Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas Aprameya IV – J Acad Clin Microbiol
EDITORIAL
Year : 2013 | Volume : 15 | Issue : 2 | Page : 59-61
Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka, India
| Date of Web Publication | 7-Jan-2014 |
Correspondence Address:
Indumathi Vrithamani Aprameya
Department of Microbiology, M. S. Ramaiah Medical College, Bangalore, Karnataka
India
Source of Support: None, Conflict of Interest: None
DOI: 10.4103/0972-1282.124588
How to cite this article:
Aprameya IV. Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) other than Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013;15:59-61
How to cite this URL:
Aprameya IV. Nefermentující gramnegativní bacily (NFGNB) jiné než Pseudomonas. J Acad Clin Microbiol 2013; 15: 59-61. Dostupné z: https://www.jacmjournal.org/text.asp?2013/15/2/59/124588
| Úvod |  |
Non-fermentory jsou heterogenní skupina Gram-negativní bacily, které jsou aerobní, non-sporing, buď nemají používat sacharidy jako zdroj energie, nebo snížit jejich prostřednictvím metabolických drah, jiné než fermentace. Být všudypřítomný v přírodě, byly ignorovány jako pravděpodobné kontaminanty, když byly izolovány v laboratoři. Nyní se však objevily jako důležité patogeny spojené se zdravotní péčí, protože si vytvořily své místo v nemocničním prostředí. Vznikající výzvy multidrogové rezistence, vnitřní i získané mezi nimi, jsou pro ošetřujícího lékaře vážným problémem.
nefermentátory představují 15% všech bakteriálních izolátů z klinické mikrobiologické laboratoře. Publikované studie z různých Center uvádějí různé míry izolace nefermentátorů v rozmezí od 2,18% do 45,9%.
převládá taxonomické zmatení, protože dochází k nepřetržité revizi a mnoho identifikovaných kmenů nemá přiřazeny žádné určené druhy. To je ještě umocněno faktory, které přispívají k obtížím při jejich identifikaci v rutinní klinické mikrobiologické laboratoři. Většina druhů jsou zřídka setkal, a proto, laboratorní personál, nemusí být obeznámeni s mnoha non-fermentory. Mnoho z konvenčních kultivačních médií není vhodné pro identifikaci a kontrolu kvality médií může být obtížné. Mnoho druhů je pomalu rostoucích a biochemicky slabých nebo inertních a vyžaduje značné zkušenosti s interpretací nejednoznačných výsledků. Komerční kit systémy, které jsou k dispozici pro použití jsou nejen drahé, ale také často mají nízkou přesnost pro identifikaci některých kmenů.
většina klinických mikrobiologických laboratoří se spoléhá hlavně na fenotypové metody identifikace. Ty mohou zahrnovat ruční nebo komerční kit/automatizované identifikační systémy, jako je API 20NE, Remel N/F, Vítek 2, Mikroskenování Walkaway, Sensititre AP80 systém, Phoenix systému.
studie zkoumající výkonnost obchodního identifikačního systému však ukázaly protichůdné výsledky. Identifikace konvenčními fenotypovými metodami může být obtížná a časově náročná. Metody molekulární identifikace se objevují jako alternativní pro metody fenotypové identifikace. Mezi nimi jsou 16s rRNA genové sekvenování a DNA array (oligonukleotid pole) techniky, které byly popsány jako spolehlivou a rychlou metodu pro identifikaci klinicky významné Non-kvasí Gram-negativní bacily (NFGNB).
seznam NFGNB je nekonečný a nad rámec tohoto článku. Jen málo běžně se vyskytujících klinicky důležitých nefermentátorů jiných než Pseudomonas je v tomto článku vysoce osvětleno.
