de werkelijke frequentieberekeningen hangen af van de ploïdie van de soort voor autosomale genen.

MonoploidsEdit

De frequentie (p) van een allel A is de fractie van het aantal kopieën (i) van het A-allel en de populatie of steekproefgrootte (N), dus

p = i / N . {\displaystyle p = I / N.}

DiploidsEdit

Als f ( A A ) {\displaystyle f(\mathbf {AA} )}

, f ( A B ) {\displaystyle f(\mathbf {AB} )}

, en f ( B, B ) {\displaystyle f(\mathbf {BB} )}

zijn de frequenties van de drie genotypen in een locus met twee allelen, dan is de frequentie p van de A-allel en de frequentie q van het B-allel in de populatie zijn verkregen door het tellen van de allelen. p = f ( A ) + 1 2 f ( A B ) = frequentie van Een {\displaystyle p=f(\mathbf {AA} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{frequentie van Een}}}

q = f ( B ) + 1 2 f ( A B ) = frequentie van B {\displaystyle q=f(\mathbf {BB} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{frequentie van de B}}}

Omdat p en q zijn de frequenties van de slechts twee allelen aanwezig op die locus, ze moeten een som van 1. Om dit te controleren:

p + q = f ( A ) + f ( B ) + f ( A B ) = 1 {\displaystyle p+q=f(\mathbf {AA} )+f(\mathbf {BB} )+f(\mathbf {AB} )=1}

q = 1 − p {\displaystyle q=1-p}

en p = 1 − q {\displaystyle p=1-q}

Als er meer dan twee verschillende allelen vormen, de frequentie voor elk allel is gewoon de frequentie van zijn homozygoot plus de helft van de som van de frequenties voor alle heterozygoten waarin het verschijnt.

(voor 3 allelen zie allel § allel en genotype frequenties)

allel frequentie kan altijd worden berekend op basis van genotype frequentie, terwijl het omgekeerde vereist dat de Hardy–Weinberg voorwaarden van willekeurige paring van toepassing zijn.

Exampledit

beschouw een locus die twee allelen draagt, A en B. In een diploïde populatie zijn er drie mogelijke genotypen, twee homozygote genotypen (AA en BB), en één heterozygote genotype (AB). Als we het voorbeeld van de 10 mensen van de bevolking, en zien wij de genotype frequenties

1. freq. (AA) = 6
2. freq (AB) = 3
3. freq (BB) = 1

dan is er zijn 6 × 2 + 3 = 15 {\displaystyle 6\times 2+3=15}

waargenomen exemplaren van het A-allel en 1 × 2 + 3 = 5 {\displaystyle 1\times 2+3=5}

van het B-allel, van 20 in totaal-chromosoom exemplaren. De frequentie p van het A-allel is p = 15/20 = 0,75, en de frequentie q van het B-allel is q = 5/20 = 0,25.