Articles

Frecvența alelelor

by admin

calculele reale ale frecvenței depind de ploidia speciei pentru genele autozomale.

MonoploidsEdit

frecvența (p) unei alele A este fracțiunea numărului de copii (i) ale alelei A și populația sau mărimea eșantionului (N), deci

p = i / n . {\displaystyle p = i / N.}

{\displaystyle p = i/N.}

DiploidsEdit

Dacă f ( A A ) {\displaystyle f(\mathbf {AA} )}

f(\mathbf{AA})

, f ( A B ) {\displaystyle f(\mathbf {AB} )}

F(\mathbf{AB})

, și F ( B B ) {\displaystyle F(\mathbf {BB} )}

F(\mathbf{BB})

sunt frecvențele celor trei genotipuri la un locus cu două alele, apoi frecvența p a lui a-alela și frecvența q a alelei B din populație sunt obținute prin numărarea alelelor. p = f ( A A ) + 1 2 f ( A B ) = frecvența unui {\displaystyle p=f(\mathbf {AA} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{frecvența unui}}}

p=f(\mathbf{AA})+ \frac{1}{2}f(\mathbf{AB})= \mbox{frecvența de a}

q = f ( b b ) + 1 2 f ( A B ) = frecvența de b {\displaystyle q=f(\mathbf {BB} )+{\frac {1}{2}}F(\mathbf {AB} )={\mbox{frecvența de B}}}

q=f(\mathbf{BB})+ \frac{1}{2}} F(\mathbf{AB})= {\mbox {frecvența de B}}{1} {2} f (\mathbf {AB}) = \ mbox {frecvența lui B}

deoarece p și Q sunt frecvențele singurelor două alele prezente la acel Locus, ele trebuie să însumeze 1. Pentru a verifica acest lucru:

p + q = f ( A A ) + f ( B B ) + f ( A B ) = 1 {\displaystyle p+q=f(\mathbf {AA} )+f(\mathbf {Bb} )+f(\mathbf {AB} )=1}

p+q=f(\mathbf{AA})+f(\mathbf{BB})+f(\mathbf{BB}) \mathbf {ab})=1

Q = 1 − p {\displaystyle q=1-p}

Q=1-p

și p = 1 − Q {\displaystyle P=1-Q}

P=1-Q

dacă există mai mult de două forme alelice diferite, frecvența pentru fiecare alelă este pur și simplu frecvența homozigotului său plus jumătate din suma frecvențelor pentru toți heterozigoții în care apare.

(pentru 3 alele vezi alele alele și frecvențele genotipului)

frecvența alelelor poate fi întotdeauna calculată din frecvența genotipului, în timp ce inversul necesită aplicarea condițiilor Hardy–Weinberg de împerechere aleatorie.

exemplu

luați în considerare un locus care poartă două alele, A și B. Într-o populație diploidă există trei genotipuri posibile, două genotipuri homozigote (AA și BB) și un genotip heterozigot (AB). Dacă eșantionăm 10 indivizi din populație și observăm frecvențele genotipului

  1. freq (AA) = 6
  2. freq (AB) = 3
  3. freq (BB) = 1

atunci sunt 6 XQT 2 + 3 = 15 {\displaystyle 6\times 2+3=15}

6\times2 + 3 = 15

copii observate ale alelei a și 1 2 + 3 = 5 {\displaystyle 1\times 2+3=5}

1\times2 + 3 = 5

ale alelei B, din totalul de 20 de copii cromozomiale. Frecvența p a alelei A este p = 15/20 = 0,75, iar frecvența q A alelei B este q = 5/20 = 0,25.