EDITORIAL

Year : 2013 | Volume : 15 | Issue : 2 | Page : 59-61

Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka, India

Correspondence Address:
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka
India

Source of Support: None, Conflict of Interest: None

Check

DOI: 10.4103/0972-1282.124588

How to cite this article:
Aprameya IV. Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013;15:59-61

How to cite this URL:
Aprameya IV. Niet-fermenterende Gram-negatieve bacillen (NFGNB) anders dan Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013 ;15:59-61. Beschikbaar bij: https://www.jacmjournal.org/text.asp?2013/15/2/59/124588

Introduction

niet-fermentoren zijn een heterogene groep gramnegatieve bacillen die aërobe, niet-sporend zijn, geen koolhydraten als energiebron gebruiken of ze via andere metabole routes dan fermentatie afbreken. Omdat ze alomtegenwoordig zijn in de natuur, werden ze genegeerd als waarschijnlijke verontreinigingen, wanneer geïsoleerd in het laboratorium. Echter, ze zijn nu naar voren als belangrijke gezondheidszorg geassocieerde pathogenen als ze hun niche in het ziekenhuis omgeving hebben gemaakt. Opkomende uitdagingen van multi-drug resistentie, zowel intrinsieke als verworven onder hen is van ernstige zorg voor de behandelend arts. niet-fermentoren zijn goed voor 15% van alle bacteriële isolaten uit een klinisch microbiologisch laboratorium. Gepubliceerde studies uit verschillende centra vermelden uiteenlopende isolatiesnelheden van niet-fermentoren, variërend van 2,18% tot 45,9%. Taxonomische verwarring heerst omdat er een voortdurende revisie plaatsvindt en veel van de geïdentificeerde stammen geen aangewezen soorten hebben toegewezen. Dit wordt samengesteld door de factoren die tot de moeilijkheden bij het identificeren van hen in het routine klinische microbiologielaboratorium bijdragen. De meeste soorten worden zelden aangetroffen en daarom is het laboratoriumpersoneel misschien niet bekend met veel van de niet-fermentoren. Veel van de conventionele kweekmedia zijn niet geschikt voor identificatie en kwaliteitscontrole van media kan moeilijk zijn. Veel soorten groeien langzaam en biochemisch zwak of inert en vereisen veel ervaring om onduidelijke resultaten te interpreteren. Commerciële kitsystemen die beschikbaar zijn voor gebruik zijn niet alleen duur, maar hebben ook vaak een lage nauwkeurigheid voor de identificatie van bepaalde stammen. de meeste klinische microbiologische laboratoria vertrouwen voornamelijk op de fenotypische identificatiemethoden. Deze kunnen handmatige of commerciële kit / geautomatiseerde identificatiesystemen omvatten, zoals API 20NE, Remel N / F, Vitek 2, Microscan Walkaway, het Sensitre AP80-systeem, het Phoenix-systeem. studies naar de prestaties van het commerciële identificatiesysteem hebben echter tegenstrijdige resultaten opgeleverd. Identificatie met conventionele fenotypische methoden kan moeilijk en tijdrovend zijn. Moleculaire identificatietechnieken komen in opkomst als alternatief voor fenotypische identificatiemethoden. Onder deze zijn 16s rRNA gen het rangschikken en de array van DNA (oligonucleotide array) techniek die als betrouwbare en snelle methode voor identificatie van klinisch significante niet-fermenterende gramnegatieve bacillen (NFGNB) zijn beschreven.

de lijst van NFGNB is eindeloos en valt buiten het bereik van dit artikel. Weinig algemeen voorkomende klinisch belangrijke niet fermentoren anders dan Pseudomonas zijn hoog verlicht in dit artikel.

