‚hnízdo‘ z rozvojových Onchocerca volvulus, parazitický červ, který způsobuje říční slepotu. Thomas Unnasch

Říční slepota je oční a kožní infekce, způsobené malé parazitní červ s názvem Onchocerca volvulus. Lidé získávají nemoc kousnutím černých mušek, které žijí a chovají se na březích rychle tekoucích řek a potoků, většinou v subsaharské Africe. Jakmile jsou uvnitř lidského těla, červi se množí. Jejich potomci migrují na kůži, kde způsobují intenzivní svědění a vyrážky, a do oka, kde mohou nakonec způsobit slepotu.

pro lepší pochopení parazita zkoumaly 2 výzkumné týmy genom červa. Výzkum je popsán ve dvojici článků publikovaných online 21. Listopadu 2016 v Nature Microbiology. Týmy zahrnovaly vědce zaměstnané nebo částečně podporované Národním institutem pro alergie a infekční nemoci NIH (NIAID) a národním Výzkumným ústavem pro lidský genom (NHGRI).

jedna skupina, vedená Dr. Sara Lustigman v newyorském krevním centru shromáždila parazity o. volvulus spolu se vzorky Wolbachie, symbiotických bakterií, které žijí uvnitř červů. Vědci sekvenovali a zkoumali tyto genomy. Identifikovali geny, které kódují běžné proteiny a molekulární reakce nezbytné pro infekci. Na základě sekvenčních dat může být 16 nově objevených proteinů slibnými cíli pro stávající léky schválené FDA, které se nyní používají k léčbě jiných nemocí. Je zapotřebí dalšího výzkumu, aby se zjistilo, zda by interference s některým z těchto proteinů byla užitečnou strategií pro léčbu slepoty řeky.

říční slepota je v současné době léčena lékem zvaným ivermektin. Někteří paraziti však začali vykazovat rezistenci vůči tomuto léku. Naučit se, jak tento odpor se vyvinul výzkumný tým pod vedením Dr. Makedonka Mitreva na Washington University School of Medicine v St. Louis zkoumali, co worm genomu vypadalo před rozsáhlou protidrogovou léčbu úsilí.

vědci sekvenují 27 vzorků DNA od parazitů, které byly uloženy od roku 1990. Porovnávali genomy červů shromážděných z Ekvádoru, Uganda, a populace lesů i savan ze západní Afriky. Tato srovnání pomohla týmu identifikovat genetické markery, které lze použít ke sledování vývoje různých kmenů parazitů po celém světě.

„chceme pochopit původ tohoto odporu,“ vysvětluje Mitreva. „Vyvíjejí se tito paraziti, aby přežili léčbu, nebo jsou přežívající červi skutečně novými kmeny, které byly zavedeny v důsledku migrace černých mušek nebo samotného parazita?“

Ve třetím související studie, tým vedený Dr. Thomas Nutman na NIAID analyzovat všechny geny vyjádřené (transcriptome) a bílkoviny (proteomu) o. volvulus a Wolbachia. Jak je podrobně popsáno 23. Listopadu 2016, v mBio tým identifikoval stovky různých proteinů exprimovaných v různých bodech životního stylu parazita.

dohromady tyto studie odhalují kritické informace o genomické rozmanitosti parazita Onchocerca volvulus. Tyto nové informace mohou být užitečné pro pochopení rezistence na léky a nalezení nových způsobů léčby slepoty řeky.