Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas Aprameya IV – J Acad Clin Microbiol
EDITORIAL
Year : 2013 | Volume : 15 | Issue : 2 | Page : 59-61
Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka, India
| Date of Web Publication | 7-Jan-2014 |
Correspondence Address:
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka
India
Source of Support: None, Conflict of Interest: None
DOI: 10.4103/0972-1282.124588
How to cite this article:
Aprameya IV. Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013;15:59-61
How to cite this URL:
Aprameya IV. Bacili Gram-negativi care nu fermentează (NFGNB), alții decât Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013; 15: 59-61. Disponibil de la: https://www.jacmjournal.org/text.asp?2013/15/2/59/124588
| Introducere |  |
non-fermentatorii sunt un grup heterogen de bacili gram-negativi care sunt aerobi, non-sporing, fie nu folosesc carbohidrații ca sursă de energie, fie îi degradează prin alte căi metabolice decât fermentația. Fiind omniprezente în natură, au fost ignorate ca contaminanți probabili, atunci când au fost izolați în laborator. Cu toate acestea, acum au apărut ca agenți patogeni importanți asociați asistenței medicale, deoarece și-au făcut nișa în mediul spitalicesc. Provocările emergente ale rezistenței la mai multe medicamente, atât intrinseci, cât și dobândite printre acestea, reprezintă o preocupare serioasă pentru medicul curant.
Non-fermentatorii reprezintă 15% din toate izolatele bacteriene dintr-un laborator clinic de Microbiologie. Studiile publicate din diferite centre citează rate variate de izolare a non-fermentatorilor, variind de la 2,18% la 45,9%. confuzia taxonomică prevalează deoarece există o revizuire continuă și multe dintre tulpinile identificate nu au atribuit specii desemnate. Acest lucru este agravat de factorii care contribuie la dificultățile de identificare a acestora în laboratorul de Microbiologie Clinică de rutină. Majoritatea speciilor sunt întâlnite rar și, prin urmare, este posibil ca personalul laboratorului să nu fie familiarizat cu multe dintre non-fermentatoare. Multe dintre mediile de cultură convenționale nu sunt potrivite pentru identificarea și controlul calității mass-media poate fi dificil. Multe specii sunt în creștere lentă și biochimic slab sau inert și necesită o experiență considerabilă pentru a interpreta rezultatele echivoce. Sistemele de kituri comerciale disponibile pentru utilizare nu numai că sunt scumpe, dar au adesea o precizie scăzută pentru identificarea anumitor tulpini.
cele mai multe laboratoare clinice de Microbiologie se bazează în principal pe metodele fenotipice de identificare. Acestea pot include sisteme de identificare manuale sau comerciale, cum ar fi API 20NE, Remel N/F, Vitek 2, Microscan Walkaway, sistemul Sensittre AP80, sistemul Phoenix. cu toate acestea, studiile care investighează performanța sistemului de identificare comercială au arătat rezultate contradictorii. Identificarea prin metode fenotipice convenționale poate fi dificilă și consumatoare de timp. Tehnicile de identificare moleculară apar ca alternative pentru metodele de identificare fenotipică. Printre acestea se numără secvențierea genei ARNr 16s și tehnica ADN array (oligonucleotide array) care au fost descrise ca metodă fiabilă și rapidă pentru identificarea bacililor Gram negativi non-fermentatori semnificativi clinic (NFGNB).
lista NFGNB este nesfârșită și dincolo de domeniul de aplicare al acestui articol. Puțini non-fermentatori importanți din punct de vedere clinic, alții decât Pseudomonas, sunt luminați în acest articol.
| genul Acinetobacter | |
după cum reiese din datele noastre în articol special în acest număr, și cele mai multe alte studii, cel mai frecvent non-Pseudomonas non-fermentator recuperate de la probele clinice este Acinetobacter. Clasificat în familia Moraxella mai multe Detaliiceae, acest gen include coccobacili Gram-negativi care nu sunt motili, oxidază negativă și rezistenți la penicilină. Peste 25 de genomospecii au fost recunoscute prin hibridizarea ADN-ADN în cadrul genului și șapte au primit numele formal al speciei. Printre acestea se numără speciile Acinetobacter calcoaceticus, A. baumannii, Acinetobacter genomic species 3 și Acinetobacter genomic species 13tu care au o relație extrem de strânsă și sunt dificil de distins între ele doar prin teste fenotipice. Acestea au fost grupate ca Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex.