| Rod Acinetobacter | |
Jak o tom svědčí naše data ve zvláštní článek v tomto čísle, a většina jiných studií, nejčastější non-Pseudomonas non-fermenter zotavil z klinických vzorků je Acinetobacter. Zařazen do rodinného Moraxella Více Detailsceae, tento rod zahrnuje Gram-negativní coccobacilli, které jsou non-pohyblivé, oxidáza negativní a rezistentní na penicilin. Více než 25 genomospecies byly rozpoznány DNA-DNA hybridizace v rámci rodu a sedm bylo dáno formální druhové jméno. Mezi nimi jsou druhy, Acinetobacter calcoaceticus, A. baumannii, Acinetobacter genomické druhy, 3 a Acinetobacter genomické druhy 13TU, že mají velmi blízký vztah a jsou obtížné odlišit od sebe navzájem fenotypové testy sám. Byly seskupeny jako komplex Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii.
A. baumannii je sacharolytické, okyseluje většina sacharidů a ukazuje na rychlé produkci kyseliny z 1% a 10% laktózy. Tyto vlastnosti mohou být použity pro jejich předpokládanou identifikaci v rutinní diagnostické laboratoři. A. baumannii komplexní účetnictví pro 80% klinických infekcí způsobených Acinetobacter species, a zahrnuje zápal plic, bakteriémie, meningitidy, infekce močových cest (UTI) a infekce ran, z nichž většina jsou získané v nemocnici. ,
Acinetobakterie se ukázaly jako nejúspěšnější patogeny svou schopností přežít a přetrvávat v nemocničním prostředí po delší dobu na suchém i vlhkém povrchu. Tomu napomáhá jejich schopnost růst v rozmezí různých teplot a pH, čímž přispívá k rozvoji a přetrvávání ohnisek. Spojením tohoto problému je jejich schopnost produkovat biofilmy na povrchu zdravotnických prostředků.
Více mechanismů rezistence se nacházejí v organismu, které přispěly ke vzniku kombinovaných a pan rezistence, což způsobuje vážné znepokojení pro ošetřujícího lékaře. ,
je Zajímavé, že ve studii epidemie multirezistentní Acinetobacter napětí ve Francii, velké genomické odolné ostrov, obsahující 45 rezistentní geny, které byly získány z jiných Gram-negativních bacilů bylo hlášeno. Testování citlivosti k antimikrobiálním látkám u Acinetobacter species je problém náchylné a výsledky získané pomocí standardizovaných microbroth ředění nesouhlasí s tím, že získané standardní diskové difúzní metody, zejména pro beta-laktamová a beta-laktamu s inhibitorem kombinace. Institut klinických a laboratorních standardů (CLSI) nedefinuje pokyny pro testování a interpretaci difúze disku pro novější antibiotika, jako je Tigecyklin a kolistin.
| Rod Burkholderia | |
Burkholderia cepacia (B. cepacia)
phytopathogen, B. cepacia se ukázal jako příčina oportunní infekce, zejména u pacientů s chronickou granulomatózní onemocnění a cystické fibrózy.
taxonomické studie prokázaly, že B. cepacia je ve skutečnosti shluk nejméně devíti blízce příbuzných genomovarů. Nejčastěji jsou spojovány s epidemiemi „syndromu Cepacie“, které se projevují závažným progresivním respiračním selháním a bakteriemií. Komplex B. cepacia byl izolován z mnoha vodních zdrojů a mokrých povrchů, včetně roztoků detergentů a IV tekutin. Byla hlášena přestávka v nemocnici kvůli běžné kontaminaci zdravotnických prostředků, jako jsou nebulizéry, dezinfekční prostředky a analyzátory krevních plynů.
identifikace B. cepacie v klinické laboratoři může být problematická, protože se nejedná o jediný fenotyp. Komerční identifikační systémy fungují špatně.
