EDITORIAL

Year : 2013 | Volume : 15 | Issue : 2 | Page : 59-61

Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka, India

Correspondence Address:
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka
India

Source of Support: None, Conflict of Interest: None

Check

DOI: 10.4103/0972-1282.124588

How to cite this article:
Aprameya IV. Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013;15:59-61

How to cite this URL:
Aprameya IV. Ei-fermentoituvat Gramnegatiiviset basillit (NFGNB), muut kuin Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013 ;15: 59-61. Saatavissa: https://www.jacmjournal.org/text.asp?2013/15/2/59/124588

Introduction

ei-fermentoijat ovat heterogeeninen ryhmä gramnegatiivisia basilleja, jotka ovat aerobisia, sporttittomia, joko eivät käytä hiilihydraatteja energianlähteenä tai hajottavat niitä muiden aineenvaihduntareittien kuin käymisen kautta. Koska niitä esiintyy kaikkialla luonnossa, niitä ei pidetty todennäköisinä vierasaineina, kun ne eristettiin laboratoriossa. Ne ovat kuitenkin nyt nousseet tärkeiksi terveydenhuollon liitännäispatogeeneiksi, koska ne ovat tehneet paikkansa sairaalaympäristössä. Monilääkeresistenssin uudet haasteet, sekä luontaiset että niiden joukossa hankitut, huolestuttavat vakavasti hoitavaa lääkäriä.
muiden kuin fermentaattoreiden osuus on 15% kaikista kliinisen mikrobiologian laboratorion bakteeri-isolaateista. Julkaistut tutkimukset eri keskuksista lainaavat ei-fermentoijien vaihtelevia eristysasteita, jotka vaihtelevat 2,18 prosentista 45,9 prosenttiin.
taksonominen sekaannus vallitsee, koska tilanne muuttuu jatkuvasti ja monilla tunnistetuilla kannoilla ei ole määrättyjä lajeja. Tätä pahentavat tekijät, jotka osaltaan vaikeuttavat niiden tunnistamista rutiininomaisessa kliinisessä mikrobiologisessa laboratoriossa. Useimpia lajeja tavataan harvoin, ja siksi laboratorion henkilökunta ei välttämättä tunne monia ei-fermentoijia. Monet perinteiset kulttuurimediat eivät sovellu tunnistamiseen ja niiden laadunvalvonta voi olla vaikeaa. Monet lajit ovat hidaskasvuisia ja biokemiallisesti heikkoja tai inerttejä, ja epäselvien tulosten tulkitseminen vaatii paljon kokemusta. Kaupalliset kit-järjestelmät, jotka ovat käytettävissä, ovat paitsi kalliita, myös usein heikkoa tarkkuutta tiettyjen kantojen tunnistamiseen.

useimmat kliinisen mikrobiologian laboratoriot tukeutuvat pääasiassa fenotyyppisiin tunnistusmenetelmiin. Näitä voivat olla manuaaliset tai kaupalliset kit / automatisoidut tunnistusjärjestelmät, kuten API 20ne, Remel N/F, Vitek 2, Microscan Walkaway, Sensititre AP80-järjestelmä, Phoenix-järjestelmä.
kaupallisen tunnistusjärjestelmän toimivuutta selvittävistä tutkimuksista on kuitenkin saatu ristiriitaisia tuloksia. Tunnistaminen perinteisillä fenotyyppisillä menetelmillä voi olla vaikeaa ja aikaa vievää. Molekyylitunnistustekniikat ovat kehittymässä fenotyyppisten tunnistusmenetelmien vaihtoehtoisiksi menetelmiksi. Näitä ovat muun muassa 16S rRNA-geenien sekvensointi ja DNA-array (oligonukleotidiryhmät) – tekniikka, jota on kuvattu luotettavaksi ja nopeaksi menetelmäksi kliinisesti merkittävien ei-fermentoituvien gramnegatiivisten basillien (NFGNB) tunnistamiseksi.
nfgnb: n luettelo on loputon ja tämän artikkelin ulottumattomissa. Harvat yleisesti kohdatut kliinisesti tärkeitä ei fermentaattorit muut kuin Pseudomonas ovat korkea valaistu tässä artikkelissa.