A. baumannii este zaharolitic, acidifică majoritatea carbohidraților și demonstrează producția rapidă de acid de la 1% și 10% lactoză. Aceste caracteristici pot fi utilizate pentru identificarea lor prezumtivă în laboratorul de diagnostic de rutină. Complexul A. baumannii reprezintă 80% din infecțiile clinice cauzate de speciile de Acinetobacter și include pneumonie, bacteriemie, meningită, infecții ale tractului urinar (UTI) și infecții ale rănilor, dintre care majoritatea sunt dobândite în spital. ,
Acinetobacterii au apărut ca cei mai de succes agenți patogeni prin capacitatea lor de a supraviețui și de a persista în mediul spitalicesc pentru perioade lungi de timp atât pe suprafețe uscate, cât și pe suprafețe umede. Acest lucru este asistat de capacitatea lor de a crește la o gamă de temperaturi și pH diferite, contribuind astfel la dezvoltarea și persistența focarelor. Compunerea acestei probleme este capacitatea lor de a produce biofilme pe suprafața dispozitivelor medicale.
în acest organism se găsesc mecanisme Multiple de rezistență care au contribuit la apariția rezistenței la medicamente multidrog și pan, provocând o preocupare serioasă pentru medicul curant. ,
interesant, într-un studiu al unei tulpini Acinetobacter rezistente la mai multe medicamente epidemice din Franța, a fost raportată o insulă mare rezistentă la genomică care conține 45 de gene rezistente care au fost dobândite de la alți bacili Gram-negativi. Testarea sensibilității la antibiotice pentru speciile de Acinetobacter este predispusă la probleme, iar rezultatele obținute prin utilizarea diluării standardizate a microbroturilor nu sunt de acord cu cele obținute prin metoda standard de difuzie a discului, în special pentru combinația beta lactamică și inhibitor beta lactamic. Institutul de standarde clinice și de laborator (CLSI) nu definește liniile directoare pentru testarea și interpretarea difuziei discului pentru antibiotice mai noi, cum ar fi tigeciclina și colistina.
| genul Burkholderia | |
Burkholderia cepacia (B. cepacia)
un fitopatogen, B. cepacia a apărut ca o cauză a infecției oportuniste în special la pacienții cu boală granulomatoasă cronică și fibroză chistică. studiile taxonomice au demonstrat că B. cepacia este de fapt un grup de cel puțin nouă genomovari strâns legați. Acestea sunt cel mai frecvent asociate cu epidemii de sindrom Cepacia manifestate prin insuficiență respiratorie progresivă severă și bacteriemie. Complexul B. cepacia a fost izolat din numeroase surse de apă și suprafețe umede, inclusiv soluții de detergent și fluide IV. A fost raportată întreruperea spitalului din cauza contaminării sursei comune a dispozitivelor medicale, cum ar fi nebulizatoarele, dezinfectanții și analizoarele de gaze din sânge.
identificarea B. cepacia în laboratorul clinic poate fi problematică, deoarece nu este un singur fenotip. Sistemele de identificare comercială funcționează prost.
cultura primară din probele clinice poate fi realizată pe medii selective, cum ar fi B. cepacia agar selectiv sau oxidare fermentare polymyxin bacitricin lactoza agar (OFPBL agar) incubate la 35 C timp de 48 de ore. Coloniile apar galbene datorită utilizării lactozei. Izolatul este slab oxidază pozitivă, hidrolizează lizina și este rezistent la polimixina B și aminoglicozide, dar sensibil la Co-trimoxazol.
tratamentul de alegere este Co-trimoxazol. CLSI sugerează testarea in vitro pentru ceftazidimă, Meropenem, minociclină (tetraciclină) și Co-trimoxazol.
