Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas Aprameya IV – J Acad Clin Microbiol
EDITORIAL
Year : 2013 | Volume : 15 | Issue : 2 | Page : 59-61
Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka, India
| Date of Web Publication | 7-Jan-2014 |
Correspondence Address:
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka
India
Source of Support: None, Conflict of Interest: None
DOI: 10.4103/0972-1282.124588
How to cite this article:
Aprameya IV. Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013;15:59-61
How to cite this URL:
Aprameya IV. Bacilli Gram-negativo não fermentado (NFGNB), com excepção de Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013; 15:59-61. Disponível a partir de: https://www.jacmjournal.org/text.asp?2013/15/2/59/124588
| Introdução |  |
Não os fermentadores são um grupo heterogéneo, de bacilos Gram-negativos, que são aeróbio, não-sporing, ou não utilizar carboidratos como fonte de energia ou degradar-los através de vias metabólicas outros do que a fermentação. Sendo onipresentes na natureza, foram desconsiderados como possíveis contaminantes, quando isolados no laboratório. No entanto, eles têm agora emergido como patógenos associados aos cuidados de saúde importantes como eles têm feito seu nicho no ambiente hospitalar. Os desafios emergentes da resistência multi-drogas, tanto intrínseca como adquirida entre eles, são de grande preocupação para o médico assistente.
Os Não fermentadores representam 15% de todos os isolados bacterianos de um laboratório de Microbiologia Clínica. Estudos publicados de vários centros citam taxas de isolamento variadas de não fermentadores que variam de 2,18% a 45,9%. a confusão taxonômica prevalece, pois há uma revisão contínua e muitas das estirpes identificadas não possuem nenhuma espécie designada. Isto é agravado pelos fatores que contribuem para as dificuldades em identificá-los no laboratório de Microbiologia Clínica de rotina. A maioria das espécies são encontradas com pouca frequência e, portanto, o pessoal do laboratório pode não estar familiarizado com muitos dos não fermentadores. Muitos dos meios de cultura convencionais não são adequados para identificação e controle de qualidade dos meios de comunicação podem ser difíceis. Muitas espécies estão em crescimento lento e bioquímicamente fracas ou inertes e requerem uma experiência considerável para interpretar resultados equívocos. Os sistemas de kit comercial que estão disponíveis para uso não são apenas caros, mas também muitas vezes têm baixa precisão para a identificação de certas estirpes. a maioria dos laboratórios de Microbiologia Clínica dependem principalmente dos métodos fenotípicos de identificação. Estes podem incluir sistemas de identificação manual ou comercial, como API 20NE, Remel N/F, Vitek 2, Microscan Walkaway, Sensitre AP80 system, Phoenix system.
No entanto, estudos investigando o desempenho do sistema de identificação comercial têm mostrado resultados contraditórios. A identificação por métodos fenotípicos convencionais pode ser difícil e demorado. As técnicas de identificação Molecular estão a emergir como alternativas para os métodos de identificação fenotípica. Entre essas técnicas estão a sequenciação de genes rRNA 16s e a matriz de DNA (oligonucleotídeos array) que têm sido descritas como um método confiável e rápido para a identificação de bacilli gram negativo (NFGNB) não fermentante clinicamente significativo.
a lista de NFGNB é interminável e além do escopo deste artigo. Alguns não fermentadores clinicamente importantes encontrados com frequência, além de Pseudomonas, são altamente iluminados neste artigo.
