Afrikas Horn har varit en känd källa till biologiska resurser i tusentals år. De forntida egyptierna, grekerna och romarna skickade expeditioner och husvagnar till regionen för rökelse, myrra och andra naturliga råvaror som skulle tas tillbaka norrut längs rökelsevägen genom de arabiska öknen.

växter

även om forskning om floran i Afrikas Horn fortfarande pågår, är de bästa möjliga uppskattningarna att det finns cirka 5000 arter av kärlväxter i regionen, varav drygt hälften—cirka 2750 arter —är endemiska. Det finns starka koncentrationer av endemiska arter i norra Somalia och i Socotra skärgård.

i tusentals år har flera inhemska trädslag tillhandahållit råvarorna för några av Afrikas Horn viktigaste råvaror, inklusive rökelse (från Boswellia sacra i Somalia, Jemen och Oman, och B. frereana i Somalia), myrra (från den utbredda Commiphora myrrha och C. guidottii i Somalia och östra Etiopien) och drakens blodträd eller cinnabar (från de sårbara Dracaena cinnabari, som finns på Socotra). Drakens blodträd används som medicin och färgämne. Produktionen av rökelse och myrra är fortfarande en stor ekonomisk aktivitet i Somalia och till viss del i Etiopien och norra Kenya.

Hundratals nya arter har upptäckts i Somalia ensam under de senaste 30 åren, mest anmärkningsvärda bland dem Somaliska cyklamen (cyklamen somalense). Känd endast från ett litet område i norra Somalia var växten en överraskande upptäckt i tropiskt Afrika, eftersom släktet cyklamen annars bara finns i Medelhavsområdet.

fåglar

av de 697 fågelarter som regelbundet registreras i hotspot är 24 endemiska. Sju av dessa arter finns endast i Somalia.

en av de mest anmärkningsvärda endemiska fågelarterna i hotspot är den hotade Warsangli linnet (Linariajohannis), lokalt vanligt i höga, branta sluttningar längs Adenbukten i norra Somalia. En annan viktig flaggskeppsarter är den kritiskt hotade Djibouti francolin (Pternistis ochropectus), som bara finns på två platser i Djibouti, för Chakt De Day, som tros vara den enda livskraftiga platsen för denna imperiled Art, och de närliggande Mablabergen.

Däggdjur

nästan 220 däggdjursarter finns i Afrikas Horn, även om endast cirka 20 är endemiska mot hotspot. De mest anmärkningsvärda endemierna är flera antiloparter, inklusive beira (Dorcatragus megalotis), dibatag (Ammodorcas clarkei), hotade Spekes gasell (Gazella spekei) och silver dikdik (Madoqua piacentinii).

hotspot är också hem för den kritiskt hotade Somaliska vilda röven (Equus africanus somaliensis) och öken warthog (Phacochoerus aethiopicus).

hamadryas babian (Papio hamadryas), som hölls helig i forntida Egypten och ofta mumifierade, är idag endemisk mot sluttningarna och sluttningarna som gränsar till södra Röda havet och Adenbukten.

Reptiler

Afrikas Horn högsta nivåer av endemism förekommer bland reptiler, med mer än 90 av cirka 285 arter som inte finns någon annanstans. Hotspot sex endemiska reptil släkten inkluderar Haackgreerius, en monotypisk släkt av skink finns i Somalia, och Aeluroglena, som representeras av en enda art av orm. Hälften av de endemiska släktena är begränsade till Socotra, inklusive de två Haemodracon gecko-arterna och två ormsläkter, Ditypophis och Pachycalamus, representerade av enstaka endemiska arter.

amfibier

till skillnad från reptilerna är amfibier relativt dåligt representerade i Afrikas torra Horn, med nästan 30 arter registrerade, varav minst sex är endemiska. Det finns bara ett enda endemiskt släkt, Lanzarana, som representeras av en art, Lanzas groda (L. largeni) i Somalia. Trots lämpliga livsmiljöer är inga amfibier kända för att existera på Socotra.

sötvattensfiskar

det finns uppskattningsvis 100 arter av sötvattensfisk i Afrikas Horn, varav cirka 10 är endemiska. Dessa endemier inkluderar tre grottboende arter som bara finns i Somalia, varav två—den somaliska blinda barb (Barbopsis Devecchii) och Somaliska grottfisk (Phreatichthys andruzzii)—är blinda.

inga inhemska sötvattensfiskar är kända med säkerhet från Socotra, men populationer av arabisk tandkarp Aphanius dispar har introducerats till vissa vatten som en del av ett anti-malariaprogram.