Na samém konci osmého století, Císař Kammu a Japonský Soud přestěhoval do nové lokality — Heiankyo (‚Kapitál Mír a klid,‘ dnešní Kjóto). Moc a vliv císaře Kammu, jednoho z mála mocných císařů v celé historii Japonska, nevydržel moc za jeho vládou. Stejně jako klan Soga ovládl starověký Japonský dvůr, tak i klan Fujiwara ovládl Heianský Dvůr. Předvídavost a open-smýšlející povahy Císař Kammu vedení ustoupila úpadkovou, kosmopolitní kultura, která stále více zanedbával provincií. Éra Heian byla éra mono no aware-estetika patosu věcí, nádherná melancholie spojená s těmi věcmi, které jsou přechodné a procházející v životě. Kniha Lady Murasaki Příběh Genji (c. 1010) evokuje tuto estetiku téměř na každé stránce. Kniha vypráví příběh o životě Prince Genjiho, stejně jako následující generace — důraz je, že age of Genji byl zlatý věk, a že ti, kteří přijdou po něm, jak je skvělý, jak jsou, stále ještě nedosahují do vznešených výšin době Princ Gendži. Nejbližší osobou v reálném životě k fiktivnímu Genji byla Fujiwara no Michinaga (966-1028). Lady Murasaki, ať už to věděla nebo ne, zdálo se, že ve svém opusu magnum nasměrovala ducha své doby-žila na kulturním vrcholu klasické japonské civilizace. Svět, ve kterém žila, svět Heianského dvora, byl ten, který již na přelomu druhého tisíciletí upadal po celá desetiletí. Dvanácté století by vidět pokles a pád Heian uprostřed války, přírodní katastrofy, soud intriky, rise of the samurai a zvýšení výkonu hlasy v provinciích. Úpadkovou kosmopolitní elity by ztratit své výsadní postavení jako více pragmatický a účinný systém byl vyvinut s cílem poskytnout pro větší počet lidí na Japonské souostroví.

věřím, že to bylo 28. Dubna třetího roku Angen (1177). Tam byl silný vítr foukal v hodině psa (8 hodin večer) šířit oheň, který vypukl v jihovýchodní části hlavního města na severozápad. V tu jednu noc Red Sparrow Brány, Paláce, Radnice, školy, ubytovny, Veřejné Bydlení Ministerstvo, a mnoho dalších budov byly spáleny na popel, jen popel.
slyšel jsem, že oheň vypukl v Higuchitominokoji, v chatrči, kde žil tanečník. Pak se šířil větrem a dotkl se místa za místem, až nakonec dosáhl všude, jako rozvinutí ventilátoru. Domy daleko se pohltily kouřem, protože ty poblíž centra byly zachyceny vířícími plameny. Jas ohně se odrážela proti pevné mrak popela do povětří na noční obloze, tmavě červenou v centru, které, jak vítr měl plameny vyskočil 100 až 200 metrů, pořád posouvá. Lidé chyceni uprostřed se vzdali veškeré naděje. Někteří zemřeli, když byli úplně přemoženi kouřem, jiní, když se jim v oku plamene zatočila hlava. Ještě jiní, kteří sotva unikli svým životem, ztratili vše, co vlastnili. Některé z velkých pokladů v paláci byly také sníženy na popel. Jak velké byly škody? Šestnáct budov na císařském dvoře bylo spáleno, ale nelze vypočítat celkovou ztrátu. Možná třetina hlavního města byla tímto požárem zničena. Desítky mužů a žen byly zabity, a kdo ví, kolik koní a dobytka?“

– Kamo no Chomei (c.1155-1216), z ‚Hojoki“ (Dále jen „Účet Mého Hut‘)

Když začneme na konci, máme svědka, který zaznamenal různé přírodní katastrofy, která postihla lidi žijící v a kolem Kjótského na konci dvanáctého století. Kamo ne Chomei byl básník a asketa, muž, který opustil Císařský Dvůr, aby jít žít v nedalekých horách v deset-noha-náměstí chatě s pár věcmi. Byl původním minimalistou a průkopníkem v tom, co bychom dnes mohli nazvat hnutím Tiny House. Jeho motivace se však nedočkáme. Podařilo se mu podat obzvláště živé zprávy o konci období Heian, přírodních katastrofách. Co však nezaznamenal, byla válka probíhající ve stejnou dobu. Klany Taira a Minamoto – oba proto-samurajské rodiny, jejichž předkové vyšli do provincií za příležitost — soupeřili o moc nad Japonskem. Na Fujiwaras byl uvolněn z výkonu století dříve, a odešel císařů, kteří vládli nepřímo byly stále závislé na těchto provinční warriors udrželi moc. Boj mezi Taira a Minamoto propukl, co se stal známý jako Genpei Válce (1180-1185) — série bitev, které by změnit kurz Japonské historie a vytvořit precedenty, které by trvat až do Meidži z roku 1868.

