Blue World Institute bedriver forskningsverksamhet i flera stora marina ryggradsdjur. Vår huvudsakliga forskning är på kustsamhällena av bottlenose delfiner i regionen. Andra projektaktiviteter fokuserar också på andra valar, inklusive Finval, Cuviers näbbval, Rissos delfin, randig delfin och vanlig delfin samt Medelhavsmunksälen. I samarbete med det kroatiska Naturhistoriska museet bedriver vi forskning om hajar, jätte djävulstrålar och havssköldpaddor. Alla marina däggdjur – valar, Pinnipeds, Sirenians, havsuttern (Enhydra lutris) och isbjörn (Ursus maritimus) – anses ha utvecklats vid olika tidpunkter från landlevande förfäder. Även om valar ser mer ut som fisk än sina närmaste levande släktingar, är flodhästen (flodhäst amphibius), deras anatomi, fysiologi och embryologi verkligen däggdjur. Liksom alla sanna däggdjur föder valar levande unga och kvinnor har bröstkörtlar. Som medlem i Odontoceti-underordningen har delfiner tänder, medan baleenvalar har baleenplattor. Delphinidae utgör den största och mest mångsidiga valfamiljen, inklusive späckhuggaren (Orcinus orca). För närvarande finns det tre underbeställningar av valar: Archaeocetes-nu helt utdöda, Odontocetes – tandvalarna och Mysticetes – baleenvalarna. Det är allmänt trott att både Odontocetes och Mysticetes delar en gemensam förfader bland Archaeocetes. Nya genetiska och morfologiska analyser avslöjar kopplingar mellan arter som tidigare ansågs distinkta och skillnader mellan vanligtvis associerade arter. På samma sätt visar många nya upptäckter av nya arter som gjorts genom genetisk forskning att antalet levande valar är betydligt högre än cirka 80 som för närvarande erkänns. Faktorer som individuell variation i vokalisering, utfodringspreferenser och beteende, färg, skelettegenskaper, närvaron av isolerade underpopulationer och interfecundity mellan arter bidrar alla till denna osäkerhet.