Burkholderia pseudomallei (B.pseudomallei)
un agent cauzator de Melioidoză, B. pseudomallei este un agent patogen din grupa de pericol 3, iar siguranța lucrătorului de laborator este de primă importanță în timpul manipulării acestui organism.
B. pseudomallei trebuie luată în considerare la pacienții cu pneumonie, sepsis sau abces cu antecedente de călătorie în Asia de Sud-Est sau Australia de Nord. Organismul nu este greu de izolat în mediile de rutină. Cu toate acestea, variația morfologiei coloniei poate fi observată. Poate crește la 42 de centi C. frotiurile colorate Gram din probele clinice prezintă un model de colorare bipolară. Izolarea organismului de locurile nesterile necesită utilizarea unui mediu selectiv, mediul Ashdown, care prezintă colonii violete sau violete încrețite după 48 de ore. Un oxidază pozitiv motil gram negativ bacili care, pot fi identificate prin antibiograma sale caracteristice care prezintă rezistență constitutivă la polimixină și gentamicină, dar sensibile la Co-amoxiclavulanic acid, tetraciclină și cloramfenicol. Kiturile comerciale se identifică bine, dintre care API 20NE este cel mai bine validat. Stenotrophomonas maltophilia este al treilea cel mai frecvent întâlnit non-fermentator în practica clinică. Fiind omniprezent în natură, poate coloniza tractul respirator la pacienții spitalizați și poate provoca infecții nosocomiale, cum ar fi CRBSI (infecții asociate fluxului sanguin prin cateter) și pneumonie, în special la pacienții cu malignitate hematologică.
produce colonii de culoare galben pal până la verde lavandă pe agar de sânge. Este un bacil oxidazic negativ, motil, care este caracteristic rezistent la Imipenem (Carbapenem), dar sensibil la colistină, polimixină, cotrimoxazol, minociclină și levofloxacină. Este un oxidant puternic de maltoză fiind lizină și Dnaază pozitivă. Majoritatea kiturilor comerciale sunt capabile să identifice acest organism.
cu toate acestea, trebuie să fiți atenți în timp ce citiți și interpretați testele de sensibilitate la antibiotice. Au fost observate puncte finale finale în testele de diluare a agarului și a bulionului și au apărut citiri fals sensibile cu testul de difuzie a discului pentru gentamicină și ciprofloxacină. În mod similar, studiile care utilizează testul E au observat prezența unor micro colonii mici sau o ceață de creștere translucidă în zona de inhibare, care, dacă este ratată, ar putea duce la rezultate fals sensibile.
CLSI sugerează următoarele antibiotice pentru a fi testate pentru Stenotrophomonas maltophilia. Cotrimoxazol (medicament de alegere), ceftazidimă, levofloxacină, minociclină, cloramfenicol și ticarcilină. MIC prin diluarea bulionului este recomandată pentru testarea ceftazidimei, cloramfenicolului și ticarcilinei, deoarece metoda de difuzie a discului nu este fiabilă.
