ovat kolmen genotyypin taajuudet a-lokuksessa , jossa on kaksi alleelia, sitten taajuus P-alleeli ja populaation b-alleelin frekvenssi Q saadaan laskemalla alleelit. p = f ( A A ) + 1 2 f ( A B) = {\displaystyle P=f(\mathbf {AA} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\MBOX{frequency of a}}}

Q = F ( B B ) + 1 2 f ( A B ) = frequency of B {\displaystyle Q=F(\mathbf {BB} )+{\frac {1}{2}}F(\mathbf {AB} )={\MBOX{frequency of B}}}

koska p ja Q ovat vain kahden kyseisessä lokuksessa esiintyvän alleelin taajuudet, niiden on summattava arvoon 1. Tämän tarkistamiseksi:

p + q = f ( A A ) + f ( B B ) + f ( A B ) = 1 {\displaystyle P+q=f(\mathbf {AA} )+f(\mathbf {Bb} )+f(\mathbf {ab} )=1}

Q = 1 − p {\displaystyle q=1-p}

ja P = 1 − Q {\displaystyle P=1-Q}

Jos on enemmän kuin kaksi eri alleelia, kunkin alleelin taajuus on yksinkertaisesti sen homotsygootin taajuus plus puolet kaikkien niiden heterotsygoottien taajuuksien summasta, joissa se esiintyy.

(3 alleelin kohdalla KS.alleeli § alleeli ja genotyypin frekvenssi)

alleelin frekvenssi voidaan aina laskea genotyypin frekvenssistä, kun taas kääntöpuoli edellyttää satunnaisen parittelun Hardy–Weinbergin olosuhteiden soveltamista.

ExampleEdit

tarkastellaan lokusta, jossa on kaksi alleelia, A ja B. diploidisessa populaatiossa on kolme mahdollista genotyyppiä, kaksi homotsygoottista genotyyppiä (AA ja BB) ja yksi heterotsygoottinen genotyyppi (AB). Jos otamme populaatiosta 10 yksilöä ja havaitsemme genotyypin frekvenssit

1. freq (AA) = 6
2. freq (AB) = 3
3. freq (BB) = 1

, on olemassa 6 × 2 + 3 = 15 {\displaystyle 6\kertaa 2+3=15}

havaitut a-alleelin kopiot ja 1 × 2 + 3 = 5 {\displaystyle 1\times 2+3=5}

b-alleelin 20 kromosomikopion kokonaismäärästä. A-alleelin taajuus p on P = 15/20 = 0,75 ja B-alleelin taajuus q = 5/20 = 0,25.