| Gênero Acinetobacter | |
Como evidenciado pelos nossos dados, em especial do artigo desta edição, e a maioria dos outros estudos, o mais comum não-Pseudomonas não-fermentador recuperados a partir de amostras clínicas é Acinetobacter. Classificado na família Moraxella More Detailsceae, este género inclui Coccobacilli Gram-negativo que não são móveis, oxidase negativa e resistente à penicilina. Mais de 25 genomospécies foram reconhecidas pela hibridação ADN-ADN dentro do género e sete receberam o nome formal da espécie. Entre estas estão as espécies Acinetobacter calcoaceticus, A. baumannii, Acinetobacter genomic species 3 e Acinetobacter genomic species 13TU que têm uma relação extremamente próxima e são difíceis de distinguir entre si por testes fenotípicos sozinhos. Foram agrupados como Complexo Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii. baumannii é sacarolítico, acidifica a maioria dos carboidratos e demonstra a rápida produção de ácido a partir de 1% e 10% de lactose. Estas características podem ser utilizadas para a sua identificação presumível no laboratório de diagnóstico de rotina. O complexo baumannii é responsável por 80% das infecções clínicas causadas por espécies de Acinetobacter e inclui pneumonia, bacteriemia, meningite, infecção do tracto urinário (itu) e infecções de feridas, a maioria das quais adquiridas em hospitais. Acinetobacters têm emergido como os patógenos mais bem sucedidos por sua capacidade de sobreviver e persistir no ambiente hospitalar por longos períodos de tempo, tanto em superfícies secas e úmidas. Isto é assistido por sua capacidade de crescer em uma gama de diferentes temperaturas e pH, contribuindo assim para o desenvolvimento e persistência de surtos. A composição deste problema é a sua capacidade de produzir biofilmes na superfície dos dispositivos médicos. múltiplos mecanismos de resistência são encontrados neste organismo que têm contribuído para o surgimento de multidrogas e resistência pan-antidrogas, causando uma séria preocupação para o médico. , curiosamente, num estudo de uma estirpe de Acinetobacter multidrug resistente à epidemia em França, foi relatada uma grande ilha resistente ao genoma contendo 45 genes resistentes que foram adquiridos a partir de outros bacilos Gram-negativos. Os testes de susceptibilidade aos antibióticos para as espécies de Acinetobacter são propensos a problemas e os resultados obtidos através da diluição de microbrotos padronizada não estão de acordo com os obtidos pelo método padrão de difusão em disco, particularmente para a combinação de beta-lactame e inibidores de beta-lactam. The clinical and laboratory standards institute (CLSI) does not definite the guidelines for disk diffusion testing and interpretation for newer antibiotics like Tigecycline and Colistin.
| Gênero Burkholderia | |
Burkholderia cepacia (B. cepacia)
Um fitopatogênicos, B. cepacia surgiu como uma causa de infecção oportunista, particularmente em pacientes com doença granulomatosa crônica e fibrose cística. estudos taxonômicos demonstraram que b. cepacia é na verdade um conjunto de pelo menos nove genomovares intimamente relacionados. Estão mais frequentemente associados a epidemias de “síndrome de Cepacia” manifestadas por insuficiência respiratória progressiva grave e bacteriemia. B. O complexo cepacia foi isolado de numerosas fontes de água e superfícies húmidas, incluindo soluções de detergente e fluidos IV. Foram relatadas quebras de hospitais devido à contaminação de fontes comuns de dispositivos médicos, como nebulizadores, desinfectantes e analisadores de gases sanguíneos. a identificação de B. cepacia no laboratório clínico pode ser problemática porque não é um único fenótipo. Os sistemas de identificação comercial funcionam mal. a cultura primária a partir de amostras clínicas pode ser realizada em meios seletivos como o ágar seletivo de B. cepacia ou o ágar de lactose polimixina por oxidação (ágar de lactose OFPBL) incubado a 35°C durante 48 horas. As colónias parecem amarelas devido à utilização de lactose. O isolado é fracamente oxidase positivo, hidrolisa lisina e é resistente à polimixina B e aminoglicosidos, mas sensível ao cotrimoxazol. o tratamento de escolha é o cotrimoxazol. CLSI sugere testes in vitro para Ceftazidima, Meropenem, minociclina (tetraciclina) e cotrimoxazol. Burkholderia pseudomallei (B.pseudomallei)
Um agente causador da melioidose, B. pseudomallei é um agente patogénico do grupo de perigo 3 e a segurança do trabalhador laboratorial é de primordial importância durante a manipulação deste organismo.
