmiljön. Nya utmaningar av multi-drug resistance, både inneboende och förvärvade bland dem är av allvarlig oro för den behandlande läkaren.
icke-fermenterare står för 15% av alla bakteriella isolat från ett kliniskt mikrobiologilaboratorium. Publicerade studier från olika centra citerar varierande isoleringshastigheter för icke-fermenterare som sträcker sig från 2,18% till 45,9%.
taxonomisk förvirring råder eftersom det finns en kontinuerlig revision och många av de identifierade stammarna har inga utsedda arter tilldelade. Detta förvärras av de faktorer som bidrar till svårigheterna att identifiera dem i det rutinmässiga kliniska mikrobiologiska laboratoriet. De flesta arter förekommer sällan och därför kanske laboratoriepersonalen inte känner till många av de icke-fermenterarna. Många av de konventionella kulturmedierna är inte lämpliga för identifiering och kvalitetskontroll av media kan vara svårt. Många arter växer långsamt och biokemiskt svaga eller inerta och kräver stor erfarenhet för att tolka tvetydiga resultat. Kommersiella kitsystem som är tillgängliga för användning är inte bara dyra utan har ofta låg noggrannhet för identifiering av vissa stammar.
de flesta kliniska mikrobiologiska laboratorier är huvudsakligen beroende av fenotypiska metoder för identifiering. Dessa kan inkludera manuella eller kommersiella kit/automatiserade identifieringssystem, såsom API 20ne, Remel N/F, Vitek 2, Microscan Walkaway, Sensititre AP80-systemet, Phoenix-systemet.
studier som undersöker prestanda för det kommersiella identifieringssystemet har dock visat motstridiga resultat. Identifiering med konventionella fenotypiska metoder kan vara svårt och tidskrävande. Molekylär identifieringsteknik framträder som alternativ för fenotypiska identifieringsmetoder. Bland dessa är 16S rRNA-gensekvensering och DNA-array (oligonukleotid array) teknik som har beskrivits som pålitlig och snabb metod för identifiering av kliniskt signifikanta icke-fermenterande gramnegativa baciller (NFGNB).
listan över NFGNB är oändlig och utanför ramen för denna artikel. Få vanligt förekommande kliniskt viktiga icke-fermentorer än Pseudomonas är högt upplysta i denna artikel.
| Genus Acinetobacter | |
som framgår av våra data i specialartikeln i denna fråga, och de flesta andra studier, är den vanligaste icke-Pseudomonas-icke-Fermenteraren som återvinns från kliniska prover Acinetobacter. Klassificerad under familjen Moraxella mer Detaljerceae, detta släkt inkluderar gramnegativa coccobacilli som är icke-rörliga, oxidas negativa och resistenta mot penicillin. Mer än 25 genomoarter har erkänts genom DNA-DNA-hybridisering inom släktet och sju har fått formellt artnamn. Bland dessa är arter Acinetobacter calcoaceticus, A. baumannii, Acinetobacter genomic species 3 och Acinetobacter genomic species 13tu som har en extremt nära relation och är svåra att skilja från varandra genom fenotypiska tester ensamma. De har grupperats som Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii-komplex.
A. baumannii är sackarolytisk, surgör de flesta kolhydrater och visar den snabba produktionen av syra från 1% och 10% laktos. Dessa funktioner kan användas för deras presumptiva identifiering i det rutinmässiga diagnostiska laboratoriet. A. baumannii-komplexet står för 80% av kliniska infektioner orsakade av Acinetobacter-arter och inkluderar lunginflammation, bakteriemi, meningit, urinvägsinfektion (UTI) och sårinfektioner, varav de flesta är sjukhusförvärvade. ,
Acinetobacters har framstått som de mest framgångsrika patogenerna genom sin förmåga att överleva och kvarstå i sjukhusmiljön under längre tidsperioder både i torra och fuktiga ytor. Detta stöds av deras förmåga att växa vid en rad olika temperaturer och pH, vilket bidrar till utveckling och uthållighet av utbrott. Kompoundering detta problem är deras förmåga att producera biofilmer på ytan av medicintekniska produkter.
flera resistensmekanismer finns i denna organism som har bidragit till uppkomsten av multidrug och pan läkemedelsresistens, vilket orsakar en allvarlig oro för den behandlande läkaren. ,
intressant, i en studie av en epidemisk multidrugsresistent Acinetobacter-stam i Frankrike har en stor genomisk resistent ö innehållande 45 resistenta gener som har förvärvats från andra gramnegativa baciller rapporterats. Antibiotikakänslighetstestning för Acinetobacter-arter är problembenägen och resultat som erhållits genom användning av standardiserad mikrobrottspädning överensstämmer inte med den som erhållits med standarddiffusionsmetod, särskilt för betalatam-och betalaktamhämmare kombination. Clinical and laboratory standards institute (CLSI) definierar inte riktlinjerna för diskdiffusionstestning och tolkning för nyare antibiotika som Tigecyklin och Colistin.
