klassificering av levande organismer kallas taxonomi och syftar till att klassificera levande organismer genom att differentiera dem och upprätta relationer mellan grupper av organismer.

Konungariket levande organismer benämndes som domän av Carl R. Woese 1978.Organismer är grupperade i tre domänsystem, nämligen eukarya, archaea och bakterier, främst på grundval av celltyp. Annat än celltypen, skillnader i rRNA, de tre domänerna skiljer sig åt i membranlipidstruktur, överförings-RNA-molekyler och känslighet för antibiotika står också för klassificering av organismer.

• Domänbakterierna inkluderar alla patogena och icke-patogena prokaryotede har en cellvägg bestående av peptidoglykan och muraminsyra. De har också membranlipider med esterbundna, rakkedjiga fettsyror som liknar eukaryota membranlipider. Bakterier har också plasmider, som är små, dubbelsträngade Dnamolekyler som är extrakromosomala.
• domän archaea inkluderar tre huvudgrupper, nämligen metanogener, extrema halofiler och hypertermofiler. De saknar muraminsyra i cellväggarna.
• Eukarya inkluderar eukaryota organismersom djur, växter, svampar och protistsand har en definierad kärna och membranbundna organeller

det taxonomiska klassificeringsschemat för prokaryoter utarbetas i Bergeys Manual of Systematic Bacteriology som beskriver klassificeringen av prokaryoter i två domäner: bakterier och Archaea.

ytterligare klassificering av domänen är som följer-

• domän
• rike
• Phyla
• klass
• ordning
• familj
• Genus
• arter

binomial (vetenskaplig) nomenklatur tilldelar varje mikrobe 2 namn – Genus – substantiv, alltid kapitaliserad och Art – adjektiv, gemener. Båda är skrivna kursiverade eller understrukna. Fd. Staphylococcus aureus( S. aureus), Escherichia coli (E. coli)

den grundläggande taxonomiska gruppen i mikrobiell taxonomi är arten. Taxonomer som arbetar med högre organismer definierar sina arter annorlunda än mikrobiologister. Prokaryota arter kännetecknas av skillnader i deras fenotyp ochgenotyp. Fenotyp är samlingen av synliga egenskaper och beteendet hos en mikroorganism. Genotyp är den genetiska sammansättningen av en mikroorganism

Bergeys handbok ger klassificeringsschema för bakterier samt en referens för identifiering av olika bakterier i den genetiska sammansättningen laboratoriet. Enligt bergeys manual of determinative bacteriology identifieras bakterierna på grundval av morfologiska egenskaper färgning, biokemiska tester, serologi, G-C-innehåll, DNA-probesoch olika molekylära tester. Förutom de egenskaper som anges i Bergeys är mikroorganismernas källa och livsmiljö också viktigt att tänka på när man identifierar mikroorganismer.

poäng att komma ihåg:

1. taxonomi är vetenskapen som handlar om klassificering av levande organismer på grundval av egenskaper som liknar och skiljer sig från andra organismeroch upprättande av relationer mellan grupper av organismer.
2. Alla levande organismer är grupperade i tre domänsystem, nämligen eukarya, archaea och bakterier, främst på grundval av celltyp.
3. Det taxonomiska klassificeringsschemat för prokaryoter utarbetas i Bergeys Handbok för systematisk bakteriologi enligt vilken prokaryoterna är indelade i två domäner: bakterier och Archaea