B. pseudomallei deve ser considerado em doentes com pneumonia, sépsis ou abcesso com história de viagem ao sudeste asiático ou ao norte da Austrália. O organismo não é difícil de isolar em meios de rotina. No entanto, pode ser observada variação na morfologia das Colónias. Pode crescer a 42 ° C. manchas manchadas de grama de amostras clínicas mostram um padrão de coloração bipolar. O isolamento do organismo a partir de locais não esterilizados requer a utilização de um meio selectivo, o meio de Ashdown, que apresenta colónias roscas de violeta ou púrpura após 48 horas. Um bacili gram positivo de oxidase que, pode ser identificado por seu antibiograma característico mostrando resistência constitutiva à polimixina e gentamicina, mas sensível ao ácido Co-amoxiclavulânico, tetraciclina e cloranfenicol. Kits comerciais identificam bem, dos quais API 20NE é o melhor validado. Stenotrophomonas maltophilia é o terceiro não-fermentador mais comumente encontrado na prática clínica. Sendo omnipresente por natureza, pode colonizar o tracto respiratório em doentes hospitalizados e causar infecções nosocomiais tais como CRBSI (infecções associadas ao cateter na corrente sanguínea), e pneumonia particularmente em doentes com malignidade hematológica.produz colónias de amarelo pálido a verde lavanda em ágar de sangue. É um bacillus da mobilidade que é caracteristicamente resistente ao Imipenem (Carbapenem), mas sensível à colistina, polimixina, cotrimoxazol, minociclina e levofloxacina. É um oxidante maltose forte sendo lisina e DNAase positivo. A maioria dos kits comerciais são capazes de identificar este organismo.
No entanto, deve-se ter cuidado ao ler e interpretar os testes de sensibilidade a antibióticos. Foram observados pontos finais em ensaios de diluição do ágar e de diluição do caldo e ocorreram leituras falsamente sensíveis com o doseamento de difusão do disco para a gentamicina e a ciprofloxacina. Da mesma forma, estudos que utilizaram o teste E observaram a presença de micro-colónias minúsculas ou uma névoa de crescimento translúcido dentro da área de inibição, o que, se não for detectado, poderá conduzir a resultados falsamente sensíveis.
CLSI sugere os seguintes antibióticos a serem testados para Estenotrophomonas maltophilia. Cotrimoxazol (medicamento de escolha), Ceftazidima, levofloxacina, minociclina, cloranfenicol e ticarcilina. A diluição MIC por caldo é recomendada para testar Ceftazidima, cloranfenicol e ticarcilina, uma vez que o método de difusão de disco não é fiável. apesar de raro, é importante identificar este organismo pois pode causar surtos em unidades de creche e está associado com altas taxas de mortalidade (50%). Uma saprófita do solo, pode contaminar artigos de cuidados do paciente resultando em meningite neonatal ou sépsis.o organismo produz colónias pigmentadas de amarelo pálido no Ágar do sangue, que pode levar mais de 24 horas a crescer. É uma haste Não-móvel, Gram-negativa, ou seja, oxidase positiva, indole positiva, hidrolisados aesculina e gelatina e demonstra um teste ONPG positivo. O isolado é suscetível à penicilina, vancomicina, cotrimoxazol e fluoroquinolonas. ,
Este organismo tem dois tipos de beta-lactamases: extended spectrum beta lacatamases (BLLE) e metalo beta-lactamases (MBLs) que conferem resistência às Cefalosporinas e Carbapenems. Por conseguinte, os antibióticos utilizados no tratamento de infecções Gram-negativas não podem ser utilizados no tratamento de infecções por Criseobacterium. Devem ser realizados MICs para a vancomicina em isolados clinicamente significativos. Os testes de difusão do disco não são fiáveis.
| Conclusão | |
Todos os laboratórios de microbiologia clínica deve ser orientada para identificar com precisão o não fermentadores e significado clínico de um isolado deve ser determinada caso a caso. A identificação precisa é importante para uma gestão óptima do doente, prognóstico e intervenção adequada no controlo de infecções. O tipo de Sistema de identificação utilizado pelo laboratório deve ser deixado ao critério do microbiologista clínico. No entanto, é essencial garantir que a qualidade e o desempenho dos sistemas sejam validados periodicamente.
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