| släkt Burkholderia | |
Burkholderia cepacia (B. cepacia)
en fytopatogen, B. cepacia har uppstått som en orsak till opportunistisk infektion, särskilt hos patienter med kronisk granulomatös sjukdom och cystisk fibros.
taxonomiska studier har visat att B. cepacia faktiskt är ett kluster av minst nio närbesläktade genomovarer. De är oftast förknippade med epidemier av Cepaciasyndrom som manifesteras av svår progressiv andningssvikt och bakteriemi. B. cepacia complex har isolerats från många vattenkällor och våta ytor inklusive tvättmedelslösningar och IV-vätskor. Sjukhusutbrott på grund av vanlig källförorening av medicinsk utrustning som nebulisatorer, desinfektionsmedel och blodgasanalysatorer har rapporterats.
identifiering av B. cepacia i det kliniska laboratoriet kan vara problematiskt eftersom det inte är en enda fenotyp. Kommersiella identifieringssystem fungerar dåligt.
primärkultur från kliniska prover kan utföras på selektiva medier såsom B. cepacia selektiv agar eller oxidationsjäsning polymyxin bacitricin laktosagar (OFPBL agar) inkuberad vid 35 C i 48 timmar. Kolonier verkar gula på grund av laktosutnyttjande. Isolatet är svagt oxidas positivt, hydrolyserar lysin och är resistent mot Polymyxin B och aminoglykosider men känsligt för trimoxazol.
behandling av val är Co-trimoxazol. CLSI föreslår in vitro-testning för Ceftazidim, Meropenem, minocyklin (tetracyklin) och Co-trimoxazol.
Burkholderia pseudomallei (B.pseudomallei)
ett orsakande medel för Melioidos, B. pseudomallei är en Farogrupp 3 patogen och laboratoriearbetarens säkerhet är av största vikt vid hantering av denna organism.
B. pseudomallei bör övervägas hos patienter med lunginflammation, sepsis eller abscess med en resehistoria till Sydostasien eller norra Australien. Organismen är inte svår att isolera i rutinmedier. Men variation i kolonimorfologi kan ses. Det kan växa vid 42 C. Gram-färgade utstryk från kliniska prover visar ett bipolärt färgningsmönster. Isolering av organismen från icke-sterila platser kräver användning av ett selektivt medium, Ashdowns medium, som visar grova skrynkliga violett eller lila kolonier efter 48 timmar. En oxidas positiva rörliga gramnegativa baciller som kan identifieras genom dess karakteristiska antibiogram som visar konstitutiv resistens mot Polymyxin och Gentamicin men känslig för Co-amoxiclavulansyra, tetracyklin och kloramfenikol. Kommersiella Kit identifierar väl, varav API 20ne är den bästa validerade.
Stenotrophomonas maltophilia
det är den tredje vanligast förekommande icke-fermenteraren i klinisk praxis. Eftersom det är allestädes närvarande i naturen kan det kolonisera luftvägarna hos patienter på sjukhus och orsaka nosokomiala infektioner såsom CRBSI (kateterassocierade blodflödesinfektioner) och lunginflammation, särskilt hos patienter med hematologisk malignitet.
det producerar blekgula till lavendelgröna kolonier på blodagar. Det är en oxidasnegativ, rörlig bacillus som är karakteristiskt resistent mot Imipenem (karbapenem), men känslig för kolistin, Polymyxin, Cotrimoxazol, minocyklin och Levofloxacin. Det är en stark maltosoxidisator som är lysin och Dnaas-positiv. De flesta kommersiella kit kan identifiera denna organism.
man bör dock vara försiktig när man läser och tolkar antibiotikakänslighetstesterna. Avslutande slutpunkter har observerats i Agar-utspädning och buljongutspädningstester och falskt känsliga avläsningar med diskdiffusionstest har inträffat för Gentamicin och Ciprofloxacin. På liknande sätt har studier som använder e-test noterat närvaron av små mikrokolonier eller en dis av genomskinlig tillväxt inom hämningsområdet, vilket om det saknas kan leda till falskt känsligt resultat.
