rzeczywiste obliczenia częstości zależą od ploidy gatunku dla genów autosomalnych.

Monoploidyedytuj

częstość (p) allelu a jest ułamkiem liczby kopii (i) allelu a i populacji lub wielkości próby (N), więc

p = i / N. {\displaystyle p = i / N.}

DiploidsEdit

If F ( A A ) {\displaystyle f(\mathbf {AA})}

, f ( A B ) {\displaystyle f(\mathbf {AB})}

I F ( B B ) {\displaystyle f(\mathbf {BB})}

są częstotliwościami trzech genotypów w locus z dwoma allelami , a następnie częstotliwością P z a-allel i częstość Q allelu B w populacji uzyskuje się przez liczenie alleli. p = f ( A A ) + 1 2 F ( A B ) = Częstotliwość A {\displaystyle p=F(\mathbf {AA} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{częstotliwość a}}}

Q = F ( B B ) + 1 2 F ( A B ) = frequency of B {\displaystyle q=f(\mathbf {BB} )+{\frac {1}{2}}F(\mathbf {AB} )={\mbox{frequency of B}}}

ponieważ p i q są częstotliwościami tylko dwóch alleli obecnych w tym locus, muszą one sumować się do 1. Aby to sprawdzić:

p + q = f ( A A ) + f ( B B ) + f ( A B ) = 1 {\displaystyle p+q=f(\mathbf {AA} )+f(\mathbf {Bb} )+f(\mathbf {AB} )=1}

Q = 1 − p {\displaystyle Q=1-p}

i p = 1 − Q {\displaystyle P=1-Q}

Jeśli istnieje więcej niż dwie różne formy alleliczne, częstotliwość dla każdego allelu jest po prostu częstotliwością jego homozygoty plus połowa sumy częstotliwości dla wszystkich heterozygotów, w których się pojawia.

(dla 3 alleli patrz Allele i częstość genotypu)

częstość alleli zawsze można obliczyć na podstawie częstości genotypu, natomiast odwrotność wymaga zastosowania warunków Hardy ’ ego–Weinberga przypadkowego kojarzenia.

Przykładedit

rozważmy locus, który nosi dwa allele, A I B. w populacji diploidalnej istnieją trzy możliwe genotypy, dwa homozygotyczne genotypy (AA i BB) i jeden heterozygotyczny genotyp (AB). Jeśli pobierzemy próbkę 10 osób z populacji i zaobserwujemy częstotliwości genotypu

1. freq (AA) = 6
2. freq (AB) = 3
3. freq (BB) = 1

to jest 6 × 2 + 3 = 15 {\displaystyle 6\times 2+3=15}

zaobserwowane kopie allelu a i 1 × 2 + 3 = 5 {\displaystyle 1\times 2+3=5}

allelu B, spośród 20 wszystkich kopii chromosomu. Częstotliwość p allelu A wynosi P = 15/20 = 0,75, A Częstotliwość Q allelu B wynosi q = 5/20 = 0,25.