Genus Acinetobacter

Speciaal artikel in dit nummer, en de meeste andere studies, de meest voorkomende niet-Pseudomonas niet-fermenter teruggevonden van klinische specimens is Acinetobacter. Ingedeeld onder de familie Moraxella meer Detailsceae, dit geslacht omvat Gram-negatieve coccobacilli die niet-motiel, oxidase negatief en resistent zijn tegen penicilline. Meer dan 25 genomospecies zijn erkend door DNA-DNA hybridisatie binnen het geslacht en zeven hebben een formele soortnaam gekregen. Onder deze soorten zijn Acinetobacter calcoaceticus, A. baumannii, Acinetobacter genomic species 3 en Acinetobacter genomic species 13TU die een extreem nauwe relatie hebben en moeilijk van elkaar te onderscheiden zijn door alleen fenotypische tests. Ze zijn gegroepeerd als Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex. A. baumannii is saccharolytisch, verzuurt de meeste koolhydraten en toont de snelle aanmaak van zuur uit 1% en 10% lactose. Deze kenmerken kunnen worden gebruikt voor hun vermoedelijke identificatie in het routine diagnostisch laboratorium. A. baumannii complex is verantwoordelijk voor 80% van de klinische infecties veroorzaakt door Acinetobacter species, en omvat pneumonie, bacteriëmie, meningitis, urineweginfectie (UTI) en wondinfecties, waarvan de meeste in het ziekenhuis zijn verworven. Acinetobacters zijn naar voren gekomen als de meest succesvolle ziekteverwekkers door hun vermogen om te overleven en aan te houden in de ziekenhuisomgeving gedurende langere perioden, zowel in droge als vochtige oppervlakken. Dit wordt geholpen door hun vermogen om bij een waaier van verschillende temperaturen en pH te groeien, waardoor tot de ontwikkeling en de persistentie van uitbraken wordt bijgedragen. Compounding dit probleem is hun vermogen om biofilms te produceren op het oppervlak van medische apparaten. er worden meerdere resistentiemechanismen gevonden in dit organisme die hebben bijgedragen tot het ontstaan van resistentie tegen meerdere geneesmiddelen en pan-geneesmiddelen, waardoor de behandelend arts zich ernstig zorgen maakt. interessant is dat in een studie van een epidemische multidrug-resistente Acinetobacter stam in Frankrijk, een groot genomisch resistent eiland met 45 resistente genen die zijn verkregen uit andere gramnegatieve bacillen is gemeld. Antibiotische gevoeligheidstesten voor Acinetobacter-soorten zijn probleemgevoelig en de resultaten die worden verkregen door gebruik te maken van gestandaardiseerde microbrothverdunning komen niet overeen met de resultaten die worden verkregen door standaarddiskdiffusiemethode, in het bijzonder voor de combinatie van bèta-lactam en bèta-lactam-remmers. Het clinical and laboratory standards institute (CLSI) definieert niet de richtlijnen voor disk diffusie testen en interpretatie voor nieuwere antibiotica zoals Tigecycline en colistine.

