östrogen spelar en viktig roll vid tillväxt och mognad av ben samt vid reglering av benomsättning hos vuxna ben. Under bentillväxt behövs östrogen för korrekt stängning av epifyseala tillväxtplattor både hos kvinnor och hos män. Även i unga skelett leder östrogenbrist till ökad osteoklastbildning och förbättrad benresorption. I klimakteriet östrogenbrist inducerar cancellous samt kortikal benförlust. Mycket ökad benresorption i cancellöst ben leder till allmän benförlust och förstörelse av lokal arkitektur på grund av penetrerande resorption och mikrofrakturer. I kortikalt ben är det första svaret på östrogenuttag förbättrad endokortisk resorption. Senare ökar också intrakortisk porositet. Dessa leder till minskad benmassa, störd arkitektur och minskad benstyrka. På cellnivå i ben östrogen hämmar differentiering av osteoklaster därmed minska deras antal och minska mängden aktiva remodeling enheter. Denna effekt medieras troligen genom vissa cytokiner, IL – 1 och IL-6 är starkaste kandidater. Östrogen reglerar uttrycket av IL-6 i benmärgsceller med en hittills okänd mekanism. Det är fortfarande osäkert om effekterna av östrogen på osteoblaster är direkta eller beror på kopplingsfenomen mellan benbildning till resorption.