Chryseobacterium meningosepticum (Elizabethkingia meningosepticum)
deși rar, este important să se identifice acest organism, deoarece poate provoca focare în unitățile de pepinieră și este asociat cu rate ridicate de mortalitate (50%). Un saprofit de sol, poate contamina articolele de îngrijire a pacientului, ducând la meningită neonatală sau sepsis.
organismul produce colonii pigmentate galben pal pe Agar de sânge, care poate dura mai mult de 24 de ore pentru a crește. Este o tijă non-motilă, Gram-negativă, adică oxidază pozitivă, indol pozitivă, hidrolizează esculina și gelatina și demonstrează un test ONPG pozitiv. Izolatul este susceptibil la penicilină, vancomicină, cotrimoxazol și fluorochinolone. ,
acest organism are două tipuri de beta-lactamaze: beta lacatamaze cu spectru extins (ESBL) și metallo beta lactamaze (MBL) care conferă rezistență la cefalosporine și carbapeneme. Prin urmare, antibioticele utilizate în tratamentul infecției Gram-negative nu pot fi utilizate pentru tratarea infecțiilor cu Chryseobacterium. Trebuie efectuate CMI pentru vancomicină pe izolate semnificative clinic. Testele de difuzie a discului nu sunt fiabile.
| concluzie | |
toate laboratoarele de microbiologie clinică trebuie să fie orientate pentru a identifica cu exactitate non-fermentatorii, iar semnificația clinică a unui izolat trebuie determinată de la caz la caz. Identificarea precisă este importantă pentru gestionarea optimă a pacientului, prognosticul și intervenția adecvată de control al infecției. Tipul de sistem de identificare utilizat de laborator trebuie lăsat la latitudinea microbiologului clinic. Cu toate acestea, este esențial să se asigure că calitatea și performanța sistemelor sunt validate periodic.
|
samanta p, Gautam v, Thapar r, Ray P. Rezistența emergentă a bacililor gram negativi care nu fermentează într-un centru de îngrijire terțiară. Indian J Pathol Microbiol 2011; 54: 666-7.   |
|
| Deepak J, Rajat P, Shamanth AS, Munesh S, Vikrant N, Neelam S. prevalența bacililor gram negativi care nu fermentează și modelul lor de susceptibilitate in vitro într-un spital de îngrijire terțiară din Uttarakhand: un studiu din dealurile picioarelor din Himalaya. SJHS 2013; 2:108-12.
|
|
| Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Issued by the Standards Unit, Microbiology Services Division, HPA Bacteriology. Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Identification/ID17/Issue 2.1/Oct 2011:1-20.
|
|
| Koneman EW. The non fermentative gram negative bacilli. In: Atlas de culoare și Manual de Microbiologie diagnostică. Lippincott Wilkins și Williams. A 6-a ed; 2006. p. 303-76.
|
|
| Su SC, Vanceechoutte M, Dijkshoom L, Wei YF, Leichen Y, Chang TC. Identificarea bacteriilor gram negative care nu fermentează de importanță clinică printr-o matrice de olignonucleotide. J Med Microbiol 2009; 58: 596-605.
|
|
| Manchand V, Sanchaita S, suspin NP. Multidrug resistant acinetobacter. J Glob Infect Dis 2010;2:291-304.
|
|
| Lee HW, Koh YM, Kim J, Lee JC, Lee JC, Seol SY, et al. Capacity of multidrug resistant clinical isolates of Acinetobacter baumannii to form biofilm and adhere to epithelial cell surfaces. Clin Microbiol Infect 2008;14:49-54. |
|
| Singh NT, Singh M, Sharma M. Emergence of tigecycline and colistin resistant Acinetobacter baumanii in patients with complicated urinary tract infections in north India. Indian J Med Res 2011;133:681-4. |
|
| Maragakis LL, Perl TM. Acinetobacter baumannii: Epidemiology, antimicrobial resistance, and treatment options. Clin Infect Dis 2008;46:1254-63. |
|
| CLSI. Standarde de performanță pentru testarea sensibilității antimicrobiene; douăzeci și treilea supliment Informațional. Clin Lab Stand Inst 2013; 33:66-8.
|
|
| Hung PP, Lin YH, lin CF, Liu MF, Shi ZY. Infecția cu Chryseobacterium meningosepticum: susceptibilitatea la antibiotice și factorii de risc pentru mortalitate. J Microbiol Immunol Infect 2008; 41:137-44. |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
Leave a Reply