Genus Acinetobacter

kuten tämän numeron erikoisartikkelin tiedoistamme ja useimmista muista tutkimuksista ilmenee, yleisin kliinisistä näytteistä talteen otettu ei-Pseudomonas-fermentori on Acinetobacter. Luokitellaan Moraxella yksityiskohtaisemmin, tämä suku sisältää Gram-negatiivisia coccobacilli jotka ovat liikkumattomia, oksidaasi negatiivinen ja vastustuskykyisiä penisilliiniä. Yli 25 genomospesiaa on tunnistettu DNA-DNA-hybridisaation avulla suvun sisällä ja seitsemälle on annettu virallinen lajinimi. Näitä ovat muun muassa lajit Acinetobacter calcoaceticus, A. baumannii, Acinetobacter genomic species 3 ja Acinetobacter genomic species 13tu, joilla on erittäin läheinen suhde ja joita on vaikea erottaa toisistaan pelkillä fenotyyppitesteillä. Ne on ryhmitelty Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii-kompleksiksi.
A. baumannii on sakkarolyyttinen, happamoittaa useimmat hiilihydraatit ja osoittaa, että 1%: n ja 10%: n laktoosista muodostuu nopeasti happoa. Näitä ominaisuuksia voidaan käyttää niiden oletettuun tunnistamiseen rutiinidiagnostiikkalaboratoriossa. A. baumannii-kompleksi aiheuttaa 80% Acinetobacter-lajien aiheuttamista kliinisistä infektioista, ja siihen kuuluvat keuhkokuume, bakteremia, aivokalvontulehdus, virtsatieinfektio (UTI) ja haavainfektiot, joista suurin osa on sairaalahoitoa vaativia. ,
Acinetobacterit ovat nousseet menestyneimmiksi taudinaiheuttajiksi kyvyllään selviytyä ja säilyä sairaalaympäristössä pitkiä aikoja sekä kuivilla että kosteilla pinnoilla. Tätä edesauttaa niiden kyky kasvaa eri lämpötiloissa ja pH: ssa, mikä edistää taudinpurkausten kehittymistä ja pysyvyyttä. Tätä ongelmaa pahentaa niiden kyky tuottaa biofilmejä lääketieteellisten laitteiden pinnalla.

tästä organismista löytyy useita resistenssimekanismeja, jotka ovat myötävaikuttaneet monilääke-ja pan-lääkeaineresistenssin syntyyn aiheuttaen vakavaa huolta hoitavalle lääkärille. ,
mielenkiintoista on, että tutkimuksessa, jossa tutkittiin epidemian monilääkeresistenttiä Acinetobacter-kantaa Ranskassa, on raportoitu suuresta genomiresistentistä saaresta, jossa on 45 resistenttiä geeniä, jotka on hankittu muista Gramnegatiivisista basilleista. Acinetobacter – lajien antibioottiherkkyyden testaus on ongelmaherkkää, ja standardoidulla mikrobrotolaimennoksella saadut tulokset eivät vastaa standardoidulla levydiffuusiomenetelmällä saatuja tuloksia erityisesti beetalaktaamin ja beetalaktaamin estäjien yhdistelmällä. Clinical and laboratory standards institute (CLSI) ei määrittele ohjeita levyn diffuusiotestaukseen ja tulkintaan uudemmille antibiooteille, kuten Tigesykliinille ja Kolistiinille.

Genus Burkholderia

Burkholderia cepacia (B. cepacia)
fytopatogeeni, B. cepacia on ilmaantunut opportunistisen infektion aiheuttajaksi erityisesti potilailla, joilla on krooninen granulomatoottinen sairaus ja kystinen fibroosi.
taksonomiset tutkimukset ovat osoittaneet, että B. cepacia on itse asiassa klusteri, jossa on ainakin yhdeksän läheistä sukua olevaa genomovaaria. Ne liittyvät yleisimmin ”Cepacia syndrome” – epidemioihin, jotka ilmenevät vaikeana etenevänä hengitysvajauksena ja bakteremiana. B. cepacia complex on eristetty lukuisista vesilähteistä ja kosteista pinnoista, kuten pesuaineliuoksista ja IV-nesteistä. Hospital Out tauko johtuu yhteinen lähde saastuminen lääkinnällisten laitteiden, kuten sumuttimet, desinfiointiaineet ja veren kaasun analysaattorit on raportoitu.
B. cepacian tunnistaminen kliinisessä laboratoriossa voi olla ongelmallista, koska se ei ole yksittäinen fenotyyppi. Kaupalliset tunnistusjärjestelmät toimivat huonosti.
Primääriviljely kliinisistä näytteistä voidaan suorittaa selektiivisillä elatusaineilla, kuten B. cepacia selective agarilla tai hapetuskäymisen polymyksiinibasitrisiini laktoosi agarilla (OFPBL agar), jota inkuboidaan 35°C: ssa 48 tunnin ajan. Pesäkkeet näyttävät keltaisilta laktoosin käytön vuoksi. Isolaatti on heikosti oksidaasipositiivinen, hydrolysoi lysiiniä ja on resistentti polymyksiini B: lle ja aminoglykosideille, mutta herkkä Ko-Trimoksatsolille.
hoitona on Kolmitrimoksatsoli. CLSI ehdottaa in vitro-testausta Keftatsidiimille, Meropeneemille, minosykliinille (tetrasykliini) ja Trimoksatsolille.
Burkholderia pseudomallei (s.pseudomallei)