CLSI föreslår att följande antibiotika testas för Stenotrophomonas maltophilia. Cotrimoxazol (läkemedel av val), Ceftazidim, Levofloxacin, minocyklin, kloramfenikol och Ticarcillin. MIC genom buljongutspädning rekommenderas för testning av ceftazidim, kloramfenikol och Ticarcillin, eftersom diskdiffusionsmetoden är opålitlig.
Chryseobacterium Meningosepticum (Elizabethkingia meningosepticum)
även om det är sällsynt är det viktigt att identifiera denna organism eftersom det kan orsaka utbrott i plantskolor och är förknippat med hög dödlighet (50%). En jord saprofyt, det kan förorena patientvårdsartiklar som resulterar i neonatal meningit eller sepsis.
organismen producerar blekgula pigmenterade kolonier på blodagar, vilket kan ta mer än 24 timmar att växa. Det är en icke-rörlig, gramnegativ stång, det vill säga oxidas positiv, indol positiv, hydrolyser aesculin och gelatin och visar ett positivt ONPG-test. Isolatet är mottagligt för Penicillin, vankomycin, Cotrimoxazol och fluorokinoloner. ,
denna organism har två typer av beta-laktamaser: extended spectrum beta lacatamaser (ESBL) och metallo beta laktamaser (MBLs) som ger resistens mot cefalosporiner och karbapenemer. Därför kan antibiotika som används vid behandling av gramnegativ infektion inte användas för behandling av Chryseobacteriuminfektioner. Mikrofoner för vankomycin på kliniskt signifikanta isolat måste utföras. Diskdiffusionstester är opålitliga.
| slutsats | |
alla kliniska mikrobiologiska laboratorier måste vara inriktade på att exakt identifiera icke-fermenterare och klinisk betydelse för ett isolat måste bestämmas från fall till fall. Exakt identifiering är viktigt för optimal patienthantering, prognos och lämplig infektionskontrollintervention. Den typ av identifieringssystem som används av laboratoriet bör överlåtas till den kliniska mikrobiologens bedömning. Det är dock viktigt att säkerställa att systemets kvalitet och prestanda valideras regelbundet.
|
Samanta p, Gautam v, Thapar r, Ray P. Emerging resistance av icke fermenterande gramnegativa baciller i en tertiär vårdcentral. Indisk J Pathol Microbiol 2011; 54: 666-7.   |
|
| Deepak J, Rajat P, Shamanth AS, Munesh S, Vikrant n, Neelam S. prevalens av icke-fermenterande gramnegativa baciller och deras mottaglighetsmönster in vitro i ett tertiärsjukhus i Uttarakhand: en studie från foot hills of Himalaya. SJHS 2013; 2: 108-12.
|
|
| Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Issued by the Standards Unit, Microbiology Services Division, HPA Bacteriology. Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Identification/ID17/Issue 2.1/Oct 2011:1-20.
|
|
| Koneman EW. The non fermentative gram negative bacilli. In: Färgatlas och lärobok för diagnostisk mikrobiologi. Lippincott Wilkins och Williams. 6: e upplagan; 2006. s. 303-76.
|
|
| Su SC, Vanceechoutte M, Dijkshoom L, Wei YF, Leichen Y, Chang TC. Identifiering av icke-fermenterande gramnegativa bakterier av klinisk betydelse genom en olignonukleotidmatris. J Med Microbiol 2009; 58: 596-605.
|
|
| Manchand V, Sanchaita S, suck NP. Multidrug resistant acinetobacter. J Glob Infect Dis 2010;2:291-304.
|
|
| Lee HW, Koh YM, Kim J, Lee JC, Lee JC, Seol SY, et al. Capacity of multidrug resistant clinical isolates of Acinetobacter baumannii to form biofilm and adhere to epithelial cell surfaces. Clin Microbiol Infect 2008;14:49-54. |
|
| Singh NT, Singh M, Sharma M. Emergence of tigecycline and colistin resistant Acinetobacter baumanii in patients with complicated urinary tract infections in north India. Indian J Med Res 2011;133:681-4. |
|
| Maragakis LL, Perl TM. Acinetobacter baumannii: Epidemiology, antimicrobial resistance, and treatment options. Clin Infect Dis 2008;46:1254-63. |
|
| CLSI. Prestandastandarder för antimikrobiell känslighetstestning; tjugotredje informationstillägg. Clin Lab Står Inst 2013; 33: 66-8.
|
|
| hängde PP, Lin YH, Lin CF, Liu MF, Shi ZY. Chryseobacterium meningosepticuminfektion: antibiotikakänslighet och riskfaktorer för dödlighet. J Microbiol Immunol Infektera 2008; 41: 137-44. |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
Leave a Reply