Blue World Institute harjoittaa useiden suurten meren selkärankaisten tutkimustoimintaa. Päätutkimuksemme kohdistuu alueen pullonokkadelfiinien rannikkoyhteisöihin. Muissa hankkeissa keskitytään myös muihin valaslajeihin, kuten Evävalaaseen, Cuvierin nokkavalaaseen, risson delfiiniin, juovadelfiiniin ja tavidelfiiniin sekä Välimeren munkkihyljeeseen. Teemme yhteistyössä Kroatian luonnonhistoriallisen museon kanssa tutkimusta haista, jättiläispaholaisrauskuista ja merikilpikonnista. Kaikkien merinisäkkäiden-valaiden, eväjalkaisten, sireenien, merisaukkojen (Enhydra lutris) ja jääkarhujen (Ursus maritimus) – katsotaan kehittyneen eri aikoina maalla asuvista esi-isistä. Vaikka valaat muistuttavat enemmän kaloja kuin lähimpiä eläviä sukulaisiaan, virtahepoa (Hippopotamus amphibius), niiden anatomia, fysiologia ja embryologia ovat varmasti nisäkkäitä. Kuten kaikki varsinaiset Nisäkkäät, valaat synnyttävät eläviä poikasia ja naarailla on maitorauhasia. Odontoceti-alalahkon jäsenenä delfiineillä on hampaat, kun taas baleenivalailla on baleenilevyt. Delfinidae on suurin ja monipuolisin valaiden heimo, johon kuuluu miekkavalas (”Orcinus orca”). Tällä hetkellä on olemassa kolme alalahkoa valaita: Archaeocetes-nyt täysin sukupuuttoon, Odontocetes – hammasvalaat ja Mysticetes – baleenivalaat. Yleisesti uskotaan, että sekä Odontocetes että Mysticetes jakavat yhteisen esi-isän Archaeocetes-heimon keskuudesta. Uudet geneettiset ja morfologiset analyysit paljastavat yhteyksiä aiemmin erillisinä pidettyjen lajien välillä ja eroja yleisesti toisiinsa liittyvien lajien välillä. Samoin monet viimeaikaiset geenitutkimuksen avulla tehdyt löydöt uusista lajeista osoittavat, että elävien valaiden määrä on huomattavasti suurempi kuin nykyisin tunnustettu noin 80. Epävarmuutta lisäävät tekijät, kuten yksilökohtainen ääntelyn vaihtelu, ruokintamieltymykset ja-käyttäytyminen, väri, luuston ominaisuudet, eristettyjen osapopulaatioiden esiintyminen ja lajien välinen hedelmällisyys.