Primární kultury z klinických vzorků může být provedena na selektivní média jako B. cepacia selektivní agar nebo oxidace, fermentace polymyxin bacitricin laktose agar (OFPBL agar) inkubovány při 35°C po dobu 48 hodin. Kolonie vypadají žlutě kvůli využití laktózy. Izolát je slabě oxidáza pozitivní, hydrolyzuje lysin a je odolný vůči Polymyxinu B a aminoglykosidy ale citliví na Co-trimoxazolu.
zvolenou léčbou je ko-trimoxazol. CLSI navrhuje in vitro testování na Ceftazidim, Meropenem, minocyklin (tetracyklin) a ko-trimoxazol.
Burkholderia pseudomallei (B.pseudomallei)
původce Melioidosis, B. pseudomallei je Riziko Skupina 3 patogenu a bezpečnost laboratorní pracovník je prvořadý při zpracování tohoto organismu.
b. pseudomallei by měl být zvážen u pacientů s pneumonií, sepsí nebo abscesem s anamnézou cestování do jihovýchodní Asie nebo severní Austrálie. Organismus není obtížné izolovat v rutinních médiích. Lze však pozorovat rozdíly v morfologii kolonií. Může růst při 42°C. gramové skvrny z klinických vzorků vykazují bipolární zbarvení. Izolace organismu z nesterilních míst vyžaduje použití selektivního média, média Ashdownu, které po 48 hodinách vykazuje hrubé vrásčité fialové nebo fialové kolonie. Oxidázu pozitivní, pohyblivá Gram-negativní bacily, které lze identifikovat podle jeho charakteristické antibiogram ukazuje konstitutivní rezistence na Polymyxin a Gentamicin ale citliví na Co-amoxyclavulanic kyseliny, Tetracyklin a Chloramfenikol. Komerční sady se dobře identifikují, z nichž API 20NE je nejlépe ověřená.
Stenotrophomonas maltophilia
je to třetí nejčastěji se vyskytující nefermenter v klinické praxi. Jelikož je všudypřítomný, může kolonizovat dýchací cesty u hospitalizovaných pacientů a způsobit nozokomiální infekce, jako je CRBSI (infekce krevního oběhu spojené s katétrem) a pneumonie, zejména u pacientů s hematologickou malignitou.
vytváří světle žluté až levandulově zelené kolonie na krevním agaru. To je oxidáza negativní, pohyblivých bacillus, který je charakteristicky odolné vůči Imipenem (Karbapenem), ale citlivé na Kolistin, Polymyxin, Kotrimoxazolu, Minocyklin a Levofloxacin. Je to silné maltózové oxidační činidlo, které je pozitivní na lysin a Dnaázu. Většina komerčních souprav je schopna identifikovat tento organismus.
při čtení a interpretaci testů citlivosti na antibiotika je však třeba postupovat opatrně. Při testech na ředění agaru a ředění vývaru byly pozorovány koncové body a u gentamicinu a ciprofloxacinu byly pozorovány falešně citlivé hodnoty s testem difúze disku. Podobně, studium pomocí E testu zaznamenali přítomnost drobných mikro kolonií nebo opar průsvitné růst v oblasti inhibice, která, pokud minul by mohlo vést k falešně citlivé výsledek.
CLSI navrhuje následující antibiotika, která mají být testována na Stenotrophomonas maltofilia. Kotrimoxazolu (lék volby), Ceftazidim, Levofloxacin, Minocyklin, Chloramfenikol a Ticarcillin. MIC ředěním vývaru se doporučuje pro testování ceftazidimu, chloramfenikolu a Tikarcilinu, protože metoda difúze disku je nespolehlivá.