Melioidoosin aiheuttaja, B. pseudomallei on Vaararyhmän 3 taudinaiheuttaja, ja laboratoriotyöntekijän turvallisuus on ensisijaisen tärkeää tämän organismin käsittelyn aikana.
B. pseudomallein käyttöä tulee harkita potilailla, joilla on keuhkokuume, sepsis tai absessi ja jotka ovat matkustaneet Kaakkois-Aasiaan tai Pohjois-Australiaan. Organismia ei ole vaikea eristää rutiiniväliaineissa. Pesäkemorfologiassa voi kuitenkin esiintyä vaihtelua. Se voi kasvaa 42°C: n lämpötilassa.kliinisistä näytteistä saadut gram-värjäykset osoittavat bipolaarisen värjäyskuvion. Eliön eristäminen ei-steriileistä paikoista edellyttää selektiivisen kasvualustan, Ashdownin kasvualustan, käyttöä, jossa 48 tunnin kuluttua on karkea ryppyinen violetti tai violetti pesäke. Oksidaasipositiiviset Gramnegatiiviset basillit, jotka voidaan tunnistaa sen ominaisesta antibiogrammista, joka osoittaa konstitutiivista resistenssiä Polymyksiinille ja gentamisiinille, mutta joka on herkkä Amoksiklavulaanihapolle, tetrasykliinille ja kloramfenikolille. Kaupalliset sarjat tunnistaa hyvin, joista API 20NE on paras validoitu.
Stenotrophomonas maltofilia
se on kliinisessä käytännössä kolmanneksi yleisimmin tavattu ei-fermentori. Koska sitä esiintyy kaikkialla, se voi kolonisoida hengitysteitä sairaalahoidossa olevilla potilailla ja aiheuttaa sairaalainfektioita, kuten CRBSI: tä (katetriin liittyvät verivirtainfektiot), ja keuhkokuumetta erityisesti potilailla, joilla on hematologinen maligniteetti.
se tuottaa veriagarilla vaaleankeltaisesta laventelinvihreään pesäkkeitä. Se on oksidaasinegatiivinen, liikkuvabasilli, joka on tyypillisesti resistentti Imipeneemille (Karbapeneemille), mutta herkkä Kolistiinille, Polymyksiinille, Kotrimoksatsolille, Minosykliinille ja levofloksasiinille. Se on vahva maltoosin hapetin, joka on lysiini ja DNaasi positiivinen. Useimmat kaupalliset sarjat pystyvät tunnistamaan tämän organismin.
antibioottiherkkyystestejä lukiessa ja tulkitessa tulee kuitenkin noudattaa varovaisuutta. Agar-laimennus-ja liemilaimennuskokeissa on havaittu loppupisteitä, ja gentamysiinin ja siprofloksasiinin levydiffuusiokokeessa on saatu virheelliset lukemat. Samoin e-testillä tehdyissä tutkimuksissa on havaittu pieniä mikropesäkkeitä tai läpikuultavan kasvun sameutta inhibitioalueella, mikä voi missattuna johtaa virheelliseen herkkään tulokseen.
CLSI ehdottaa Stenotrophomonas maltofilian varalta testattavaksi seuraavia antibiootteja. Kotrimoksatsoli (lääkevalinta), keftatsidiimi, Levofloksasiini, Minosykliini, kloramfenikoli ja tikarsilliini. Keftatsidiimin, kloramfenikolin ja Tikarsilliinin testaamiseen suositellaan mic: tä liemilaimennoksella, koska levydiffuusiomenetelmä on epäluotettava.

Chryseobacterium meningosepticum (Elizabethkingia meningosepticum)
vaikka se on harvinainen, on tärkeää tunnistaa tämä organismi, koska se voi aiheuttaa taudinpurkauksia taimitarhoissa ja siihen liittyy korkea kuolleisuus (50%). Maaperän saprofyytti, se voi saastuttaa potilaan hoito artikkeleita johtaa vastasyntyneen aivokalvontulehdus tai sepsis.
eliö tuottaa veriagariin vaaleankeltaisia pigmentoituja pesäkkeitä, joiden kasvaminen voi kestää yli 24 tuntia. Se on liikkumaton, gramnegatiivinen sauva eli oksidaasipositiivinen, indolipositiivinen, hydrolysoi eskuliinin ja gelatiinin ja osoittaa positiivisen ONPG-testin. Isolaatti on herkkä penisilliinille, vankomysiinille, Kotrimoksatsolille ja fluorokinoloneille. ,
tällä organismilla on kahdenlaisia beetalaktamaaseja: laajakirjoisia beetalaktamaaseja (ESBL) ja metallo-beetalaktamaaseja (mbls), jotka aiheuttavat resistenssin kefalosporiineille ja karbapeneemeille. Siksi kryseobakteeri-infektioiden hoitoon ei voida käyttää gramnegatiivisten infektioiden hoitoon käytettäviä antibiootteja. Vankomysiinille on tehtävä mikrofonit kliinisesti merkittäville isolaateille. Levynhajoamistestit ovat epäluotettavia.

