de faktiska frekvensberäkningarna beror på artens ploidi för autosomala gener.

MonoploidsEdit

frekvensen (P) för en allel A är fraktionen av antalet kopior (i) av A-allelen och populationen eller provstorleken (N), så

p = i / N . {\displaystyle p=i / N.}

DiploidsEdit

om f ( A A ) {\displaystyle f(\mathbf {AA} )}

, f ( a b ) {\displaystyle f(\mathbf {AB} )}

och f ( b b ) {\displaystyle F(\mathbf {BB} )}

är frekvenserna för de tre genotyperna vid ett locus med två alleler , sedan frekvensen P för a-allel och frekvensen q för B-allelen i befolkningen erhålls genom att räkna alleler. P = f ( A A ) + 1 2 f ( A B ) = frekvens av A {\displaystyle p=f(\mathbf {AA} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{frekvens av a}}}

q = f ( B B ) + 1 2 f ( A B ) = frekvens av b {\displaystyle q=f(\mathbf {bb} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{frekvens av b}}}

eftersom p och Q är frekvenserna för de enda två allelerna som finns på den platsen måste de summeras till 1. För att kontrollera detta:

p + q = f ( A a ) + f ( B B ) + f ( A B ) = 1 {\displaystyle p+q=f(\mathbf {AA} )+f(\mathbf {BB} )+f(\mathbf {AB} )=1}

Q = 1 − p {\displaystyle Q=1-p}

och p = 1 − Q {\displaystyle P=1-Q}

om det finns mer än två olika allelformer är frekvensen för varje allel helt enkelt frekvensen för dess homozygot Plus halva summan av frekvenserna för alla heterozygoter där den visas.

(för 3 alleler, se allel-och genotyp-Allelfrekvenser)

allelfrekvens kan alltid beräknas utifrån genotypfrekvens, medan det omvända kräver att Hardy–Weinberg-förhållandena för slumpmässig parning gäller.

ExampleEdit

Tänk på ett locus som bär två alleler, A och B. I en diploid population finns tre möjliga genotyper, två homozygotiska genotyper (AA och BB) och en heterozygot genotyp (AB). Om vi provar 10 individer från befolkningen, och vi observerar genotypfrekvenserna

1. freq (AA) = 6
2. freq (AB) = 3
3. freq (BB) = 1

då finns det 6 kg 2 + 3 = 15 {\displaystyle 6\gånger 2+3=15}

observerade kopior av A-allelen och 1 kg 2 + 3 = 5 {\displaystyle 1\gånger 2+3=5}

av B-allelen, av 20 totala kromosomkopior. Frekvensen p För A-allelen är p = 15/20 = 0,75 och frekvensen q för B-allelen är q = 5/20 = 0,25.