Chryseobacterium meningosepticum (Elizabethkingia meningosepticum)
i když vzácné, to je důležité identifikovat tohoto organismu, jak to může způsobit ohnisek v mateřských jednotek a je spojena s vysokou mírou úmrtnosti (50%). Půdní saprofyt může kontaminovat předměty péče o pacienty, což vede k novorozenecké meningitidě nebo sepse.
organismus produkuje na krevním agaru světle žluté pigmentované kolonie, jejichž růst může trvat déle než 24 hodin. Oxidáza pozitivní, indol pozitivní, hydrolyzuje aeskulin a želatinu a vykazuje pozitivní ONPG test. Izolát je citlivý na penicilin, vankomycin, kotrimoxazol a fluorochinolony. ,
tento organismus má dva typy beta-laktamáz: beta laktamázy s rozšířeným spektrem (ESBL) a metallo beta laktamázy (MBLs), které propůjčují rezistenci na cefalosporiny a karbapenemy. Proto antibiotika používaná při léčbě gramnegativních infekcí nelze použít k léčbě infekcí Chryseobakterií. Mic pro vankomycin na klinicky významných izolátech musí být provedeny. Testy difúze disku jsou nespolehlivé.
| Závěr | |
Všechny klinické mikrobiologie laboratoře musí být zaměřen přesně identifikovat non-fermentory a klinický význam izolovat, musí být stanovena případ od případu. Přesná identifikace je důležitá pro optimální řízení pacienta, prognózu a vhodný zásah do kontroly infekce. Typ identifikačního systému používaného laboratoří by měl být ponechán na uvážení klinického mikrobiologa. Je však nezbytné zajistit, aby kvalita a výkon systémů byly pravidelně ověřovány.
|
Samanta P, Gautama V, Thapar R, Ray P Vznikající rezistence nefermentujících gramnegativních bacilů v centru terciární péče. Indian J Pathol Microbiol 2011; 54: 666-7.   |
|
| Deepak J, Rajat P, Shamanth JAKO, Munesh S, Vikrant N, Neelam. S. Prevalence Non kvasí gram-negativní bacily a jejich citlivost in vitro vzor v terciární péče nemocnice Uttarakhand: studie z úpatí kopce Himalájí. SJHS 2013; 2: 108-12.
|
|
| Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Issued by the Standards Unit, Microbiology Services Division, HPA Bacteriology. Identification of Glucose Non-fermenting Gram negative Rods. UK Standards for Microbiology Investigations. Identification/ID17/Issue 2.1/Oct 2011:1-20.
|
|
| Koneman EW. The non fermentative gram negative bacilli. In: Barevný Atlas a učebnice diagnostické mikrobiologie. Lippincott Wilkins a Williams. 6 th ed; 2006. s. 303-76.
|
|
| Su SC, Vanceechoutte M, Dijkshoom L, Wei YF, Leichen Y, Chang TC. Identifikace nefermentujících gramnegativních bakterií klinického významu olignonukleotidovým polem. J Med Microbiol 2009; 58: 596-605.
|
|
| Manchand V, Sanchaita S Povzdechem NP. Multidrug resistant acinetobacter. J Glob Infect Dis 2010;2:291-304.
|
|
| Lee HW, Koh YM, Kim J, Lee JC, Lee JC, Seol SY, et al. Capacity of multidrug resistant clinical isolates of Acinetobacter baumannii to form biofilm and adhere to epithelial cell surfaces. Clin Microbiol Infect 2008;14:49-54. |
|
| Singh NT, Singh M, Sharma M. Emergence of tigecycline and colistin resistant Acinetobacter baumanii in patients with complicated urinary tract infections in north India. Indian J Med Res 2011;133:681-4. |
|
| Maragakis LL, Perl TM. Acinetobacter baumannii: Epidemiology, antimicrobial resistance, and treatment options. Clin Infect Dis 2008;46:1254-63. |
|
| CLSI. Výkonnostní standardy pro testování antimikrobiální citlivosti; dvacátý třetí informační doplněk. Clin Lab Stand Inst 2013; 33: 66-8.
|
|
| Hung PP, Lin YH, Lin CF, Liu MF, Shi ZY. Infekce Chryseobacterium meningosepticum: citlivost na antibiotika a rizikové faktory úmrtnosti. J Microbiol Immunol Infect 2008; 41: 137-44. |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
Leave a Reply