Genus Burkholderia

Burkholderia cepacia (B. cepacia)
Een fytopathogeen, B. cepacia is naar voren gekomen als een oorzaak van opportunistische infecties, met name bij patiënten met chronische granulomateuze ziekte en cystische fibrose. Taxonomische studies hebben aangetoond dat B. cepacia in feite een cluster is van ten minste negen nauw verwante genomovars. Ze worden het vaakst geassocieerd met epidemieën van het ‘cepacia-syndroom’ die zich manifesteren als ernstig progressief respiratoir falen en bacteriëmie. B. cepacia complex is geïsoleerd uit talrijke waterbronnen en natte oppervlakken, waaronder reinigingsoplossingen en IV-vloeistoffen. Hospital out break als gevolg van gemeenschappelijke bron besmetting van medische apparaten zoals vernevelaars, desinfectiemiddelen en bloedgas analyzers is gemeld. de identificatie van B. cepacia in het klinisch laboratorium kan problematisch zijn omdat het geen enkel fenotype is. Commerciële identificatiesystemen presteren slecht. primaire cultuur van klinische specimens kan worden uitgevoerd op selectieve media zoals B. cepacia selectieve agar of oxidatie fermentatie polymyxine bacitricine lactose agar (OFPBL agar) geïncubeerd bij 35°C gedurende 48 uur. Kolonies lijken geel door het gebruik van lactose. Het isolaat is zwak oxidasepositief, hydrolyseert lysine en is resistent tegen polymyxine B en aminoglycosiden, maar gevoelig voor Co-trimoxazol. de voorkeursbehandeling is Co-trimoxazol. CLSI stelt in vitro testen voor ceftazidim, Meropenem, Minocycline (tetracycline) en Co-trimoxazol voor. Burkholderia pseudomallei (B.pseudomallei)
een causatief agens van Melioïdose, B. pseudomallei is een pathogeen van risicogroep 3 en de veiligheid van de laboratoriummedewerker is van het grootste belang bij het omgaan met dit organisme. pseudomallei dient overwogen te worden bij patiënten met pneumonie, sepsis of abces met een reisgeschiedenis naar Zuidoost-Azië of Noord-Australië. Het organisme is niet moeilijk te isoleren in routine media. Er kan echter variatie in de morfologie van de kolonie worden waargenomen. Het kan groeien bij 42°C. Gram-bevlekte uitstrijkjes van klinische specimens vertonen een bipolair kleuringspatroon. Isolatie van het organisme van niet-steriele locaties vereist het gebruik van een selectief medium, het medium van de Ashdown, dat na 48 uur ruwe gerimpelde violette of paarse kolonies vertoont. Een oxidasepositieve motielgramnegatieve bacillen die kunnen worden geïdentificeerd aan de hand van het kenmerkende antibiogram dat constitutieve resistentie tegen polymyxine en gentamicine toont, maar gevoelig is voor Co-amoxyclavulaanzuur, Tetracycline en chlooramfenicol. Commerciële kits identificeren goed, waarvan API 20NE de best gevalideerde is. Stenotrophomonas maltophilia het is de derde meest voorkomende niet-fermenter in de klinische praktijk. Omdat het alomtegenwoordig van aard is, kan het de luchtwegen koloniseren bij gehospitaliseerde patiënten en nosocomiale infecties veroorzaken zoals CRBSI (katheter-geassocieerde bloedstroominfecties) en pneumonie, in het bijzonder bij patiënten met hematologische maligniteit.het produceert lichtgele tot lavendelgroene kolonies op bloedagar. Het is een oxidase-negatieve, motiele bacil die kenmerkend resistent is tegen Imipenem (Carbapenem), maar gevoelig is voor colistine, polymyxine, cotrimoxazol, Minocycline en levofloxacine. Het is een sterke maltose-oxidator die lysine-en DNAase-positief is. De meeste commerciële kits kunnen dit organisme identificeren.

men dient echter voorzichtig te zijn bij het lezen en interpreteren van de antibioticagevoeligheidstesten. Bij agarverdunning-en bouillonverdunningstesten zijn achterliggende eindpunten waargenomen en bij gentamicine en Ciprofloxacine zijn vals gevoelige metingen met diskdiffusietest gedaan. Evenzo, hebben de studies gebruikend e-test de aanwezigheid van uiterst kleine microkolonies of een waas van doorschijnende groei binnen het gebied van remming opgemerkt, die indien gemist tot valselijk gevoelig resultaat zou kunnen leiden. clsi stelt voor de volgende antibiotica te testen op Stenotrophomonas maltophilia. Cotrimoxazol( geneesmiddel naar keuze), Ceftazidime, Levofloxacine, Minocycline, chlooramfenicol en ticarcilline. MIC door bouillon verdunning wordt aanbevolen voor het testen van ceftazidim, chlooramfenicol en ticarcilline, omdat de diskdiffusiemethode onbetrouwbaar is.
Chryseobacterium meningosepticum (Elizabethkingia meningosepticum)
hoewel zeldzaam, is het belangrijk om dit organisme te identificeren omdat het uitbraken kan veroorzaken in kinderdagverblijven en geassocieerd is met hoge sterfte (50%). Een bodemsaprofyt, kan het de artikelen van de patiëntenzorg besmetten resulterend in neonatale meningitis of sepsis.het organisme produceert lichtgele gepigmenteerde kolonies op bloedagar, die meer dan 24 uur nodig hebben om te groeien. Het is een niet-beweegbare, gramnegatieve staaf, dat wil zeggen oxidase-positief, indool-positief, hydrolyseert aesculine en gelatine en toont een positieve ONPG-test. Het isolaat is gevoelig voor penicilline, Vancomycine, cotrimoxazol en fluorochinolonen. ,
dit organisme heeft twee soorten bètalactamasen: extended spectrum beta lacatamases (ESBL) en metallo beta lactamases (mbls) die resistentie bieden tegen cefalosporines en Carbapenems. Daarom kunnen de antibiotica die in de behandeling van gramnegatieve besmetting worden gebruikt niet voor het behandelen van Chryseobacterium besmettingen worden gebruikt. MICs voor Vancomycine op klinisch significante isolaten moeten worden uitgevoerd. Disk diffusie testen zijn onbetrouwbaar.