Nábožensky, se věci mění stejně. Před středověkým obdobím (1185-1603) byl buddhismus do značné míry omezen na svět japonské aristokracie. Šintoismus zůstal mnohem rozšířenější. Melding buddhismu a šintoismu, a šíření buddhismu na velké skupiny lidí po celé zemi se začalo rozvíjet s pádem Heian aristokracie. Živé obrazy pekla a duchů ovládly umění. Hell svitky a svitky zobrazující hladové duchy-duchové chamtivých lidí odsouzených k jídlu lidských mrtvol v posmrtném životě-se staly populárními.

Kamo no Chomei napsal své Hojoki v roce 1212, desetiletí po událostech, které popisuje. Byl svědkem Heian-Kamakura přechod, i když neexistuje žádný důkaz, že byl svědkem hodně z konfliktu mezi Minamoto a Taira Klany v 1180s.

„Za vlády Císaře Yowa (1181), domnívám se, i když to se stává tak dlouho, co jsem mít problém se zapamatováním, tam byl hrozný hlad, trvající dva roky. Od jara do léta bylo sucho a na podzim a v zimě tajfun a povodňové špatné podmínky jeden po druhém, takže obilniny zcela selhaly. Všechno, co lidé dělali, se stalo zbytečným úsilím. I když se jim připravil půdu na jaře, a transplantovány rýže v létě, na podzim sklizeň rýže a zimní prosperity nebylo dosaženo…Po roce takové utrpení, lidé doufali, že nový rok bude lepší, ale bídu zvýšil, jak je, kromě hladomoru, lidé byli sužováni nakažlivé onemocnění. Všichni trpěli podvýživou, až postupně se říci, že „Všechny ryby se udusí v mělké vodě“, by se velmi dobře hodí. Nyní i ti, kteří nosí bambusové klobouky, s nohama zabalenými do legín, zběsile chodili z domu do domu a žebrali. Viděl jsem tuláky tohoto druhu, jak šli, náhle se zhroutili a zemřeli. V blízkosti zastřešené bahenní stěny u silnice se počet těl mrtvých hladem neustále zvyšoval. Protože se nikdo ani nepokusil odstranit ty mrtvoly, zápach hniloby se stal urážlivým po celém Heian-kyo, a lidé se na ně nemohli ani podívat. Město bylo proniknuto vůní a hora mrtvol se nahromadila podél koryta řeky Kamo, dokud nebyly místa, kde koně a kočáry nemohly projít.“

-Kamo ne Chomei, z ‚Hojoki‘

V každém případě, jeho postřehy o přírodní katastrofy, která postihla lidi v Kjótské oblasti v pozdní-1100s sloužit jako důležitý úvod do dynamického období v Japonských dějinách, ve skutečnosti jedna z nejdůležitějších transformací. Před transformacemi spojenými s přechodem Heian-Kamakura byla japonská kultura v plenkách. Byla silně ovlivněna Čínou. Selektivní půjčky ano, ale stále ve stínu Číny z větší části. Japonci se dívali do Číny i po úpadku Tchangské Číny — současná Čína už nebyla přitažlivá, ale kultura předchozích desetiletí a staletí stále držela velký kulturní kapitál. Japonská kultura začala odchýlit se ve dvou specifických způsobů: zjednodušení architektury (na rozdíl od ultra-propracované Čínské styly) a rozvoj lidové literatury (z velké části dominují ženy).

dvorní šlechtici ztratili kontrolu nad zemí. V průběhu jedenáctého a dvanáctého století, vyvinul se systém klášterní vlády-císař by abdikoval — stát se mnichem, a vládnout nepřímo prostřednictvím dětských císařů. Tento systém byl víceméně udržován od doby vysídlení Fujiwary až do začátku období Kamakura (1185-1333). V polovině 12. století se klan Taira (také známý jako Heike) inspiroval v samém srdci japonské vlády. Vládli z Kjóta, oženili se s elitou a snažili se ovládnout vládu. To způsobilo značné podráždění u soudu. Go-Shirakawa (pravidlo: 1155-1158, klášterní pravidlo: 1158-1192) se snažil vytlačit Tairu z Kjóta a hledal pomoc Minamota. Klan Minamoto byl poražen Tairou v roce 1160 a jejich vůdci vyhnáni.

do roku 1180 dal vůdce Taira Kiyomori na trůn svého vnuka-císaře Antoku, dvouletého. To vyvolalo začátek toho, co se stalo známým jako válka Genpei. Podrobnosti o válce Genpei jsou příliš početné na to, aby se v tomto krátkém článku dostatečně pokryly, takže stručný popis bude muset udělat. Význam Genpei Války je, že to připravilo půdu pro Minamoto-Hojo vláda, která následovala stanovit nejprve shogunate v Japonské historii. Provinční válečníci se přestěhovali z periferního do centrálního. Japonští císaři z velké části zůstali jen o něco více než velekněží šintoismu (jak tomu bylo po většinu japonské historie, až na několik výjimek).