skutečné výpočty frekvence závisí na ploidii druhu pro autozomální geny.

MonoploidsEdit

frekvence (p) alela A je zlomek počtu kopií (i) Na alelu a populace, nebo velikost vzorku (N), takže

p = i / N . {\displaystyle p=i/N.}

DiploidsEdit

je-Li f ( A A ) {\displaystyle f(\mathbf {AA} )}

, f ( B ) {\displaystyle f(\mathbf {AB} )}

a f ( B B ) {\displaystyle f(\mathbf {BB} )}

jsou frekvence tří genotypů v lokusu se dvěma alelami, pak frekvence p-alely a frekvence q B-alely v populaci jsou získány tím, že počítá alely. p = f ( A ) + 1 2 f ( B ) = frekvence {\displaystyle p=f(\mathbf {AA} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{frekvence}}}

q = f ( B, B ) + 1 2 f ( B ) = frekvence B {\displaystyle q=f(\mathbf {BB} )+{\frac {1}{2}}f(\mathbf {AB} )={\mbox{frekvence B}}}

Protože p a q jsou frekvence pouze dvě alely tohoto lokusu, musí součet 1. Zkontrolovat toto:

p + q = f ( A ) + f ( B ) + f ( B ) = 1 {\displaystyle p+q=f(\mathbf {AA} )+f(\mathbf {BB} )+f(\mathbf {AB} )=1}

q = 1 − p {\displaystyle q=1-p}

a p = 1 − q {\displaystyle p=1-q}

Pokud existuje více než dva různé allelickou formy, frekvence každé alely je prostě frekvence jeho homozygotní plus polovina součtu frekvencí pro všechny heterozygoti, ve kterém se objeví.

(Pro 3 alely vidět Alela § Alel a genotypů frekvence)

Alelu frekvenci lze vždy vypočítat z frekvence genotypu, vzhledem k tomu, že reverzní vyžaduje, aby Hardy–Weinberg podmínky náhodné páření použít.

ExampleEdit

Zvážit locus, který nese dvě alely a, a a B. V diploidní populaci existují tři možné genotypy, dva homozygotní genotypy (AA a BB), a jeden heterozygotní genotyp (AB). Pokud máme vzorek 10 jedinců z populace, a budeme sledovat genotyp frekvence,

1. freq (AA) = 6
2. freq (AB) = 3
3. freq (BB) = 1

pak tam jsou 6 × 2 + 3 = 15 {\displaystyle 6\times 2+3=15}

pozorované kopie A alela a 1 × 2 + 3 = 5 {\displaystyle 1\times 2+3=5}

B alely, z 20 celkem kopií chromozomu. Frekvence p alely A je p = 15/20 = 0,75 a frekvence q alely B je q = 5/20 = 0,25.