conclusie

-fermentoren en de klinische significantie van een isolaat moeten per geval worden bepaald. Nauwkeurige identificatie is belangrijk voor een optimaal patiëntmanagement, prognose en een adequate infectie controle interventie. Het type identificatiesysteem dat door het laboratorium wordt gebruikt, moet aan het oordeel van de klinische microbioloog worden overgelaten. Het is echter van essentieel belang ervoor te zorgen dat de kwaliteit en de prestaties van de systemen periodiek worden gevalideerd.

	Samanta P, Gautam V, Thapar R, Ray P. Opkomende resistentie van niet-fermenterende gramnegatieve bacillen in een tertiair zorgcentrum. Indian J Pathol Microbiol 2011; 54: 666-7.
	Deepak J, Rajat P, Shamanth AS, Munesh S, Vikrant N, Neelam S. Prevalence of Non fermenting gramnegatieve bacillen en hun in vitro gevoeligheidspatroon in een tertiaire zorg ziekenhuis van Uttarakhand: een studie van foot hills of Himalaya. SJHS 2013; 2: 108-12.
	Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Issued by the Standards Unit, Microbiology Services Division, HPA Bacteriology. Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Identification/ID17/Issue 2.1/Oct 2011:1-20.
	Koneman EW. The non fermentative gram negative bacilli. In: Kleurenatlas en leerboek van diagnostische Microbiologie. Lippincott Wilkins en Williams. 6 E ed; 2006. blz. 303-76.
	Su SC, Vanceechoutte M, Dijkshoom L, Wei YF, Leichen Y, Chang TC. Identificatie van niet-fermenterende gramnegatieve bacteriën van klinisch belang door een olignonucleotide-array. J Med Microbiol 2009; 58: 596-605.
	Manchand V, Sanchaita S, zucht NP. Multidrug resistant acinetobacter. J Glob Infect Dis 2010;2:291-304.
	Lee HW, Koh YM, Kim J, Lee JC, Lee JC, Seol SY, et al. Capacity of multidrug resistant clinical isolates of Acinetobacter baumannii to form biofilm and adhere to epithelial cell surfaces. Clin Microbiol Infect 2008;14:49-54.
	Singh NT, Singh M, Sharma M. Emergence of tigecycline and colistin resistant Acinetobacter baumanii in patients with complicated urinary tract infections in north India. Indian J Med Res 2011;133:681-4.
	Maragakis LL, Perl TM. Acinetobacter baumannii: Epidemiology, antimicrobial resistance, and treatment options. Clin Infect Dis 2008;46:1254-63.
	CLSI. Prestatienormen voor antimicrobiële gevoeligheidstesten; drieëntwintigste informatieve aanvulling. Clin Lab Stand Inst 2013; 33: 66-8.
	Hung PP, Lin YH, Lin CF, Liu MF, Shi ZY. Chryseobacterium meningosepticum infectie: antibiotische gevoeligheid en risicofactoren voor mortaliteit. J Microbiol Immunol Infected 2008; 41: 137-44.

This article has been cited by 1 Emerging MDR-Pseudomonas aeruginosa in fish commonly harbor oprL and toxA virulence genes and blaTEM, blaCTX-M, and tetA antibiotic-resistance genes Abdelazeem M. Algammal,Mahmoud Mabrok,Elayaraja Sivaramasamy,Fatma M. Youssef,Mona H. Atwa,Ali W. El-kholy,Helal F. Hetta,Wael N. Hozzein Scientific Reports. 2020; 10(1) | 2 Molecular mechanisms of antimicrobial resistance in Acinetobacter baumannii, with a special focus on its epidemiology in Lebanon Sabah Jamal,Ahmad Al Atrouni,Rayane Rafei,Fouad Dabboussi,Monzer Hamze,Marwan Osman Journal of Global Antimicrobial Resistance. 2018; 15: 154 |