Conclusion

kaikki kliiniset mikrobiologian laboratoriot on suunniteltava tunnistamaan tarkasti muut kuin fermentoijat, ja isolaatin kliininen merkitys on määritettävä tapauskohtaisesti. Tarkka tunnistaminen on tärkeää potilaan optimaalisen hoidon, ennusteen ja asianmukaisen infektiokontrollin kannalta. Laboratorion käyttämän tunnistusjärjestelmän tyyppi on jätettävä kliinisen mikrobiologin harkintaan. On kuitenkin olennaisen tärkeää varmistaa, että järjestelmien laatu ja suorituskyky validoidaan säännöllisesti.

	Samanta P, Gautam v, Thapar r, Ray P. Kehittymässä oleva vastustuskyky gramnegatiivisille basilleille, jotka eivät käy kolmannen asteen hoitolaitoksessa. Indian J Pathol Microbiol 2011; 54: 666-7.
	Deepak J, Rajat P, Shamanth AS, Munesh s, Vikrant n, Neelam S. gramnegatiivisten basillien prevalence of non fermenting gram negative bacilli and their in vitro susceptibility pattern in a tertiary care hospital of Uttarakhand: a study from foot hills of Himalayas. SJHS 2013; 2: 108-12.
	Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Issued by the Standards Unit, Microbiology Services Division, HPA Bacteriology. Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Identification/ID17/Issue 2.1/Oct 2011:1-20.
	Koneman EW. The non fermentative gram negative bacilli. In: Color Atlas ja diagnostisen mikrobiologian oppikirja. Lippincott Wilkins ja Williams. 6. päivä; 2006. s. 303-76.
	Su SC, Vanceechoutte M, Dijkshoom l, Wei YF, Leichen Y, Chang TC. Kliinisesti merkittävien gramnegatiivisten bakteerien tunnistaminen olignonukleotidiryhmällä. J Med Microbiol 2009; 58: 596-605.
	Manchand V, Sanchaita S, Sigh NP. Multidrug resistant acinetobacter. J Glob Infect Dis 2010;2:291-304.
	Lee HW, Koh YM, Kim J, Lee JC, Lee JC, Seol SY, et al. Capacity of multidrug resistant clinical isolates of Acinetobacter baumannii to form biofilm and adhere to epithelial cell surfaces. Clin Microbiol Infect 2008;14:49-54.
	Singh NT, Singh M, Sharma M. Emergence of tigecycline and colistin resistant Acinetobacter baumanii in patients with complicated urinary tract infections in north India. Indian J Med Res 2011;133:681-4.
	Maragakis LL, Perl TM. Acinetobacter baumannii: Epidemiology, antimicrobial resistance, and treatment options. Clin Infect Dis 2008;46:1254-63.
	CLSI. Performance standards for Antimicrobial herkkyystestaus; Twenty-Third Informational supplement. Clin Lab Stand Inst 2013;33: 66-8.
	Hung PP, Lin YH, Lin CF, Liu MF, Shi ZY. Chryseobacterium meningosepticum infektio: Antibioottiherkkyys ja kuolleisuuden riskitekijät. J Microbiol Immunol Infect 2008; 41:137-44.

This article has been cited by 1 Emerging MDR-Pseudomonas aeruginosa in fish commonly harbor oprL and toxA virulence genes and blaTEM, blaCTX-M, and tetA antibiotic-resistance genes Abdelazeem M. Algammal,Mahmoud Mabrok,Elayaraja Sivaramasamy,Fatma M. Youssef,Mona H. Atwa,Ali W. El-kholy,Helal F. Hetta,Wael N. Hozzein Scientific Reports. 2020; 10(1) | 2 Molecular mechanisms of antimicrobial resistance in Acinetobacter baumannii, with a special focus on its epidemiology in Lebanon Sabah Jamal,Ahmad Al Atrouni,Rayane Rafei,Fouad Dabboussi,Monzer Hamze,Marwan Osman Journal of Global Antimicrobial Resistance. 2018; 15: 154 |